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10月18日周日
10月6日周二
9月24日周四
  1. Bluesky:Martin Steinegger 🇺🇦 (@martinsteinegger.bsky.social)80

    AlphaFold Database 扩展至疫情准备,预测 2812 个病毒蛋白组的约 170 万个二聚体

    AlphaFold Database 正与 NVIDIA、DeepMind、EBI 等合作扩展至疫情准备方向,对 2,812 个病毒蛋白组中的约 170 万个同源与异源二聚体做了穷举预测,其中 8,028 个为高置信度预测。相关结果发布在 research.nvidia.com/labs/dbr/ass...,并可在 alphafold.ebi.ac.uk 查看。

    推荐理由:AlphaFold Database 把病毒蛋白互作预测扩展到 2,812 个病毒蛋白组,可了解结构预测在疫情准备中的覆盖范围。

9月8日周二
  1. Žiga Avsec78

    DeepMind 发布 AlphaGenome Atlas,预测人类基因组全部 90 亿个 SNV 的调控影响

    DeepMind 团队发布 AlphaGenome Atlas,用 AlphaGenome 预测了人类基因组中全部 90 亿个可能的 SNV 的调控影响,并开发了可浏览该预测图谱的门户网站。作者称与多位科学家合作完成了分析与应用,同时提供了博客和预印本链接。

    推荐理由:用 AlphaGenome 对全基因组 90 亿个 SNV 做调控影响预测并开放浏览门户,为变异解读提供了一张可检索的预测图谱。

7月28日周二
6月9日周二
  1. AlphaFold 3:GitHub Releases78

    AlphaFold 3 发布 v3.0.3,代码许可证改为 Apache 2.0

    AlphaFold 3 发布 v3.0.3,代码许可证从 CC BY-NC-SA 4.0 改为 Apache 2.0,并兼容 Python 3.14。该版本还带来性能改进:Confidences JSON 序列化最高提速 30 倍,5000 残基输入的序列化时间从 43 s 降至 1.3 s,mmCIF 解析提速 4%。

    推荐理由:许可证从非商用协议改为 Apache 2.0,并给出大输入序列化提速的具体数字,可据此判断能否商用与升级。

4月20日周一