EMBER基因基础模型预印本发布
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EMBER基因基础模型预印本发布
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AI 综述
研究人员发布预印本,提出基因中心基础模型 EMBER,专门学习上下文特异的基因表示。据介绍者 eigenNick 称,该模型让基因表示同时捕捉分子功能与细胞上下文,再以组合方式复用来预测多基因扰动效应。 据其介绍,EMBER 的基因表示可搭配轻量探针,用于单基因敲除、双敲除遗传相互作用乃至药物扰动。该工作与 Jian Ma、Eric Xing 合作,在单细胞预训练和数据集整理上做了改进。上述预测能力来自介绍者的说法,预印本尚未经同行评审。
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最新进展11月3日 03:57
EMBER 基因中心基础模型发布,可预测多基因扰动与药物响应报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月3日
- Jian MaEMBER 基因中心基础模型发布,可预测多基因扰动与药物响应
Jian Ma 分享了 @eigenNick 介绍新工作 EMBER 的帖子和视频,并附上 bioRxiv 预印本。EMBER 是一个预训练的基因中心基础模型,专门学习上下文特异的基因表示;其核心思路是让基因表示同时捕捉分子功能和细胞上下文,再以组合方式复用来预测扰动效应、遗传相互作用和药物响应。据 @eigenNick 介绍,该工作与 @jmuiuc、@ericxing 合作,在单细胞预训练和数据集整理上做了改进,EMBER 的基因表示可搭配轻量探针用于单基因敲除、双敲除遗传相互作用乃至药物扰动。
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