Nature 研究揭示 SWI/SNF 经 CTCF/cohesin 重塑染色质三维结构致癌的机制

康奈尔大学与西班牙 Josep Carreras 白血病研究中心的合作者在 Nature 发表研究，揭示 SWI/SNF（BAF）复合物通过 CTCF 和 cohesin 塑造染色质三维结构，并提出 BAF 功能缺失促癌的机制模型。研究在 15 种人源细胞系中用 BAF 抑制剂 FHD-286 处理，并在淋巴瘤和乳腺癌细胞中敲除或敲低 ARID1A，ATAC-seq 显示染色质开放区域普遍富集 CTCF 结合基序；ChIP-seq 显示 ARID1A 缺失后 CTCF 与 SMC3 结合增加，急性敲低 CTCF 可使约 93.5% 的开放峰回归。