纳米孔测序揭示昆虫特异性甲病毒EILV产生大量缺陷病毒基因组

利用Nanopore直接RNA测序（DRS），在蚊虫特异性甲病毒Eilat virus（EILV）中发现了远超同类虫媒病毒的大量缺失型缺陷病毒基因组（DVG）。这些DVG保留完整的末端序列和保守的连接基序；改进的DRS方法显示EILV基因组RNA合成过程中普遍存在提前终止，将DVG的形成与复制酶持续合成能力下降联系起来。部分DVG可被选择性复制和包装，在连续传代中积累并干扰亲本病毒复制。研究提示EILV具有内在的高DVG生成能力，低持续性的RNA合成与基因组可塑性增强相关联，高DVG产量可能是昆虫特异性RNA病毒的一种适应性机制。