Genome Biology·· 3 天前AI 评分58
Amira 直接从长读段检测单拷贝与多拷贝耐药基因
Amira: detection of single and multi-copy antimicrobial resistance genes directly from long reads using gene-space de Bruijn graphs
AI 导读
Amira 通过构建基因空间 de Bruijn 图，直接从长读段中检测抗菌药物耐药（AMR）基因，把读段精确对应到不同的 AMR 基因拷贝，并据此完成组装。作者称，在模拟数据、精选样本和公开数据集上，Amira 相比现有方法提升了拷贝数召回率和核苷酸准确度。
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来源：Genome Biology · doi.org