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Phys.org·· 4 小时前AI 评分35

单拷贝基因可作为标记区分同科细菌,研究以 87 种弧菌比较 16S rDNA 分辨率

Single-copy genes can be used as markers to distinguish between bacteria in the same family

AI 导读

一项发表于 Molecular Phylogenetics and Evolution 的研究表明,单拷贝基因可作为标记区分同科细菌,并用于弧菌属物种鉴定。研究者对 87 种弧菌的 16S rDNA 与传统标记及单拷贝基因序列做生物信息学分析并重建进化历史,发现 16S rDNA 不能代表弧菌属的进化历史,与单拷贝基因给出的进化历史不一致。由于每个细菌只含一个拷贝,单拷贝基因便于估算样本中各物种的丰度,且在近缘物种间差异更大、分辨率更高。研究团队据此提出了一批可用于微生物群落组成进化研究的候选基因,下一步需通过实验验证其能否用于分析样本中弧菌的组成;该分析思路也可推广到其他类型细菌。

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来源:Phys.org · phys.org