BioSIFTR：用生物群系特异基因组目录从浅层鸟枪法测序推断功能

BioSIFTR 通过将浅层鸟枪法测序的读段比对结果外推到 15 个 MGnify 生物群系特异目录中预先计算好的泛基因组功能，实现微生物组功能推断。作者在合成菌群以及红原鸡、小鼠和人三种肠道微生物组上，用匹配的深度鸟枪法测序和 16S rRNA 宏条形码数据做基准评测，表现优于同类方法。作者指出，进一步验证仍需匹配的基准数据集，目前该方法已在肠道微生物组中得到验证。