SHE 用蛋白组结构比对重建 1542 个真核物种的演化历史

研究团队发布真核生物结构历史（SHE），基于 1542 个真核物种蛋白组水平的全对全结构比较构建系统发育树，涵盖近 300 万亿次两两蛋白比对。该分析提出真核演化的二分模型：以细胞骨架结构为主的刚性 Strict Core，支撑以翻译机器为核心、更具可塑性的 Operational Engine。研究还发现鸟类和蚂蚁等谱系的结构演化加速与蛋白组扩张解耦。作者表示，蛋白组范围的结构保真度可用于未表征蛋白的功能注释，并为模式生物选择提供数据驱动的定量匹配框架，替代启发式选择。SHE 以交互式门户免费开放。