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10月19日周一
  1. Cell75

    微生物组-胆汁酸轴介导女性对慢性肝病的保护作用

    Cell 在线优先发表研究,提出一条微生物组-胆汁酸轴介导女性对慢性肝病的保护。由雌激素促进的肠道细菌联合体产生的女性富集胆汁酸 isoUDCA,通过 SREBP2-STARD4-CYP7B1 信号促进肝脏胆固醇处理和胆汁酸代谢,从而减轻慢性肝损伤。

    推荐理由:研究把女性慢性肝病保护与肠道菌群来源的胆汁酸 isoUDCA 联系起来,并给出 SREBP2-STARD4-CYP7B1 信号通路这一机制线索。

10月18日周日
10月15日周四
  1. Cell72

    Cell 研究揭示头足类 RNA 编辑对蛋白质组的功能多样化作用

    Cell 在线发表的研究用蛋白质组学检测头足类 RNA 编辑产生的重编码位点,发现单个氨基酸编辑会改变蛋白质稳定性、亚细胞定位、翻译后修饰和细胞器功能。研究指出,鞘形亚纲头足类的 RNA 编辑水平远超其他动物,但其对蛋白质组的功能后果此前大多未知。

    推荐理由:用蛋白质组学直接检测头足类 RNA 编辑位点的重编码产物,把编辑事件与蛋白稳定性、定位和修饰的变化联系起来。

  2. Cell78

    慢性运动多组学图谱覆盖 22 种组织

    研究团队构建了慢性运动的 22 种组织多组学图谱,刻画了随组织、性别和时间变化的分子适应,以及骨骼肌中细胞类型特异的表观遗传重塑。图谱显示转录组、表观遗传、蛋白质组和代谢层面在全身范围内协同重塑。

    推荐理由:该图谱覆盖 22 种组织,呈现运动适应在组织、性别和时间维度上的差异,为研究跨组织分子调控提供参照。

  3. Genome Biology58

    共生 Lachnospiraceae bacterium 3–1-57 鞭毛蛋白经 ILC3/IL-22 轴改善结肠炎相关黏蛋白岩藻糖基化缺陷

    研究发现活动期溃疡性结肠炎患者肠道中 Lachnospiraceae bacterium 3–1-57 丰度降低,且与疾病严重程度呈负相关;在小鼠结肠炎模型中,活菌或其鞭毛蛋白 L. 3–1-57 Fla 可减轻肠道炎症和黏液屏障功能障碍,而 E. coli 鞭毛蛋白反而加重病情。

10月13日周二
  1. Bluesky:Vienna Airway Lab (@viennaairwaylab.bsky.social)33

    132 例 CRSwNP 患者的转录组与鼻腔微生物组联合分析揭示 4 种免疫-微生物内型及激素反应差异

    对 132 例慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者整合转录组与鼻腔微生物组分析,识别出 4 种具有不同免疫-微生物特征和类固醇反应的内型。以 Staphylococcus 为主的 Cluster C 对附加全身糖皮质激素治疗的反应最高。

10月12日周一
  1. Genomics, Proteomics & Bioinformatics60

    单细胞多组学揭示系统性红斑狼疮免疫抑制治疗后仍存在的多维免疫失调

    研究用单细胞多组学在真实临床场景下追踪系统性红斑狼疮(SLE)患者接受免疫抑制剂标准治疗期间的免疫组库动态,发现该疗法未能纠正 B 细胞和浆细胞的突变负荷下降,也未能阻止 CD4+ Th1 与 CD8+ 记忆 T 细胞的克隆扩增。作者还将自有数据与已发表的 SLE 数据集整合,构建了约 160 万细胞的 SLE 免疫图谱,并指出这些持续存在的失调可能与该病治疗后高复发率相关。

10月10日周六
  1. Whitehead Institute65

    HHMI 团队构建小鼠发育细胞来源与去向图谱

    HHMI 研究员 Jonathan Weissman、Jay Shendure 及团队开发出新工具,可对发育中小鼠体内大量细胞的来源与去向生成图谱。Whitehead Institute 转述称,这类详细图谱有望帮助科学家定位出生缺陷发生的时间点、追踪癌细胞获得扩散或耐药能力的路径,并更好地引导干细胞成熟为功能性细胞类型。

    推荐理由:这项在小鼠胚胎中追踪大量细胞来源与去向的工作,为研究发育异常和细胞状态转变提供了可参照的图谱思路。

10月8日周四
10月7日周三
10月6日周二
10月5日周一
10月4日周日
  1. Molecular Systems Biology60

    通量效率与代谢控制的权衡决定酶分配

    研究推导出联系平衡常数 K 与催化丰度商 CAQ 的解析关系,用以界定通路达到最大通量效率的条件。作者整合反应热力学、酶动力学、转录组与蛋白组数据,在进化距离较远的多个物种中比较糖酵解与 TCA 循环的酶分配,发现偏离该关系的部分可由最大化通量效率与集中通量控制之间的权衡解释。

  2. Alice Ting82

    Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 系列期刊连发 9 篇线粒体蛋白组研究

    Vamsi Mootha 与 Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 及 Cell 系列期刊连发 9 篇研究论文和 2 篇观点文章,表征了从 Giardia、Leishmania 到 Arabidopsis 等 6 个物种的线粒体蛋白组。

    推荐理由:Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 系列期刊连发 9 篇论文,系统比较 6 个物种的线粒体蛋白组,并据此提出跨寄生虫药物靶点。

10月2日周五
10月1日周四
  1. Broad Institute60

    跨真核生物线粒体蛋白目录揭示细胞能量工厂的新功能

    Broad Institute 报道,研究人员构建了六种真核生物(五种寄生虫和一种植物)的线粒体蛋白目录,结合已有的人类和酵母线粒体清单,重新审视这一细胞器的功能与演化。该工作揭示了 Giardia 极小的线粒体蛋白组和 Acanthamoeba 线粒体的意外能力,并支持线粒体在真核生物演化中起源相对较晚的观点。结果还指出多种病原体共有、但人类缺失的线粒体蛋白,提示被忽视热带病的新治疗靶点。

9月28日周一
  1. Cell Genomics78

    九种哺乳动物脑单细胞多组学比较揭示细胞类型特异的调控保守性

    Anderson 等对九种哺乳动物的脑组织开展单细胞多组学比较,发现增强子的保守性不止体现在 DNA 序列上,还体现在细胞类型特异性和靶基因上。功能实验进一步显示,古老调控元件与人类特异调控元件共同影响脑生物学和神经系统疾病的易感性。

    推荐理由:跨九种哺乳动物比较脑内基因调控,把增强子保守性从序列层面延伸到细胞类型与靶基因层面。

9月21日周一
  1. 中国科学院遗传与发育生物学研究所58

    税光厚团队在 Med 发表猴痘及猴痘-HIV共感染血浆多组学研究

    广州国家实验室/中国科学院遗传与发育生物学研究所税光厚团队与首都医科大学附属北京佑安医院冯英梅团队合作,在 Med 发表论文,整合血浆脂质组、代谢组、炎症因子和外泌体蛋白组,刻画猴痘及猴痘-HIV共感染的脂质-免疫失调与外泌体重塑。

9月20日周日
9月16日周三
9月8日周二
9月4日周五
  1. Arc Institute62

    研究揭示哺乳动物细胞内的支链氨基酸发酵通路

    Arc Institute 的 Jain 实验室在小鼠缺氧代谢组中发现,支链氨基酸(BCAA)发酵可作为哺乳动物细胞中不依赖乳酸的替代电子受体途径。研究显示,在缺氧条件下,LDHA 会以催化混杂的方式将支链酮酸还原为支链羟酸(BCHA),小鼠尿液中的 BCHA 水平升高;在人类中,BCHA 在抗阻运动、重症 COVID-19 和饮酒三种状态下升高,主要作为还原应激的生物标志物。

8月14日周五