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Journal of Chemical Information and Modeling·· 4 小时前AI 评分62

AIMNet2-CPCM 用神经网络势能在溶液中计算配体构象张力

Efficient and Accurate Ligand Strain Calculations in Solution with the AIMNet2 Neural Network Potential

AI 导读

研究提出 AIMNet2-CPCM,一种在 CPCM 类导体连续介质溶剂中、以 B97-3c 能量和力训练的神经网络势能,用于计算配体结合构象的溶剂化构象张力。它同等处理中性分子与带电分子,批量 GPU 推理使整个筛选库的溶剂化全局最小搜索变得可行。在约 8K 个 PDB 配体上,溶剂化张力中位数为 4.0 kcal/mol,并随净电荷升高而增大,该趋势在净电荷 −2 以内较为确定;−3 和 −4 的多价阴离子占据高张力尾部,而连续介质溶剂化在此最不可靠,其数值仅作为上界报告。

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来源:Journal of Chemical Information and Modeling · doi.org