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FAPROTAX2-db 发布:基于实验数据的原核生物功能表型数据库

FAPROTAX2-db:基于实验数据的原核生物功能表型数据库

AI 导读

Scientific Data 发表新数据集 FAPROTAX2-db,整理了 15,625 个培养原核物种的 101 种生态功能实验表型数据。与旧版 FAPROTAX v1 相比,新版不仅大幅增加存在记录,还加入大量缺失记录,数据库仍以 Pseudomonadota、Actinomycetota、Bacillota、Bacteroidota 四大门为主,占近 90% 的物种记录。功能共现分析显示,硝酸盐呼吸与亚硝酸盐呼吸高度相关,暗硫氧化与暗硫代硫酸盐氧化的 Phi 达 0.97;果胶降解与海藻酸盐降解的 Phi 约 0.65。

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来源:公众号:宏基因组 · mp.weixin.qq.com