InterPro 发布 110.0 版本，新增深度学习方法 InterPro-N 与 InterProScan 6
InterPro: the protein sequence classification resource in 2027
蛋白质序列分类资源 InterPro 发布 110.0 版本，新增深度学习方法 InterPro-N，将 UniProtKB 的序列覆盖度提升到 90% 以上。InterPro 整合多个成员数据库的预测模型（signature），把序列归入蛋白家族并预测结构域和功能位点，注释覆盖数亿条序列，并可映射到 Gene Ontology、PDBe 和 AlphaFold 蛋白结构数据库。
来源：Nucleic Acids Research · doi.org
InterPro 110.0 用深度学习把 UniProtKB 覆盖度推到 90% 以上，并给出 InterProScan 6 与 MCP 服务的迁移信息。
InterPro（https://www.ebi.ac.uk/interpro）是一个可免费访问的蛋白质序列分类资源。它整合了来自多个成员数据库的预测模型（称为签名），用于将序列分类到家族中，并预测结构域和功能重要位点的存在。InterPro 数据库为数亿条序列提供注释，确保对蛋白质序列标准库 UniProtKB 的广泛覆盖，并包含与其他多个主要资源的映射，如 Gene Ontology、欧洲蛋白质数据库（PDBe）和 AlphaFold 蛋白质结构数据库。在本出版物中，我们报告 InterPro（版本 110.0）的现状，详述数据库、其相关网页界面和软件的新进展。值得注意的更新包括 InterPro-N，一种深度学习方法，将 UniProtKB 的序列覆盖度提高到 90% 以上；从 InterProScan 5 过渡到完全重新设计的 InterProScan 6；整合基于结构域的分类和来自 AlphaFold 的预测结构；重新设计的蛋白质查看器提供简洁的摘要视图；以及一个新的模型上下文协议（MCP）服务器，允许 AI 助手以编程方式查询 InterPro。在过去两年中，共创建了 9484 个新的 InterPro 条目，使总数达到 54 922 个。InterPro 数据、软件和工具均可免费获取。