牛呼吸道病毒组早期生命分析揭示噬菌体驱动的适应与跨宿主进化特征

对肉牛犊牛从出生到断奶的上呼吸道病毒组进行纵向分析，发现病毒群落的丰富度和更替率随生命早期上升，温带噬菌体在上呼吸道噬菌体群落中占主导，并与细菌宿主共享毒力和移动相关基因。脊椎动物相关病毒在出生一周后出现，从牛上呼吸道病毒组中靶向重装获得接近完整的 betacoronavirus 样基因组 CoV-D180 和 adenovirus 样基因组 AdV-D56，二者在系统发育上位于牛与人类病毒谱系之间。将 CoV-D180 和 AdV-D56 竞争性比对到人类呼吸道宏转录组数据集，显示与参考病毒不同的基因组特异性、区域结构化覆盖模式，支持跨宿主病毒谱系在保守基因组区域共享序列特征。