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Nature Biotechnology 提出 DynaVelo:联合单细胞 RNA 与染色质数据建模并预测 B 细胞基因扰动
DynaVelo:从单细胞多组学动力模型到基因扰动预测
AI 导读
Nature Biotechnology 的一项研究提出 DynaVelo,将同一细胞的 RNA 表达与染色质开放信息联合建模,学习细胞状态变化方向、生成轨迹、推断动态调控关系,并在模型中模拟基因缺失与救援。作者用 7,166 个野生型小鼠生发中心 B 细胞检验速率场能否恢复已知分岔与回流,再用于 Arid1a 杂合缺失的 6,716 个细胞和 Ctcf 杂合缺失的 4,688 个细胞,发现 CC 返回暗区的路线消失或减弱,前记忆 B 细胞占比从野生型的 5.42% 升至 20.09% 和 25.45%。
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来源:公众号:单细胞天地 · mp.weixin.qq.com
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