GATA 转录因子协调拟南芥根发育进程

研究利用单细胞分辨率的转录组与染色质可及性数据，重建拟南芥根基本组织的发育轨迹，解析从干细胞到早期分化的阶段性转录图景。结果显示，染色质可及性标记了关键发育调控因子的激活，而分生区后期一次由广泛染色质重塑支撑的转录开关，驱动细胞由分裂转向分化。作者借助机器学习整合转录组与染色质可及性轨迹，识别出 GATA 转录因子是该开关的核心协调者，并通过实验加以验证。研究进一步表明，GATA 转录因子位于一个反馈驱动的双稳态系统的临界点，整合生长素与细胞分裂素的输入，平衡增殖与分化，从而在组织和器官尺度上保证根发育的时间精度。