tangermeme 合并 DeepLIFT/SHAP 扩展
Jacob Schreiber 宣布,已将 Valeh Amiri 和 R. Rastogi 对 DeepLIFT/SHAP 的扩展合并进 tangermeme,使其可运行于各类模型,并同步更新了 tangermeme skill 以指导 agent 使用。
Jacob Schreiber 宣布,已将 Valeh Amiri 和 R. Rastogi 对 DeepLIFT/SHAP 的扩展合并进 tangermeme,使其可运行于各类模型,并同步更新了 tangermeme skill 以指导 agent 使用。
Google Research 以 Google Earth AI 的 Population Dynamics Foundation Model(PDFM)为概念验证,展示无需任务微调的位置嵌入可直接接入现有流行病学模型。
AlphaFold Database 正与 NVIDIA、DeepMind、EBI 等合作扩展至疫情准备方向,对 2,812 个病毒蛋白组中的约 170 万个同源与异源二聚体做了穷举预测,其中 8,028 个为高置信度预测。相关结果发布在 research.nvidia.com/labs/dbr/ass...,并可在 alphafold.ebi.ac.uk 查看。
推荐理由:AlphaFold Database 把病毒蛋白互作预测扩展到 2,812 个病毒蛋白组,可了解结构预测在疫情准备中的覆盖范围。
DeepMind 团队发布 AlphaGenome Atlas,用 AlphaGenome 预测了人类基因组中全部 90 亿个可能的 SNV 的调控影响,并开发了可浏览该预测图谱的门户网站。作者称与多位科学家合作完成了分析与应用,同时提供了博客和预印本链接。
推荐理由:用 AlphaGenome 对全基因组 90 亿个 SNV 做调控影响预测并开放浏览门户,为变异解读提供了一张可检索的预测图谱。
AlphaFold 3 v3.0.4 让模型可在纯 CPU 机器和 Apple Silicon 上运行,其中 Apple Silicon 可利用 GPU 加速推理。
AlphaFold 3 发布 v3.0.3,代码许可证从 CC BY-NC-SA 4.0 改为 Apache 2.0,并兼容 Python 3.14。该版本还带来性能改进:Confidences JSON 序列化最高提速 30 倍,5000 残基输入的序列化时间从 43 s 降至 1.3 s,mmCIF 解析提速 4%。
推荐理由:许可证从非商用协议改为 Apache 2.0,并给出大输入序列化提速的具体数字,可据此判断能否商用与升级。
AlphaFold v3.0.2 发布,开箱支持 NVIDIA Blackwell GPU,并借助 Tokamax 实现 flash attention 与 SwiGLU。