scMRdb 发布：细胞类型分辨的复杂性状孟德尔随机化资源库
scMRdb: a comprehensive resource for cell-type-resolved Mendelian randomization of complex traits
scMRdb 是一个面向人类复杂性状与疾病的细胞类型分辨孟德尔随机化资源库，整合了 5206 套欧洲与东亚人群 GWAS 汇总统计和 585 个 sc-eQTL 数据集，覆盖 11 种组织与细胞体系、110 种细胞类型。研究团队用统一流程对所有基因–性状对做 MR 分析并配合 Steiger 方向性检验，对显著关联再做共定位评估，结果按六个置信层级分层，并整合药物靶点注释。
来源：Nucleic Acids Research · doi.org
该资源把单细胞 eQTL 与大规模 GWAS 统一到同一套 MR 流程，便于按细胞类型检索候选因果基因。
孟德尔随机化（MR）是一种强大的分析方法，利用遗传变异作为工具变量来推断基因表达与人类疾病之间可能的因果联系，从而减轻混杂因素和反向因果的影响。然而，现有的MR资源主要依赖于批量组织表达数量性状位点（eQTL），这类数据通过在细胞群体间平均表达量，掩盖了细胞类型特异性的转录效应。此外，来自单细胞eQTL（sc-eQTL）MR分析的细胞类型分辨因果证据仍分散于各项独立研究中，工作流程不一致，阻碍了标准化的跨细胞类型比较。在此，我们推出scMRdb（https://ngdc.cncb.ac.cn/scmrdb），一个面向人类复杂性状与疾病的细胞类型分辨MR综合资源。scMRdb整合了5206项欧洲和东亚血统的全基因组关联研究（GWAS）汇总统计量，与涵盖11种组织和细胞系统（包括110种细胞类型）的585个sc-eQTL数据集。统一的流程通过MR对所有基因–性状对进行评估，随后进行Steiger方向性检验。显著关联通过共定位进行评估，结果被分层为六个置信等级，并整合了药物–靶点注释。scMRdb能够系统性地找回由细胞类型分辨调控证据支持的候选因果基因，而这些证据在批量组织分析中往往被稀释或掩盖。我们期望scMRdb成为一个用户友好的门户，用于生成细胞类型信息驱动的机制假说，并为人类复杂疾病优先筛选可操作的治疗靶点。