Cell Painting 结合组织透明化实现 3D 球状体单细胞形态分析

研究提出一种可扩展的方法，将 Cell Painting 适配到 3D 球状体：先用组织透明化让球状体变透明，再配合实时定位球状体的对焦流程，从而在完整球状体内部实现单细胞水平的 Cell Painting。作者用该方法分析了 52 个临床相关药物，发现单细胞指纹按生物学通路聚类，比压平的球状体整体视图更稳健地区分药物效应。值得注意的是，5-fluorouracil 与 olaparib 在 2D 单层细胞中几乎无法区分，在球状体中效应出现分化，这一结果随后由 DNA 损伤、细胞周期和基因表达实验佐证。