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生信分析流程与工作流引擎:Nextflow、Snakemake、标准化流程与可复现性。

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9月30日周三第 41–41 条
  1. 中国科学院遗传与发育生物学研究所72

    段力辉团队开发 OpenFISH 技术,实现空间组织原位转录与代谢联合分析

    中国科学院遗传与发育生物学研究所段力辉团队开发 OpenFISH,可在同一张组织切片上连续完成空间转录组与 MALDI-MSI 空间代谢组检测。该方法通过模块化探针设计和单轮基因编码将空间转录组成本降低约 95%,并借助导电玻片预处理与 MALDI-MSI 后组织成胶、透明化实现两模态兼容。

    推荐理由:该工作把成像空间转录组与 MALDI-MSI 代谢组放在同一张切片上,并给出约 95% 的转录组成本降幅,做空间多组学的人可关注其兼容方案。