Genome Research·· 4 天前AI 评分34
泛基因组与转录组揭示髭蟾性二态婚刺种间变异的基因组基础
Pangenome and transcriptomics reveal the genomic basis associated with interspecific variation of sexually dimorphic nuptial spines in moustache toads
AI 导读
研究构建了6个拟髭蟾属(Leptobrachium)物种染色体水平组装而成的泛基因组,并结合跨物种转录组分析,解析雄性髭蟾上颌婚刺这一性二态性状的演化基因组基础。角蛋白基因扩张早于婚刺起源,可能为角质化皮肤创新提供遗传材料;近期复制的毛发角蛋白基因获得Hoxc13结合位点,启动子报告实验证实Hoxc13在髭蟾与拟髭蟾中均可激活这些基因,而hoxc13表达的差异可能更关键地决定复制基因是否被招募用于婚刺发育。转录组比较还显示,婚刺形成过程中角质细胞增殖分化及黑色素生成相关基因在上颌皮肤特异性表达。在婚刺次生丢失的腾冲拟髭蟾中,igfbp2 受正选择,为这一演化转变的候选基因。
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来源:Genome Research · doi.org