生信日报 · 2026 年 10 月 23 日 · 星期五
BIOINFOSOUL
Moderna 与 Merck 个体化 mRNA 癌症疫苗在黑色素瘤试验中达到主要终点
Moderna 与 Merck 公布的一项大型临床试验详细数据显示，其个体化 mRNA 癌症疫苗 intismeran autogene 相比标准治疗将黑色素瘤患者的疾病复发风险降低 42%，达到关键终点。肿瘤学家表示，患者无癌复发生存时间显著延长，这对黑色素瘤治疗是重要进展。该疫苗针对患者肿瘤中特有的新抗原突变，依托与新冠疫苗相同的 mRNA 技术实现个体化制备。报道同时提到，这一结果可能带动针对其他癌种的同类疗法开发。原文为 STAT+ 付费内容，后续细节未在可见正文中展开。
方法与工具
Science一手另有 2 家信源报道语言模型在序贯诊断中的表现与交互式基准
研究构建了交互式基准，用于评估语言模型在序贯诊断中的能力：模型根据简短临床表现选择性获取信息并给出诊断，同时记录检查成本。作者还开发了一个模拟医生小组的 AI 系统，持续修正鉴别诊断并选择性价比高的检查。
研究发现
Nature一手CRISPR 先导编辑首次在人体内直接修改 DNA
Nature 报道，高精度的先导编辑（prime editing）首次直接应用于人体内修改 DNA，属于一项针对可导致肝脏和神经损伤的遗传病的临床试验。报道未披露试验规模、受试者人数和具体结果。
Bluesky：Netherlands Cancer Institute (@nkinl.bsky.social)NICHE-2 试验 5 年随访：dMMR 结肠癌新辅助免疫治疗后无复发
荷兰癌症研究所公布的 NICHE-2 试验长期结果显示，111 例 dMMR 结肠癌患者接受 4 周新辅助免疫治疗后手术，5 年随访无一人复发。该单臂、多中心 2 期试验的长期结果已发表于 The Lancet，术前使用 ipilimumab 与 nivolumab 的患者 3 年无病生存率和 5 年总生存率均为 100%。
Nature Genetics一手研究发现全转录组关联研究效应方向错误率高
一项发表于 Nature Genetics 的研究估计，全转录组关联研究（TWAS）推断的基因效应方向常与真实生物学机制相反。作者利用“基因表达升高通常应伴随蛋白表达升高”这一预期，估计 TWAS 在血浆蛋白上的错误符号率为 23%；随后借助功能缺失负荷检验提供的预期效应方向，将框架扩展到复杂性状，得到 33% 的错误符号率。作者提出，当非性状相关组织中的表达数量性状位点通过紧密连锁但不同的调控变异标记与 GWAS 性状相关的单倍型时，会产生基因正确但效应方向不可靠的虚假 TWAS 关联。研究提示，基于 TWAS 的效应方向估计需谨慎解读，TWAS 的可靠性也值得进一步审视。
Nature Communications一手活细胞三维定位揭示核孔复合体 FG-Nups 的分层结构
研究团队结合高速二维单分子追踪与定位后二维到三维转换，在活细胞中重建了哺乳动物核孔复合体内全部 11 种 FG-Nups 的三维分布，并用 Monte Carlo 模拟和独立的 3D MINFLUX 测量进行验证。结果显示 FG 屏障并非均一的无序网状结构，而是分层架构：5 种锚定在中央的 FG-Nups 形成环绕稀疏轴心通道的环状结构，6 种不对称分布的 FG-Nups 延伸到支架之外，在胞质面和核质面形成动态帽状结构。Nup214 和 Nup153 在开放与闭合的轴向构象间切换，Nup98 几乎贯穿整个孔道并与多数其他 FG-Nups 重叠。
MCT6 是肠道 Lac-Phe 外排转运蛋白，为二甲双胍相关减重所必需
Cell 在线发表的研究显示，孤儿转运蛋白 MCT6 是餐食和运动相关代谢物 Lac-Phe 从肠道细胞排出进入血液的途径。缺失肠道 MCT6 的小鼠无法维持正常的循环 Lac-Phe 水平，并对二甲双胍相关的体重下降表现出抵抗。作者据此提出，代谢物外排是调控系统性作用的一个节点。
公众号：BioArt另有 1 家信源报道陈佺团队在 Nature 揭示 GRP75 协同线粒体-内质网结构实现跨细胞器质量控制
南开大学陈佺、于凡与青岛市中心医院肖佳等团队在 Nature 发表研究，发现应激诱导的线粒体蛋白凝集体 SIMPA，并阐明分子伴侣 GRP75 协同线粒体-内质网结构（MAM）完成跨细胞器质量控制的机制。研究显示，Oligomycin、热休克、H2O2 及线粒体 AIE 分子等均能以剂量依赖方式诱导 SIMPA；常用的共价线粒体染料 MitoTracker 在无外源毒性时也能诱导其形成，100 nM MitoTracker Red 染色 30 分钟后洗脱，24 小时阳性率达 100%，而非共价探针 PK Mito 不诱导。
Medical Xpress密歇根团队用长读长纳米孔测序揭示癌症中被常规测序漏掉的驱动变异
美国密歇根大学团队在 MiOncoSeq 项目中引入长读长纳米孔测序，用于识别常规短读长测序可能漏掉的肿瘤基因变异，相关结果发表于 Cancer Discovery。研究先筛查 768 名前列腺癌、乳腺癌或卵巢癌患者，找出 46 例常规测序无法解释的基因组不稳定肿瘤，长读长测序在其中 32 例中定位到隐藏的结构改变或化学修饰；随后又对 MiOncoSeq 中 3,688 名患者的 4,496 份肿瘤样本做筛查，并在部分病例中用纳米孔测序解析 NOTCH1、PDGFRB、KIT 和 PIK3CA 等基因中突变的排布方式。
公众号：BioArtMEDNature 研究：纵向基因组学揭示 IDH 突变胶质瘤两条演化轨迹
耶鲁大学 Roel G. W. Verhaak 与杰克逊基因组医学实验室 Frederick S. Varn 团队在 Nature 发表研究，发现 IDH 突变型少突胶质细胞瘤和星形细胞瘤在治疗后沿不同路径演化。研究基于 GLASS 纵向队列，纳入 21 家机构的 183 名患者（94 例星形细胞瘤、89 例少突胶质细胞瘤），用全基因组和全外显子组测序比较同一患者初诊与复发肿瘤。少突胶质细胞瘤复发时主要获得新的克隆性点突变，星形细胞瘤则以拷贝数改变为主，复发后 FGA 与全基因组加倍明显增加，并伴随更多染色体灾难性碎裂重组。
AI × 生物医药
Jason Kelly另有 2 家信源报道Hugging Face 团队发布 14B 模型 Carbon-X，打通 DNA 与自然语言
Hugging Face 团队发布 Carbon-X，一个把 DNA 与自然语言结合起来的 14B 模型。据其介绍，该模型在测试过的 DNA 基准上超过所有开源语言模型，与 GPT-6.1 Sol 相差不到 1 分，推理成本低 1000 倍以上；训练上先用 300B token 的 DNA 与文本交错数据做中期训练，再做 SFT（未用蒸馏）和 RL；新的混合 tokenizer 编码 DNA 所用 token 数比 BPE 少约 3 倍；其他模型可把它当作 DNA 专家子代理，Kimi K3 调用后提升 11.1 分；模型以 Apache 2.0 许可发布，可在笔记本上用 llama.cpp 本地运行。Jason Kelly 转发该发布并评论，认为当下技术与生物的交叉比合成生物学时代推进更快，原因是大科技公司正在投入。
- Kundaje 评 Carbon-X：开源 DNA 模型之外，基准评测问题仍在Anshul Kundaje
医药产业
公众号：医药经济报GSK乙肝ASO新药贝普若韦生获FDA批准，正大天晴提前半年接手中国商业化
葛兰素史克（GSK）宣布，反义寡核苷酸（ASO）药物贝普若韦生（Bepirovirsen，商品名Hibsago）获美国FDA正式批准上市，与核苷（酸）类似物逆转录酶抑制剂（NRTI）联合用于治疗无肝硬化的成人慢性乙型肝炎患者，适用人群需接受NRTI治疗至少6个月、已实现HBV DNA抑制且HBsAg水平≤3000 IU/mL。报道称这是首个获批用于慢性乙肝的ASO药物，也是首个在III期研究中证明可实现功能性治愈的乙肝新药。