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今天10月20日周二3 条
  1. Nature Communications58

    cadonilimab 联合吉西他滨和顺铂一线治疗晚期胆道癌的 II 期 BicureX 试验结果

    BicureX 是一项单中心、开放标签、单臂 II 期试验,评估抗 PD-1/CTLA-4 双特异性抗体 cadonilimab 联合吉西他滨和顺铂(GC)一线治疗不可切除局部晚期或转移性胆道癌(BTC)。61 例患者入组,接受最多 8 个联合周期后进入 cadonilimab 维持治疗,主要终点为按 RECIST v1.1 评估的客观缓解率(ORR)。

  2. Nature Communications58

    冷冻电镜结构揭示二聚体颗粒酶 A 特异性识别并切割全长 GSDMB

    研究团队解析了人源 GSDMB 与颗粒酶 A(GZMA)复合物的冷冻电镜结构,显示 GZMA 通过其单体表面及二聚体界面上的多个接触位点识别 GSDMB 的 C 端结构域(GSDMB-CTD),这些接触作为外部位点(exosite)把底物呈递给相邻的 GZMA 完成反式切割。此前已知 GZMA 的底物特异性由催化位点之外的相互作用决定,但 GZMA 外部位点识别 GSDMB 的分子机制并不清楚。GSDMB 被杀伤淋巴细胞释放的 GZMA 切割后,其 N 端结构域形成 gasdermin 孔道,在靶细胞中引发焦亡并增强抗肿瘤免疫。

10月19日周一
  1. 公众号:环球科学58

    超级百岁老人体内富集CD4杀伤性T细胞,或与抗癌适应有关

    日本大阪大学桥本浩介团队发现,110岁及以上老人体内CD4细胞毒性T淋巴细胞(CD4 CTLs)占比达18%,百岁老人约10%,低于100岁者约4%。研究招募28名受试者(8位70-90岁、10位100-109岁、10位110岁以上),部分百岁老人样本中单个克隆系占CD4 CTLs的53.8%,约30个受体序列与癌症患者数据库匹配,以肺癌最常见。

  2. In the Pipeline72

    研究发现哺乳动物细胞以 S8 形式储存元素硫

    一项研究通过拉曼光谱和宿主-客体质谱捕获方法,在人类线粒体和细胞脂滴中检出环状八硫(S8),这是此前只在原核生物中见过的元素硫形式。癌组织中 S8 水平更高,可达 100mM 以上,作者估计正常人体细胞内至少携带数十克元素硫。数据还提示 S8 由内皮型一氧化氮合酶(eNOS)系统作为独立产物合成,其疏水性可能与抑制脂质过氧化有关。

  3. Nucleic Acids Research62

    整合分析揭示C2H2锌指蛋白在染色质环锚点上的广泛互作

    研究整合216个C2H2-ZFPs的ChIP-seq数据与全基因组染色质互作图谱,发现超过40%的人C2H2-ZFPs在长程染色质互作(LRI)锚点显著富集。作者用亲和纯化-质谱构建了覆盖345个C2H2-ZFPs的互作组,并对204个成员做LUMIER二元互作实验,发现互作的C2H2-ZFP对在LRI上显著共富集,常定位于相同或相对的环锚点。

  4. 公众号:BioArt82

    Nature:Triana Biomedicines 报道可穿越血脑屏障的 ALK 分子胶降解剂 TRI-611

    美国 Triana Biomedicines 公司的 Vito J. Palombella 和 Andrew R. Conery 在 Nature 发表研究,报道了选择性、可穿越血脑屏障的 ALK 分子胶降解剂 TRI-611。

    推荐理由:报道的分子胶降解剂绕开ALK激酶活性位点,在耐药与颅内模型中仍有效,为靶向蛋白降解提供了新降解基序的结构依据。

10月18日周日
  1. Fyodor Urnov58

    NEJM 报告基因治疗后 AAV 插入突变致椎旁肿瘤

    NEJM 刊出 Vo 等人的报告,在一名接受基因治疗的患者椎旁肿瘤中检出 AAV 整合,整合序列保留了 CAG 启动子–增强子并激活了一个发育相关转录因子。Fyodor Urnov 指出这是今年第二例 AAV 驱动插入突变的报告,约 3000 名接受 AAV 治疗者中出现 2 例,比例很低但并非为零,他认为关键在于获益与风险的权衡。

10月17日周六
  1. 公众号:单细胞天地84

    Nature 研究鉴定癌前效应性 Treg 细胞轴,PI3Kδ 抑制可在小鼠中拦截肺癌发生

    一项发表于 Nature 的研究整合单细胞 RNA 测序、TCR 测序与 Xenium 空间转录组,在高级别癌前气道病变中鉴定出 BATF+ 效应性 Treg 细胞,并构建了淋巴结—循环—气道的跨组织调控轴。

    推荐理由:研究把肺癌免疫干预窗口前移到癌前阶段,并用跨组织克隆共享与空间结构给出可追踪的细胞轴。

  2. Genome Medicine58

    SHH 型髓母细胞瘤单细胞与空间纵向图谱揭示复发相关程序及候选治疗靶点

    研究对 22 例 SHH 型髓母细胞瘤样本(16 例原发、6 例复发,含 4 对原发-复发配对)开展 snRNA-seq(n = 16)、snATAC-seq(n = 13)和空间转录组(n = 6)分析,并结合 25 例样本的外显子变异数据,另用 48 例样本(24 对原发-复发配对)的 bulk RNA-seq 做验证。

  3. Medical Xpress60

    近千例前列腺肿瘤全基因组分析揭示侵袭性相关基因组亚型

    研究团队用计算方法分析近 1000 例前列腺肿瘤的全基因组测序数据,构建了可能驱动前列腺癌的遗传改变目录,发现 97% 的肿瘤至少携带一个已知或潜在驱动改变。研究识别出四种与不同临床结局相关的基因组亚型,其中两种与显著更高的转移风险相关,并在近四分之一肿瘤中找到现有癌症药物的潜在靶点。

  4. Science Advances58

    TAK-243 的 CRISPR 筛选揭示 HAPSTR1/HUWE1 轴调控染色质蛋白稳态与细胞周期

    研究在泛素 E1 抑制剂 TAK-243 存在下开展全基因组 CRISPR 敲除筛选,鉴定出 239 个基因,敲除这些基因会使细胞对泛素化阻断更敏感。后续分析显示,核蛋白 HAPSTR1 将 E3 连接酶 HUWE1 招募到染色质,维持染色质相关蛋白组的稳定,而 HAPSTR1 自身在细胞周期进程中被 HUWE1 降解。

10月16日周五
10月15日周四
  1. Cell58

    细胞自组织调控铁死亡的传播方向与范围

    Cell 在线发表的研究显示,局部细胞间相互作用会形成可编码铁死亡敏感与抵抗命运的细胞图案,并在细胞内建立极性脂质组织。这些生化与生物物理特性耦合后,使自组织的细胞群体能够定向并限制原本各向同性、无界扩散的铁死亡传播,从而提出一种在系统层面调控群体细胞命运的机制。

  2. Genome Medicine78

    研究揭示NOTCH1早期突变在正常食管上皮中受正选择却抑制后续ESCC驱动突变演化

    一项发表于Genome Medicine的研究用定量演化框架分析2171份样本,区分突变率与选择,发现NOTCH1突变在组织学正常食管上皮克隆扩增中受强正选择,这解释了其在该组织中的高 prevalence。

    推荐理由:研究用2171份样本区分突变率与选择,显示NOTCH1在正常食管上皮中受强选择,却与TP53、RB1呈拮抗上位性,抑制后续恶性演化。

  3. Medical Xpress78

    国际 GLASS 研究追踪 IDH 突变胶质瘤复发时的基因组变化

    Jackson Laboratory、耶鲁大学等 10 国合作团队在 Nature 发表 GLASS 联盟研究,对 183 例治疗前后配对取样的 IDH 突变胶质瘤进行分析,发现复发时少突胶质细胞瘤倾向获得新的生长驱动突变,星形细胞瘤则更常发生大规模染色体改变。

    推荐理由:GLASS 联盟对 183 例配对样本的分析显示,IDH 突变胶质瘤的两种亚型在复发时走的是不同的基因组演化路径。

10月13日周二
  1. Nature Biotechnology78

    配体导向脂质纳米颗粒在体内生成 CAR NK 细胞

    研究团队开发了靶向 NK 细胞的脂质纳米颗粒 NtLNPs,用工程化双靶向 NK 细胞配体驱动受体特异性摄取和 mRNA 递送,在小鼠中实现最高约 80% 的 NK 细胞转染且脱靶效应很小。经系统给药递送 CAR mRNA 可在体内生成 CAR NK 细胞:靶向 CD19 的 CAR NK 细胞在健康小鼠中完全清除循环 B 细胞,靶向 CD3 的 CAR NK 细胞在自身免疫性肝炎模型中清除几乎全部自身反应性 T 细胞,作者据此提出其在 T 细胞驱动疾病上可能优于 CAR T 疗法。

    推荐理由:研究用双靶向配体修饰的 LNP 在小鼠体内直接生成 CAR NK 细胞,为体内细胞工程提供了可迁移的递送思路。

  2. Nature Genetics75

    人胰腺导管腺癌克隆异质性及其对肿瘤进展的影响

    研究团队对 62 例原发胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤进行单细胞 RNA 测序(443,451 个细胞),并对其中 11 例肿瘤匹配空间转录组(53,236 个 spot),同时纳入 6 例化疗前后配对样本,刻画克隆、转录与空间多样性。分析发现同一肿瘤内共存多个遗传上不同的肿瘤克隆,克隆特异的配体-受体程序受基因组剂量调控:配体或受体扩增增强相应互作,缺失则抑制,空间转录组与多重免疫荧光支持这些遗传编码差异。

    推荐理由:62 例原发肿瘤的单细胞与空间转录组图谱,把克隆异质性、8q24/MYC 扩增与经典-基底表型转换联系起来。

10月12日周一
  1. Nature Genetics72

    微核中的 ecDNA 限制肿瘤细胞适合度并与患者较好生存相关

    研究发现 ecDNA 是微核的重要来源,复制压力下 ecDNA 发生有丝分裂聚集、不对称分配和错分进入微核,携带 ecDNA^+ 微核的细胞增殖能力下降、更易死亡。单微核测序显示多个不同 ecDNA 种类会汇聚到同一微核中;在 MYCN 扩增的神经母细胞瘤患者中,诊断时 ecDNA^+ 微核频率较高与总生存期改善相关。作者据此提出有丝分裂期 ecDNA 滞留可能成为治疗切入点。

    推荐理由:研究把 ecDNA 的微核错分与适合度下降联系起来,并给出神经母细胞瘤患者生存关联,为理解 ecDNA 的代价提供新角度。

10月11日周日
10月9日周五
  1. Matthias Mann Lab58

    质谱蛋白质组分析 83 例儿童肾上腺皮质肿瘤,识别出 4 种与生存相关的蛋白质组状态

    Matthias Mann 实验室对 83 例罕见儿童肾上腺皮质肿瘤的存档 FFPE 组织做质谱蛋白质组分析,识别出 4 种蛋白质组定义的状态,这些状态对生存的预测优于组织学。该工作由 Rainer Claus 和 Andreas Metousis 主导,发表在 eBioMedicine,DOI 为 10.1016/j.ebiom.2026.106504。

10月7日周三
10月4日周日
  1. Molecular Systems Biology60

    通量效率与代谢控制的权衡决定酶分配

    研究推导出联系平衡常数 K 与催化丰度商 CAQ 的解析关系,用以界定通路达到最大通量效率的条件。作者整合反应热力学、酶动力学、转录组与蛋白组数据,在进化距离较远的多个物种中比较糖酵解与 TCA 循环的酶分配,发现偏离该关系的部分可由最大化通量效率与集中通量控制之间的权衡解释。

9月29日周二
  1. Genomics, Proteomics & Bioinformatics38

    单细胞与空间转录组揭示 DEFB1+ 胆管细胞与 IFI30+ 巨噬细胞互作驱动肝内胆管癌免疫抑制微环境

    整合单细胞 RNA 测序与空间转录组构建人肝内胆管癌(ICC)细胞与转录图谱,发现 CD8+ 增殖 T 细胞存在终末型与祖细胞样两种耗竭程序。DEFB1+ 胆管细胞与 IFI30+ 巨噬细胞在多个独立 ICC 队列中呈强正相关,并在肿瘤微环境中空间邻近,其互作预测涉及 TGFB1–TGFBR1 信号轴,可能促进肿瘤进展与免疫治疗耐药。

9月26日周六
9月23日周三
  1. Molecular Systems Biology67

    整合空间信息的正常与癌症相关结肠成纤维细胞图谱

    研究结合大规模单细胞 RNA 测序、空间验证和功能实验,构建了人正常结肠成纤维细胞与间质亚群的参考图谱,并以小鼠结肠为参照。

    推荐理由:该研究以小鼠结肠为参照,用单细胞与空间验证构建人正常结肠和结直肠癌成纤维细胞参考图谱,为 CAF 分型提供统一坐标。

9月17日周四