PED 2027 发布：整合实验与预测的蛋白质构象集合
PED in 2027: integrating experimental and predicted protein conformational ensembles at scale
蛋白质构象集合数据库 PED 发布 2027 版本（2026 年 9 月上线），在原有实验解析的构象集合之外，整合了明确标注来源的计算预测集合。新版本包含面向 3319 个 DisProt 蛋白和 2452 个人工整理无序区的多方法集合，以及覆盖 10 022 个含 IDR 人类蛋白的 AlphaFlex 集合；同一序列的不同预测作为独立记录保留，并标注各自方法来源，便于跨方法比较。数据库提供可扩展的提交流程，兼顾单项实验研究与蛋白质组规模集合，并保留质量控制和策展审核；受控词表统一描述实验数据获取、计算生成、筛选与精修。
来源：Nucleic Acids Research · doi.org
数据库把实验解析与计算预测的构象集合分开标注并保留方法来源，便于比较不同生成方式得到的构象集合。
蛋白质集合数据库（PED；https://proteinensemble.org）是固有无序蛋白（IDP）和固有无序区域（IDR）结构集合的主要存储资源。PED 2027（于2026年9月发布）通过整合由实验数据确定或精修的集合与明确标识的计算预测集合，大幅扩展了其范围。该版本引入了一个多方法集合，针对3319个DisProt蛋白和2452个人工审编的无序区域，以及针对10 022个含IDR的人类蛋白的AlphaFlex集合。同一序列的替代预测作为独立记录保留，并带有方法特异性来源信息，从而支持跨集合生成方法的比较。可扩展的存储工作流程可容纳单项实验研究和蛋白质组规模集合，同时保留质量控制和审编人员监督。PED受控词汇表标准化了实验数据获取、计算生成、选择和精修。预计算的IDPEnsembleTools和CIDER分析直接在集合页面上提供结构和序列衍生描述符。重新设计的界面和扩展的REST API支持发现、可视化、下载和程序化访问。与UniProt、DisProt、MobiDB和实验数据存储库的互操作性将集合与序列、注释和支持性测量数据连接起来。因此，PED 2027为研究IDP/IDR构象行为提供了一个可互操作、可直接用于分析的平台。