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iMeta | 韩威/陈迪俊等整合基因组学与调控组学解析家鸡复杂性状遗传调控机制
iMeta | 韩威/陈迪俊等: 解析家鸡复杂性状遗传调控机制
AI 导读
江苏省家禽科学研究所韩威、南京大学陈迪俊、浙江省农业科学院卢立志等整合44个家鸡品种(系)2,913个个体的全基因组重测序数据与443个个体20项屠宰相关性状,构建了约4,800万个高置信度SNP的家鸡基因组变异资源库,并开发整合加权调控网络分析(iWRNA)框架,将GWAS信号与多组织转录组和染色质可及性数据结合。群体遗传分析揭示中国地方鸡种呈现南北遗传分化,并鉴定出与驯化及环境适应相关的选择信号;GWAS获得3,177个“性状–SNP”关联。以肝脏重量为例,相关位点富集于肝脏代谢调控网络,提示增强子可能通过影响基因表达参与性状调控。
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来源:公众号:生信宝典 · mp.weixin.qq.com