克服环状偏好，研究揭示被忽略的线性 DNA 与 RNA 病毒圈

研究团队提出利用种内基因组末端保守性来判定病毒基因组完整性的方法，以绕开现有工具依赖环状 contig 造成的系统性偏差。将该方法应用于 metaVR 数据库后，他们找回并验证了 1,585 个保守的完整线性病毒基因组，使已确认的线性完整基因组数量增加 21 倍。结果覆盖 13 个病毒纲，包含此前未发现的完整单分体 RNA 基因组和多分体病毒的单个片段，以及分支较深的病毒暗物质。研究还把线性 DNA 病毒的已知物理边界扩展到 220 kb 的完整巨噬菌体，并区分出真正的完整基因组与高转录操纵子。生态分析显示，这些被重新判定为完整的线性病毒在特定生态系统中明显富集。