全原子分子动力学与well-tempered metadynamics揭示c-MYC癌蛋白表面的可成药口袋

结合全原子分子动力学与well-tempered metadynamics模拟，一项研究在含水离子溶液中绘制了MYC基序的构象景观，识别出稳定构象及可用于药物设计的口袋，为长期被视为"不可成药"的c-MYC提供结构基础。所选能量最小化结构表现出稳定构象与可成药口袋；静电势与分子对接结果显示，MYC抑制剂10074-G5与该结构高度契合。该抑制剂在多个此前未报道的可成药口袋中进入，并在长达1 μs的无偏轨迹中与MYC保持稳定结合。MYC失调涉及高达70%的人类癌症，其N端反式激活结构域与C端bHLHLZ结构域分别承担转录激活及与MAX二聚化、DNA结合功能。