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空间虚拟细胞如何从加坐标走向虚拟组织
虚拟细胞的下一个门槛:知道自己“在哪”——空间虚拟细胞正在从“加坐标”走向“虚拟组织”
AI 导读
生信人梳理了空间虚拟细胞近两年的关键进展,认为空间正从虚拟细胞的附加维度变成检验其因果能力的关键约束。VirTues 用预训练骨干网络把异质抗体面板与成像平台的空间蛋白质组数据映射到统一的虚拟组织空间,支持零样本标记物注释,并在三阴性乳腺癌中导出预测抗PD-L1化疗免疫治疗响应与无病生存分层的空间生物标志物。Celcomen 用生成式图神经网络在空间转录组中解耦胞内与胞间基因调控,生成扰动后的空间反事实转录组,并在人胶质母细胞瘤、人胎脾与小鼠肺癌样本中验证可识别性。
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来源:公众号:生信人 · mp.weixin.qq.com
推荐理由
文章把 VirTues、Celcomen、CANVAS、OCellus 等近期工作串成一条线索,梳理空间信息如何从附加维度变成虚拟细胞的因果约束。