DiseaseCIO 多组学数据库发布，整合 94 种疾病的干预结局数据
DiseaseCIO: a multi-omics atlas for characterizing clinical intervention outcomes across diverse diseases
DiseaseCIO 是一个将微生物组、转录组和表观组数据与人类疾病干预结局整合的多组学数据库，用于在患者个体层面刻画与干预结局相关的分子特征。该数据库收录来自 94 种疾病状态的 42 798 份治疗前样本，覆盖 510 种治疗方案，涉及 377 种药物与非药物干预；样本包含四种标本类型，采集自八个采样部位。研究团队用定制的 iMOD 流程处理多组学数据，生成 20 类分子特征，并识别出超过 184 万条候选特征与结局关联。数据库还提供差异分析、预后评估、跨组学相关分析、跨队列整合分析，以及针对用户提交特征集的富集分析和特征构建等交互工具，供探索干预结局异质性并筛选候选多组学标志物。
来源：Nucleic Acids Research · doi.org
该数据库把微生物组、转录组和表观组数据与干预结局配对，为跨疾病寻找治疗反应标志物提供统一入口。
患者间临床干预结局的异质性是精准医学的一大障碍。整合多维高通量组学有助于揭示临床干预差异的分子基础，并为结局预测、预后分层、调控模式及耐药机制提供洞见。我们推出 DiseaseCIO（Disease Clinical Intervention Outcomes，http://db.edbc.org/DiseaseCIO/），这是一个将微生物组、转录组和表观基因组数据与人类疾病干预结局相整合的数据库。它旨在刻画个体患者层面与疾病干预结局相关的分子图景。DiseaseCIO 涵盖来自 94 种疾病状态的 42 798 份治疗前样本，覆盖 510 种治疗方案，涉及 377 种药物与非药物干预。这些样本包括从八个采样部位采集的四种标本类型。利用定制的 iMOD 多组学数据处理流程，我们生成了 20 类分子特征，并鉴定出 >184 万条候选特征–结局关联。DiseaseCIO 还提供交互式工具，用于多维特征的差异分析、预后评估、跨组学相关分析和跨队列整合分析，以及针对用户提交特征集的富集分析和特征构建。DiseaseCIO 为探索跨疾病的干预结局异质性、鉴定与治疗反应和预后相关的候选多组学生物标志物提供了分子层面的资源。