GenBank Release 274.0 发布：60.07 万亿碱基、66.8 亿条记录
NCBI 发布 GenBank Release 274.0，含 60.07 万亿碱基、6.68 亿条记录，传统记录 269,895,537 条。与 273.0 相隔 63 天，传统部分新增 1,148,082,415,974 碱基和 2,511,642 条序列记录，WGS 部分新增 4,158,499,198,911 碱基和 308,262,063 条记录。
#数据/资源
NCBI InsightsAI 评分2222 Bluesky：Cameron Thrash (@jcamthrash.bsky.social)AI 评分4242 NTDB：原核生物自然转化机器与调控基因的 curated 数据库
NTDB 是一个原核生物自然转化机器与调控基因的 curated 数据库，相关论文发表于 Nucleic Acids Research。自然转化由专门的机器与调控基因控制，驱动原核生物的进化与适应。
Nucleic Acids ResearchAI 评分6060 HRD 数据库发布 1.0 版，整合人类生殖与发育多组学资源
人类生殖与发育数据库 HRD 发布 1.0 版，整合了生殖、妊娠和发育相关的公开多组学数据。该版本收录 814 条组学记录，包括 432 条 bulk 转录组、144 条单细胞或单核转录组、156 条表观基因组、52 条代谢组和 30 条蛋白质组记录，另有 702 条临床试验记录、293 条暴露与结局关联和 779 个先证 SNP 及其表型关联。
Nucleic Acids ResearchAI 评分5858 PAZy 数据库扩展至 450 多个经实验验证的塑料活性酶并开放 REST API
PAZy 塑料活性酶数据库发布扩展版本，收录超过 450 个经实验验证能作用于合成或生物基塑料的酶，并补充更详细的元数据与更广的底物覆盖。新版改为关系型数据库，引入大语言模型辅助整理活性数据，网页界面支持按蛋白或塑料底物浏览，并提供公开 REST API 供程序化调用。该资源用于区分实验验证的塑料活性酶与仅计算预测的候选，可免费访问 https://www.pazy.eu。
Nucleic Acids ResearchAI 评分6262 EvoNiche 数据库发布，整合 91 套空间与单细胞转录组数据解析肿瘤生态位
EvoNiche 数据库发布，整合 91 套配对的空间与单细胞转录组数据集，覆盖 35 种癌症类型。数据库包含 712 张组织切片、1 953 708 个空间 spot 和 58 个单细胞数据集共 2 945 536 个细胞，识别出 5609 个空间生态位，并重建组织水平和细胞水平的时空轨迹。
Nucleic Acids ResearchAI 评分5858 NTDB 数据库发布，收录原核生物天然转化机器与调控基因
上海交通大学团队发布天然转化数据库 NTDB（https://bioinfo-mml.sjtu.edu.cn/NTDB/），整合文献挖掘得到的 118 个天然可转化物种、1072 个转化相关基因和 10 个 DNA 摄取基序的实验验证数据。
Nucleic Acids ResearchAI 评分5252 ImmunEscpMap 发布以基因为中心的肿瘤与病毒感染免疫逃逸知识库
ImmunEscpMap 是一个以基因为中心的知识库，把肿瘤与病毒感染中的免疫逃逸证据放进统一框架。
Nature CommunicationsAI 评分5858 DNA-SaM 编解码系统提升 DNA 数据存储可扩展性
研究提出 DNA-SaM 系统，整合高效编码、严格的生化约束检查和两级索引的存储单元分布架构，用于可扩展的 DNA 数据存储。计算分析显示其编码时间复杂度为线性，编码时间较代表性方法明显缩短，并主动排除同聚物重复、串联重复和潜在启动子基序等可能干扰下游生化过程的序列。该系统在体外和体内实际存储中均取得 100% 成功率，按其编码方案与序列设计空间理论上可存储超过 2^70 PB 数据。
公众号：动脉网AI 评分5858 粒曼生物完成数千万元天使轮融资，布局虚拟细胞扰动数据基础设施
粒曼生物于2026年10月完成数千万元天使轮融资，由上海弘晖领投，兴华鼎立和杭州润苗基金跟投，川越周期担任财务顾问。公司专注高通量细胞编辑与扰动样本数据生产，已完成覆盖人类19,883个基因的阵列式扰动文库建设与湿实验验证。
科学网AI 评分2222 主编曾大军：DRA 不是“又一本数据期刊”
中国科学院自动化研究所主办的英文新刊 Data Research and Applications（DRA）将于 2026 年底正式出版创刊号，主编曾大军称其定位是让数据与模型以独立、可引用、可评价的学术体裁进入学术秩序。
allen instituteAI 评分5555 Allen Institute 发布开放数据集，用 1000 多个 PyTorch 神经元模型拟合真实小鼠和人类细胞
Allen Institute 发布一个开放数据集，将 1000 多个可直接用于 PyTorch 的神经元模型拟合到真实的小鼠和人类细胞上。帖子指出，AI 神经元依赖简单的数学运算，而真实神经元要复杂得多；类脑的多样性是否能让 AI 更好仍是开放问题，但这一数据集让该问题变得可测试。
NCBI Insights精选AI 评分8080 NCBI 推出 RNA-Seq Gene Feature Counts 数据资源
NCBI 发布面向全部公开人类和小鼠 SRA 数据的 RNA-Seq Gene Feature Counts，通过 AWS Registry of Open Data 免费开放。
推荐理由：公共 SRA 的人和小鼠 RNA-Seq 数据有了统一流程算出的基因特征计数，做大规模表达分析前可先据此筛选。
Cell精选AI 评分7878 慢性运动多组学图谱覆盖 22 种组织
研究团队构建了慢性运动的 22 种组织多组学图谱，刻画了随组织、性别和时间变化的分子适应，以及骨骼肌中细胞类型特异的表观遗传重塑。图谱显示转录组、表观遗传、蛋白质组和代谢层面在全身范围内协同重塑。
推荐理由：该图谱覆盖 22 种组织，呈现运动适应在组织、性别和时间维度上的差异，为研究跨组织分子调控提供参照。
Cell精选AI 评分8282 研究基于 467,152 份 UK Biobank 基因组构建全表型结构变异图谱
研究利用 467,152 份 UK Biobank 基因组构建了全表型结构变异图谱，显示大于 50 bp 的结构变异是人类疾病风险中重要且此前被低估的来源。该资源揭示了与疾病相关的罕见结构变异和调控性结构变异，为理解人类生物学和药物研发提供线索。
推荐理由：基于近 50 万份 UK Biobank 基因组构建的结构变异图谱，把大于 50 bp 的变异与疾病风险系统关联起来，可作为结构变异研究的参考资源。
Google Research BlogAI 评分4848 Google Earth AI 地理空间推理智能体：新基准与早期访问扩展
Google 为 Earth AI 的地理空间推理智能体发布技术报告，在 CBGB、UnivEARTH 及自研的 GeoExpertQueries、GeoKTools 四个基准上评测，量化专用工具与前置规划相对通用 LLM 的价值。
Cell Reports MethodsAI 评分6262 Yeung 等发布 1000 多个可微分生物来源单神经元模型数据集
Yeung 等发布了一个包含 1000 多个可微分单神经元模型的数据集，这些模型拟合自小鼠和人类记录，可直接嵌入基于梯度的网络架构。作者指出，用生物真实的神经元构建人工网络此前受限于缺少既拟合数据又可训练的神经元模型。
Nature Methods精选AI 评分8080 MassNet 发布 15 亿张质谱图的 AI-ready 语料库并配套 MSDT 格式
MassNet 发布面向 AI 的质谱蛋白质组学数据语料库，包含来自 35 个物种、高质量 DDA 质谱数据的 15 亿张串联质谱图，其中约 170 万个肽前体来自人类样本。
推荐理由：该语料库覆盖 35 个物种的 15 亿张质谱图，并配套标准化存储格式，为质谱蛋白质组学的深度学习提供了可复用的数据底座。
Bluesky：Matt Olm (@mattolm.bsky.social)AI 评分6767 Microbiome Repo 发布公开人类肠道宏基因组目录，收录超 50 万样本
Microbiome Repo 发布，收录了所有公开的人类肠道宏基因组，样本量超过 50 万，元数据直接从序列档案、论文和补充材料中提取。该目录同时提供公开 shotgun 宏基因组研究注册表，以及覆盖各年龄段、逐样本带元数据且标注证据来源的肠道宏基因组目录，作者邀请已发表相关研究的研究者检索自己的研究是否被收录并反馈。
Bioinformatics AdvancesAI 评分4747 1100 个用于细胞过程动态建模的合成基准问题
研究构建了 1100 个合成建模问题，基于 22 个已发表建模问题的常微分方程组与实验设计生成，并扩展了近期一种针对随机观测函数的时间序列数据模拟方法，使其覆盖多种实验条件下的真实测量模式。对数据与模型特征、优化性能和参数可识别性的分析显示，该合成问题集在真实性和多样性上扩展了现有问题空间。基准问题与算法已公开。
Ensembl Blog精选AI 评分7272 Ensembl 上线全基因组 Cactus 比对集中仓库
Ensembl 建立全基因组 Cactus 比对集中仓库，在 https://ftp.ensembl.org/pub/misc/compara/multi/hal_files/ 提供鸟类、哺乳动物、昆虫、甲壳类、线虫、禾谷类、鱼类和 SARS-CoV-2 等类群的比对文件与元数据。
推荐理由：Ensembl 把多类群全基因组 Cactus 比对集中到统一 FTP 目录，做比较基因组和共线性分析的读者可据此直接取用。
Bluesky：Loïc A. Royer 💻🔬🧪 (@loicaroyer.bsky.social)精选AI 评分8282 Biohub、美国能源部与 NIH 宣布 18 亿美元虚拟生物学计划
Biohub、美国能源部与 NIH 宣布投入 18 亿美元启动 Virtual Biology Initiative，用于生成开放、标准化的数据，训练预测细胞如何响应疾病与干预的 AI 模型。该计划定位为跨部门国际合作，目标是构建面向 AI 模型的基础数据。Loïc A. Royer 在 Bluesky 转述了这一消息并附上 biohub.org 的新闻链接。
推荐理由：这项近 20 亿美元的多机构投入指向开放标准化的细胞响应数据，为训练虚拟细胞类模型提供数据基础。
Biohub精选AI 评分8888 Biohub 联合 DOE、NIH 与产业伙伴投入 18 亿美元扩展虚拟生物学计划
Biohub 与美国能源部、NIH 及新资助伙伴宣布扩展虚拟生物学计划（Virtual Biology Initiative），合计投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术。
推荐理由：这项跨机构投入给出了资金分配与数据标准化分工，可看清虚拟细胞所需开放数据从哪来、由谁整合。
Bluesky：EMBL-EBI (@ebi.embl.org)精选AI 评分6060 EMBL-EBI 获欧盟 5700 万欧元支持 GENCODE、UniProt 与 Europe PMC
EMBL-EBI 表示，欧盟委员会提供的 5700 万欧元将用于支持 GENCODE、UniProt 和 Europe PMC 等开放数据资源。该机构称开放数据资源对现代生物学和加速 AI 创新不可或缺，更多细节见其官网新闻页。
推荐理由：欧盟 5700 万欧元投入 GENCODE、UniProt 与 Europe PMC，可了解公共生物数据基础设施的资金来源与覆盖范围。
EMBL News精选AI 评分6060 欧盟委员会向 GENCODE、UniProt 和 Europe PMC 拨款 5700 万欧元
欧盟委员会宣布通过 Horizon Europe 的三项资助，向 EMBL-EBI 与国际伙伴共同管理的 GENCODE、UniProt 和 Europe PMC 提供 5700 万欧元。
推荐理由：欧盟委员会通过 Horizon Europe 向 EMBL-EBI 管理的三个开放数据资源拨款，可了解各资源的具体分配额度。
Arc Institute精选AI 评分7878 Arc Institute 为 2026 虚拟细胞挑战赛生成跨六种细胞系的 Perturb-seq 数据
Arc Institute 为 2026 虚拟细胞挑战赛生成了覆盖六种细胞系的 Perturb-seq 数据，任务从去年的同细胞系少样本预测升级为跨细胞系的零样本预测。
推荐理由：Arc 披露 2026 虚拟细胞挑战赛数据集的生成与质控细节，可了解跨细胞系 Perturb-seq 数据如何做到一致可比。
Genomics, Proteomics & BioinformaticsAI 评分5252 MTB-KB 发布结核分枝杆菌研究文献整理知识库
MTB-KB 是一个文献整理型知识库，系统整合结核研究八个主要方向的高影响力发现，当前版本收录来自 1246 篇文献的 75,170 条关联，覆盖 18,439 个经权威数据库和 WHO 认可分类标准化的实体。
PatternsAI 评分3434 基于 Benford 定律的科学数据异常检测贝叶斯框架
基于模拟的 Benfordness 估计（SBBE）量化数据集符合 Benford 定律的程度，并提供不确定性估计，使不同规模数据集之间可作有意义的比较。将该方法用于生物活性数据时，SBBE 可按数据整理质量对数据库排序，并标记出异常子集，供针对性专家复核优先处理。
Bluesky：EMBL-EBI (@ebi.embl.org)AI 评分1515 EMBL-EBI 问答：UniProt 团队生物审编 Emily Bowler-Barnett 谈生物审编工作
EMBL-EBI 以问答形式介绍 UniProt 团队生物审编 Emily Bowler-Barnett 的工作，说明生物审编为何对开放科学至关重要，以及 AI 正在如何改变这一领域。文中将 UniProt 称为全球领先的蛋白序列数据资源，并引述其说法：没有 UniProt 的生活如同没有搜索引擎。
NCBI InsightsAI 评分6060 NLM 推出 Linked Discoveries 试点，可从 PubMed 引文探索相关文献网络
美国国家医学图书馆（NLM）发布实验性试点资源 Linked Discoveries，可从一条 PubMed 引文出发，映射最多 200 篇最相近的相关文章。该工具分析 PubMed 引文的标题、摘要和关键词，把超过 2900 万条引文与 NCBI 各数据库的相关资源连接起来，支持按疾病、基因、化学物质过滤，并可用“any”（OR）与“all”（AND）逻辑组合。
Bluesky：Martin Steinegger 🇺🇦 (@martinsteinegger.bsky.social)精选AI 评分8080 AlphaFold Database 扩展至疫情准备，预测 2812 个病毒蛋白组的约 170 万个二聚体
AlphaFold Database 正与 NVIDIA、DeepMind、EBI 等合作扩展至疫情准备方向，对 2,812 个病毒蛋白组中的约 170 万个同源与异源二聚体做了穷举预测，其中 8,028 个为高置信度预测。相关结果发布在 research.nvidia.com/labs/dbr/ass...，并可在 alphafold.ebi.ac.uk 查看。
推荐理由：AlphaFold Database 把病毒蛋白互作预测扩展到 2,812 个病毒蛋白组，可了解结构预测在疫情准备中的覆盖范围。
Stephen Quake精选AI 评分7878 Tabula Sapiens 2.0 在 Cell 上线，细胞数扩至逾 110 万
Tabula Sapiens 2.0 在 Cell 上线，数据集规模翻倍至 28 个组织、逾 110 万个细胞。作者团队还绘制了人类转录因子的表达，并分析了细胞衰老程序，图谱开放获取。
推荐理由：Tabula Sapiens 2.0 把细胞数扩到 110 万并新增转录因子表达与衰老程序分析，做单细胞图谱比较的读者可据此了解数据规模变化。
GigaScienceAI 评分5858 ICTV 病毒分类法通过公共本体 API 开放程序化访问
研究团队将 ICTV 的 MSL1 至 MSL41 全部 Master Species List 版本转换为统一的本体，包含超过 195,000 个当前与历史实体，并通过 Ontology Lookup Service 部署为公共 API。
Manolis Kellis精选AI 评分8585 跨物种单细胞图谱绘制人脑纹状体，定位精神疾病遗传风险细胞类型
研究团队发布人脑纹状体跨物种单细胞图谱，覆盖 109 个样本、69 名供体、67 万个细胞核，鉴定出 31 个神经元亚群，其中包括 9 类中型多棘神经元（MSN）。
推荐理由：这份跨物种纹状体图谱把 124 项 GWAS 的遗传风险定位到特定神经元亚群，并显示小鼠与人存在分区差异。
Patrick SchwabAI 评分2222 Patrick Schwab 称数据质量比数据量更关键
Patrick Schwab 认为，领域不应再追逐数据集规模这一误区，能可靠回答机制问题的高质量数据才是理解疾病的稀缺资源，少量基于少假设的干净实验结果，其因果信息量可超过数 TB 的关联数据。
Biohub精选AI 评分8585 Biohub 与 UC Berkeley 用激光相位板提升冷冻电镜成像对比度
Biohub 与 UC Berkeley 团队在三篇论文中报告，激光相位板在单激光和双激光（xLPP）两种配置下都能显著提升冷冻电镜图像对比度。单激光版本使分辨率最多提升 44%，双激光版本将铁蛋白 apoferritin 成像到 1.8 埃，并提升了冷冻 E. coli 的对比度。
推荐理由：三篇论文报告激光相位板在真实冷冻电镜中提升小蛋白成像对比度，为在完整细胞内看清蛋白提供新手段。
Biohub精选AI 评分7474 Biohub 与 UC Berkeley 实现激光相位板，提升冷冻电镜对小蛋白的成像对比度
Biohub 与 UC Berkeley 团队将激光相位板集成到 Thermo Scientific Krios 冷冻电镜中，显著提升小蛋白成像对比度，相关成果分别发表于 Science 和 bioRxiv。
推荐理由：激光相位板把冷冻电镜的对比度提升到能看清小蛋白，为结构生物学长期难以成像的多数蛋白打开入口。