Journal of Chemical Information and Modeling·· 4 天前AI 评分29
Ga3+ 替换 Fe3+ 的“特洛伊木马”抗菌策略:细菌过氧化氢酶-过氧化物酶 KatG 中替换过程的建模
Ga3+ Replacing of Fe3+ as a “Trojan Horse” Antimicrobial Strategy: Modeling the Process within Bacterial Catalase–Peroxidase KatG
AI 导读
研究用分子动力学模拟、炼金术自由能计算与 QM/MM 方法,在原子层面刻画了细菌过氧化氢酶-过氧化物酶 KatG 活性位点中 Ga3+ 替换 Fe3+ 的过程。模拟显示 heme B 辅因子的轴向配位环境在金属替换后基本保持,远端配体在组氨酸与配位水分子之间动态切换。自由能计算表明该替换在热力学上有利,为铁模拟抗菌剂的理性设计提供了机制依据。
阅读原文
来源:Journal of Chemical Information and Modeling · doi.org