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Genome Medicine·· 11 小时前精选AI 评分67

AS-WGS 结合自适应采样实现儿童肿瘤快速全面分子分型

Accelerated and comprehensive pediatric cancer profiling using whole-genome sequencing with adaptive sampling

AI 导读

研究团队提出面向儿童肿瘤的标准化全基因组测序方案 AS-WGS,基于 Oxford Nanopore Technologies(ONT)的自适应采样,在单次检测中完成分子分型。他们设计了覆盖 380 个临床相关位点的 panel,对 36 份儿童肿瘤与对照样本测序,并开发开源流程 nf-core-oncoseq 支持测序过程中实时分析。

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来源:Genome Medicine · doi.org

推荐理由

在 36 份儿童肿瘤样本上,该工作把融合基因、小变异、拷贝数变异和甲基化分类整合进单次 AS-WGS 检测,并给出测序前 24 小时内的检出情况。