Ming "Tommy" Tang· tangming2005·· 4 小时前AI 评分38
人类基因组参考版本选择:GRCh38 用 no_alt_analysis_set
You haven't started your DNA-seq analysis and you've already hit a wall: which human genome?
AI 导读
Ming "Tommy" Tang 指出,DNA-seq 分析一开始就要面对"用哪个人类基因组"的问题,"直接用 hg38"并不够:GRCh38 应使用 no_alt_analysis_set,GRCh37 应使用 hs37d5,因为 ALT contig、重复的 PAR 区域和异常的染色体命名会悄悄破坏流程。
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来源:Ming "Tommy" Tang · x.com