EMBER 基因中心基础模型发布，可预测多基因扰动与药物响应

Jian Ma 分享了 @eigenNick 介绍新工作 EMBER 的帖子和视频，并附上 bioRxiv 预印本。EMBER 是一个预训练的基因中心基础模型，专门学习上下文特异的基因表示；其核心思路是让基因表示同时捕捉分子功能和细胞上下文，再以组合方式复用来预测扰动效应、遗传相互作用和药物响应。据 @eigenNick 介绍，该工作与 @jmuiuc、@ericxing 合作，在单细胞预训练和数据集整理上做了改进，EMBER 的基因表示可搭配轻量探针用于单基因敲除、双敲除遗传相互作用乃至药物扰动。