生信日报 · 2026 年 11 月 2 日 · 星期一
BIOINFOSOUL
Nature：靶向ZMYND8解除IL-2信号抑制，逆转CD8+ T细胞耗竭
美国圣犹大儿童研究医院Hongbo Chi团队在Nature发表论文，通过体内单细胞CRISPR筛选发现染色质阅读器ZMYND8是压制IL-2R至STAT5信号、驱动CD8+ T细胞终末耗竭的表观遗传制动因子，靶向它可促进效应样尤其是TexKLR细胞积累。研究在慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型中对91种表观遗传因子与9种转录因子开展筛选，共构建330条gRNA文库；ZMYND8缺失使中间态与TexKLR细胞选择性积累、终末耗竭细胞减少，体外与体内杀伤能力增强，慢性感染小鼠病毒负荷下降，与IL-2治疗联用时病毒负荷低于任何单药。
公众号：BioArt原文 方法与工具
公众号：BioArt秦为/陈影团队开发 Hi-APEX，实现无需外加过氧化氢的 APEX2 活体空间多组学
清华大学药学院秦为课题组与中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所陈影课题组等合作，在 Nature Chemical Biology 发表研究，开发出无需外加过氧化氢的邻近标记方法 Hi-APEX，并在活体小鼠中完成标记。该方法用带四嗪基团的苯酚探针 TP 作为底物，由 APEX2 催化实现邻近标记，再通过四嗪与反式环辛烯修饰生物素的生物正交点击反应接上标签，用于蛋白质与 RNA 的空间组学分析。
研究发现
公众号：iNatureNature：中性粒细胞异常剪接产生的新抗原被T、B细胞识别，提出红斑狼疮抗原新假说
华盛顿大学Tomas Mustelin团队2026年10月28日在Nature在线发表研究，提出系统性红斑狼疮（SLE）的自身抗原可能来自中性粒细胞异常mRNA剪接产生的新肽。研究者用自研RiboSplitter流程扫描SLE患者中性粒细胞的可变剪接，在5697个蛋白编码基因中找到6.5万多起替代剪接事件，其中356个基因、521起事件与健康人显著不同。
医药产业
公众号：药明康德礼来 retatrutide 3 期达标，罗氏 sefaxersen 与 Alnylam brezosiran 公布临床数据
药明康德汇总近期多肽与寡核苷酸（TIDES）领域的多项临床进展。礼来公布三重受体激动剂 retatrutide 治疗成人 2 型糖尿病的 3 期 TRANSCEND-T2D-2 顶线结果，研究纳入 1298 例患者，第 80 周 retatrutide 9 mg 和 12 mg 组 HbA1c 均下降 2.2 个百分点，活性对照司美格鲁肽组下降 1.8 个百分点，体重分别下降 19.5% 和 20.9%，对照组下降 9.4%。
GENESGCT 数据与 FDA 草案指南推动基因编辑股上涨
受欧洲基因与细胞治疗学会（ESGCT）第 33 届年会数据和 FDA 10 月 27 日发布的个性化人类基因组编辑产品 BLA 提交与上市后管理草案指南（FDA-2026-D-11783）推动，基因编辑疗法公司股价上周多数两位数上涨。草案引入 Individualized Feature Space（IFS）概念，界定单个 BLA 内允许的编辑组件变异范围，公众意见征询截至 11 月 27 日。
观点与综述
公众号：生信菜鸟团另有 1 家信源报道CANVAS 用 H&E 重建肿瘤空间生态位，并在 149 例 NSCLC 免疫治疗队列中构建预后特征
生信菜鸟团解读了 Cell 2026 论文中 CANVAS 的后半部分工作：模型先在 457 位 NSCLC 患者、超过 1800 万个 CODEX 单细胞中定义 10 类 Cellular Neighborhoods，再借助 MUSK 病理基础模型从 H&E 预测对应的虚拟 habitat。作者把模型应用到 TCGA、PLCO、NLST 共 1693 位无 CODEX 数据的 NSCLC 患者，H&E 预测的 habitat 仍保留与生存相关的趋势；随后扩展到 8 个 TCGA 癌种的 3724 张切片，合计超过 5000 位患者、9 种癌症。
- 虚拟空间组学如何从解析空间走向重建与预测空间公众号：生信人
Isaac KohaneUK Biobank 在数据泄露后重新向研究人员开放
Isaac Kohane 转发 Retraction Watch 的消息称，UK Biobank 在发生数据泄露后将重新向研究人员开放。他在评论中称 UK Biobank 是独一无二的生物医学研究资源，对科学与生物医学的回报非同寻常，并指出其需要应对密集的监管与方法学挑战，而这些挑战曾使多数同等规模的努力难以推进。
Bluesky：Stephen Turner (@stephenturner.us)调查显示过半研究人员在同行评审中使用 AI，且常与规范相悖
Stephen Turner 分享了一项发表于 Nature 的调查：对 1,600 名学者的问卷显示，超过 50% 的人在审稿时使用过人工智能工具，且这种使用常常违背相关指引。该调查以研究人员自报的使用情况为基础，呈现 AI 在同行评审环节的渗透程度。
公众号：动脉网AI辅助诊断进医保半年后，三位从业者谈商业化是否跑通
动脉网一场直播中，上海交通大学医学院临床医学研究院数据和智能部负责人冯铁男、深圳邦勤创业投资基金董事总经理汪琴、透彻未来联合创始人兼首席技术官王书浩讨论AI辅助诊断进医保后的商业化进展。汪琴指出，政策规定AI辅助诊断不能单独收费，而是作为原有诊断项目的扩展项合并结算；文件中的缺数减收条款要求医院提供数字化切片并上传病理报告，否则每张切片减收5到15元。冯铁男认为医院为AI买单的动力来自效率提升，且企业先要取得三类医疗器械注册证。汪琴把院内科室视为更值得投入的场景，并认为卖软硬件、License和年费仍是公立医院体系内的主流模式。
Bluesky：Stephen Turner (@stephenturner.us)Stephen Turner 谈 AI 建议与专家判断
Stephen Turner 在博客中分享了对 AI 建议与专家判断的观察：分析师会采纳 AI 代理为其指定的偏好，同时仍觉得最终结果出自自己之手。帖子以链接形式给出这篇博客，正文未展开具体研究设计、样本或数据来源。
公众号：返朴自主科研智能体能否做原创科研，返朴对话于乃功
返朴转载科普中国的文章，围绕“AI 能否自主做原创科研”访谈北京工业大学教授、中国人工智能学会理事于乃功。文章提到 OpenAI 近期公开七百余篇由内部 AI 模型生成的数学研究手稿，涉及数百组相关成果，部分结果附有可供计算机核验的形式化证明，但其正确性、新颖性和学术价值仍需评估。文中把自主科研智能体定义为在限定目标和条件下自主规划步骤、调用文献数据库与仿真软件等专业工具、并依据证明检查或实验观测反馈调整计划的系统，关键结论仍需独立验证。
Bluesky：Chenxin Li, PhD (@chenxinli2.bsky.social)Chenxin Li 谈 LLM 普及后审稿更看重独立实验验证
Chenxin Li 指出，LLM 在研究中的广泛使用已经改变了其所在领域稿件评审的标准：审稿人不再只满足于分析做得完整、论证听起来有说服力，而会追问“独立的实验验证在哪里”。他认为 AI 能完成这些分析并让结论显得可信，但评审的关注点已转向是否有独立实验支撑。