AmpliconSuite 发布:面向肿瘤基因组局灶性扩增的端到端分析流程
AmpliconSuite 是一个从肿瘤全基因组测序数据分析局灶性扩增的工具包,可识别染色体外 DNA(ecDNA)、断裂-融合-桥(breakage–fusion–bridge)及其他扩增模式,其 ecContext 模块对 ecDNA 结构分类以理解形成机制。
推荐理由:该工具把肿瘤全基因组测序中的局灶性扩增分析整合为端到端流程,并在 72 个模型、175 个基因上做了 FISH 验证。
AmpliconSuite 是一个从肿瘤全基因组测序数据分析局灶性扩增的工具包,可识别染色体外 DNA(ecDNA)、断裂-融合-桥(breakage–fusion–bridge)及其他扩增模式,其 ecContext 模块对 ecDNA 结构分类以理解形成机制。
推荐理由:该工具把肿瘤全基因组测序中的局灶性扩增分析整合为端到端流程,并在 72 个模型、175 个基因上做了 FISH 验证。
阿里达摩院发布食管癌 AI 模型 DAMO EAGLE,尝试在不插管的情况下,从胸部平扫 CT 中识别早期食管癌和癌前病变。研究团队把内镜报告和增强 CT 上的病灶位置配对到平扫 CT 上训练模型;在机会性筛查场景下,模型对食管癌的敏感性为 90%,对癌前病变为 52.5%,真实场景特异性为 99.2%,在低剂量 CT 上性能未见下降。
推荐理由:在机会性筛查场景下,该模型对食管癌的敏感性达到90%,并给出了癌前病变与特异性的具体数字,可供关注影像 AI 早筛的读者对照。