Nature Communications·· 9 小时前精选AI 评分65
人类神经干细胞中大规模鉴定SNP调控潜力
Large-scale identification of the regulatory potential of SNPs in human neural stem cells
AI 导读
研究者在人类神经干细胞中用大规模并行报告基因实验SuRE评估了710万个SNP的转录调控潜力,在484,057个表达足够高的SNP中鉴定出7,002个具有调控潜力的SNP(emVars)。这些emVars富集于增强子,并常与ZBTB33、YY1和ETS等转录因子的结合位点重合。将SuRE数据与eQTL数据叠加可定位可能的基因调控变异;与7种神经精神表型的GWAS结合,在包含183,186个受SuRE评估SNP的风险位点中鉴定出187个emVars。作者认为该SuRE数据集可用于优先排序与复杂人类表型相关的遗传变异。
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来源:Nature Communications · doi.org
推荐理由
在人类神经干细胞中用大规模报告基因实验评估710万个SNP的调控潜力,为区分连锁区域中的因果变异提供数据资源。