Fabian Theis 谈 AI 如何改变癌症研究
Fabian Theis 在重庆 Nature 会议“Cancer Immunology in the AI Era”开幕主旨演讲中提出,科学是一场搜索,AI 能让干预空间中的搜索更系统化。
Fabian Theis 在重庆 Nature 会议“Cancer Immunology in the AI Era”开幕主旨演讲中提出,科学是一场搜索,AI 能让干预空间中的搜索更系统化。
Decoding Bio 的 BioByte 周刊本期重点介绍两项研究:Colgan 等用 PEtracer 系统在小鼠胚胎中记录细胞分裂标记,对 16 个胚胎、179 万个细胞做单细胞 RNA-seq,为 145 万个带标记细胞重建谱系并解析约四分之三的分支点,发现命运偏向在着床前后出现、内胚层谱系受限早于外胚层和中胚层。
推荐理由:两篇论文分别用谱系示踪重建小鼠胚胎细胞命运和用RNA修饰替代OCT4重编程,适合快速了解本周发育与重编程方向。
Philip Ball 在 Quanta Magazine 发表科普文章,讨论 Waddington 景观这一细胞命运决定隐喻。文中提及作者与 David Rand 利用动力系统理论和单细胞数据,使该景观隐喻可定量化并具备预测能力。
Eric Topol 解读了 2026 年 10 月 9 日发表在 Immunity 的论文,该研究对 8 个国际队列、2,609 人、12,394,834 个白细胞做单细胞 RNA 测序,区分出以颗粒酶 K 或 B 为主的 CD8+ 效应记忆 T 细胞(TemK+ 与 TemB+)。
推荐理由:这篇解读梳理了 8 个队列、260 万白细胞的分析,把免疫衰老的细胞分叉与死亡风险联系起来。
这篇 Perspective 提出用最小证伪框架检验生物机制算子能否提升单细胞扰动预测:在统一锁定评测下,与晚期融合、容量匹配静态模型、容量匹配学习动力学算子及拓扑重连对照比较。
这篇综述将肝脏 AI 虚拟细胞(AIVC)的建模路径归纳为三类:生成模型表征细胞状态,动力学与转运模型推断状态转换,预训练或基础模型检验表征能否跨供体、病因、疾病阶段和平台迁移,并以扰动响应预测作为贯穿性评估。
多模态单细胞技术(scRNA-seq、空间转录组与AI整合)正以空前分辨率解析血管周围脂肪组织(PVAT)生态系统,构建出揭示不同血管床细胞结构、表型可塑性与空间互作的整合图谱。综述据此提出Dpp4+前脂肪细胞、BMP4诱导的棕色化等新生物标志物与可干预疗法,并给出以人类PVAT生物样本库、CRISPR谱系追踪和AI建模为优先的转化路线图。
李婧翌(@jsb_ucla)致谢其博士生 Chenxin (Flora) Jiang 和博士后 Changhu Wang 参与完成一篇发表于 Cell Systems 的评论文章,该文围绕 Sun et al. (2024)、Mukamel & Yu (2025) 及 Sun et al. 回复之间关于单细胞转录组学的争论展开。