强迫症心理治疗应答与DNA甲基化标志物相关
挪威卑尔根大学团队分析约900名接受Bergen 4-Day Treatment的强迫症患者唾液样本,在治疗前、治疗后及3个月随访时检测DNA甲基化,发现多个甲基化区域与治疗应答相关。
挪威卑尔根大学团队分析约900名接受Bergen 4-Day Treatment的强迫症患者唾液样本,在治疗前、治疗后及3个月随访时检测DNA甲基化,发现多个甲基化区域与治疗应答相关。
一项发表于 The Plant Journal 的研究追踪 47 个遗传多样性玉米品种,发现仅干旱下的表现无法预测高温与干旱复合胁迫下的表现,提示育种筛选需同时评估两种胁迫。
Cell 在线优先发表研究,提出一条微生物组-胆汁酸轴介导女性对慢性肝病的保护。由雌激素促进的肠道细菌联合体产生的女性富集胆汁酸 isoUDCA,通过 SREBP2-STARD4-CYP7B1 信号促进肝脏胆固醇处理和胆汁酸代谢,从而减轻慢性肝损伤。
推荐理由:研究把女性慢性肝病保护与肠道菌群来源的胆汁酸 isoUDCA 联系起来,并给出 SREBP2-STARD4-CYP7B1 信号通路这一机制线索。
基于 PRJNA658160 的 804 份粪便 16S rRNA V4 测序数据(386 例乳腺癌、418 例健康对照),乳腺癌样本的分类学 alpha 多样性显著降低,13 个属存在差异丰度,Bacteroides、Erysipelatoclostridium、Parabacteroides 和 Fusobacterium 在乳腺癌中富集。
中国科学院亚热带农业生态研究所印遇龙院士、徐智敏副研究员团队在iMeta发表研究,用200 nm纳米塑料长期暴露ICR小鼠,整合代谢组学与宏基因组学,揭示纳米塑料通过重塑胆汁酸—微生物群轴驱动肝肠代谢紊乱。
对29对胃癌及癌旁组织和61例胃癌患者、29例健康对照的血浆cfDNA进行WGBS,鉴定出32个在组织与血浆中一致变化的稳定DMR,并筛选出8个核心诊断标志物。
Cell 在线发表的研究用蛋白质组学检测头足类 RNA 编辑产生的重编码位点,发现单个氨基酸编辑会改变蛋白质稳定性、亚细胞定位、翻译后修饰和细胞器功能。研究指出,鞘形亚纲头足类的 RNA 编辑水平远超其他动物,但其对蛋白质组的功能后果此前大多未知。
推荐理由:用蛋白质组学直接检测头足类 RNA 编辑位点的重编码产物,把编辑事件与蛋白稳定性、定位和修饰的变化联系起来。
研究团队构建了慢性运动的 22 种组织多组学图谱,刻画了随组织、性别和时间变化的分子适应,以及骨骼肌中细胞类型特异的表观遗传重塑。图谱显示转录组、表观遗传、蛋白质组和代谢层面在全身范围内协同重塑。
推荐理由:该图谱覆盖 22 种组织,呈现运动适应在组织、性别和时间维度上的差异,为研究跨组织分子调控提供参照。
研究发现活动期溃疡性结肠炎患者肠道中 Lachnospiraceae bacterium 3–1-57 丰度降低,且与疾病严重程度呈负相关;在小鼠结肠炎模型中,活菌或其鞭毛蛋白 L. 3–1-57 Fla 可减轻肠道炎症和黏液屏障功能障碍,而 E. coli 鞭毛蛋白反而加重病情。
对 132 例慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者整合转录组与鼻腔微生物组分析,识别出 4 种具有不同免疫-微生物特征和类固醇反应的内型。以 Staphylococcus 为主的 Cluster C 对附加全身糖皮质激素治疗的反应最高。
研究用单细胞多组学在真实临床场景下追踪系统性红斑狼疮(SLE)患者接受免疫抑制剂标准治疗期间的免疫组库动态,发现该疗法未能纠正 B 细胞和浆细胞的突变负荷下降,也未能阻止 CD4+ Th1 与 CD8+ 记忆 T 细胞的克隆扩增。作者还将自有数据与已发表的 SLE 数据集整合,构建了约 160 万细胞的 SLE 免疫图谱,并指出这些持续存在的失调可能与该病治疗后高复发率相关。
HHMI 研究员 Jonathan Weissman、Jay Shendure 及团队开发出新工具,可对发育中小鼠体内大量细胞的来源与去向生成图谱。Whitehead Institute 转述称,这类详细图谱有望帮助科学家定位出生缺陷发生的时间点、追踪癌细胞获得扩散或耐药能力的路径,并更好地引导干细胞成熟为功能性细胞类型。
推荐理由:这项在小鼠胚胎中追踪大量细胞来源与去向的工作,为研究发育异常和细胞状态转变提供了可参照的图谱思路。
中国科学院遗传与发育生物学研究所鲁非团队与山东省农业科学院曹新有团队合作,以济麦44、济麦229及271份重组自交系为材料,完成济麦229染色体水平基因组组装,鉴定到27个与SDS沉降值相关的QTL。
中国科学院遗传与发育生物学研究所贺飞研究组联合西北农林科技大学吉万全研究组等,构建了十倍体长穗偃麦草同源染色体组分辨率的高质量参考基因组,成果于2026年9月30日在线发表于 Molecular Plant。
基于人类功能基因组学计划的286名坦桑尼亚健康人和340名荷兰人队列,对Olink Target 96 Inflammation panel检测的72种炎症蛋白进行全基因组pQTL分析,两个人群各鉴定出10个全基因组显著pQTL,但重叠不足2%,共定位分析仅确认9个共享位点。
一项由 Penn State 研究人员主导的新研究发现,人体肠道细菌与肝脏会修饰食物中的色氨酸衍生分子,生成可能影响生物信号传导和肠道健康的代谢物。这些代谢物可激活或抑制一系列基因,涉及 OHMC 成员参与。
EMBL 罗马 Ana Boskovic 团队在小鼠中建立精确控制受精时间的 IVF 方案,结合多个时间点的单胚胎基因活性分析,以高分辨率刻画了胚胎基因组激活(EGA)过程,成果发表于 Science Advances。
研究推导出联系平衡常数 K 与催化丰度商 CAQ 的解析关系,用以界定通路达到最大通量效率的条件。作者整合反应热力学、酶动力学、转录组与蛋白组数据,在进化距离较远的多个物种中比较糖酵解与 TCA 循环的酶分配,发现偏离该关系的部分可由最大化通量效率与集中通量控制之间的权衡解释。
Vamsi Mootha 与 Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 及 Cell 系列期刊连发 9 篇研究论文和 2 篇观点文章,表征了从 Giardia、Leishmania 到 Arabidopsis 等 6 个物种的线粒体蛋白组。
推荐理由:Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 系列期刊连发 9 篇论文,系统比较 6 个物种的线粒体蛋白组,并据此提出跨寄生虫药物靶点。
Barton 实验室开发出富集成熟髓鞘化少突胶质细胞和功能性反应性小胶质细胞的 iPSC 来源类器官。
Broad Institute 报道,研究人员构建了六种真核生物(五种寄生虫和一种植物)的线粒体蛋白目录,结合已有的人类和酵母线粒体清单,重新审视这一细胞器的功能与演化。该工作揭示了 Giardia 极小的线粒体蛋白组和 Acanthamoeba 线粒体的意外能力,并支持线粒体在真核生物演化中起源相对较晚的观点。结果还指出多种病原体共有、但人类缺失的线粒体蛋白,提示被忽视热带病的新治疗靶点。
Anderson 等对九种哺乳动物的脑组织开展单细胞多组学比较,发现增强子的保守性不止体现在 DNA 序列上,还体现在细胞类型特异性和靶基因上。功能实验进一步显示,古老调控元件与人类特异调控元件共同影响脑生物学和神经系统疾病的易感性。
推荐理由:跨九种哺乳动物比较脑内基因调控,把增强子保守性从序列层面延伸到细胞类型与靶基因层面。
广州国家实验室/中国科学院遗传与发育生物学研究所税光厚团队与首都医科大学附属北京佑安医院冯英梅团队合作,在 Med 发表论文,整合血浆脂质组、代谢组、炎症因子和外泌体蛋白组,刻画猴痘及猴痘-HIV共感染的脂质-免疫失调与外泌体重塑。
Eran Segal 团队在 npj Aging 发表论文,用 30 秒语音录音构建 Voice Age 模型,基于 Human Phenotype Project 的 7000 名参与者训练,预测实际年龄。
Bankier 等利用 STARNET 研究数据开展跨多组织的平行多组学整合分析,显示血浆蛋白是跨组织基因调控网络(GRN)的组成部分。不同 GRN 的蛋白质组特征与心血管代谢结局及风险因素相关。
Rendeiro 实验室在 bioRxiv 发布预印本,以单细胞分辨率绘制人体组织衰老图谱,覆盖 3.5 billion 个细胞、16 个器官、980 名供体,跨越成年生命周期。该工作由 @e-abila 主导,论文链接为 www.biorxiv.org/content/10.6...。
研究发布了仓鸮(Tyto alba)染色体级别、单倍型解析的基因组组装,采用 trio-binning 策略结合 Illumina 亲本 reads、PacBio HiFi 与 Oxford Nanopore 数据,获得 2 套定相 contig,并借助连锁图挂载为 40 个连锁群。
Arc Institute 的 Jain 实验室在小鼠缺氧代谢组中发现,支链氨基酸(BCAA)发酵可作为哺乳动物细胞中不依赖乳酸的替代电子受体途径。研究显示,在缺氧条件下,LDHA 会以催化混杂的方式将支链酮酸还原为支链羟酸(BCHA),小鼠尿液中的 BCHA 水平升高;在人类中,BCHA 在抗阻运动、重症 COVID-19 和饮酒三种状态下升高,主要作为还原应激的生物标志物。
Andre Rendeiro 团队的组织衰老时钟论文在 Nature Medicine 发表,研究从 983 名 GTEx 供体的约 2.5 万张组织学图像中量化生物学年龄,并显示该信号可从血液中读出。