PandaOmics 新增单细胞特征 Agent 技能
Insilico Medicine 的 PandaOmics 上线单细胞特征 Agent 技能，可检索其收录的 1,700 多个 scRNA-seq 数据集。用户以类风湿关节炎及 S100A8、S100A9、IL1B、TNFAIP3、JAK3、IRF1 等基因提问，Agent 自动定位数据集、区分病例与对照组并比较各细胞类型表达。
#产品更新
Insilico MedicineAI 评分4040 Bluesky：Martin Pacesa (@martinpacesa.bsky.social)AI 评分5858 BindCraft2 v1.0.4 发布，改进 VHH、scFv 与诱导契合靶向设计
BindCraft2 v1.0.4 已发布，显著改进了 VHH、scFv、ARP 和诱导契合（induced fit）靶向设计，同时提升了运行速度和代码稳定性。作者建议此前失败的困难设计任务可以重新尝试，并致谢 @erikmaeots、Leonardo Tredese 和 @liza-ch 的工作。
10x GenomicsAI 评分2222 10x Genomics 推出 Atera 与桌面版 Explorer
10x Genomics 宣布 Atera 已上线，并随新数据集持续更新；同时推荐使用新的桌面版 10x Genomics Explorer 软件，查看 FFPE 人类肾脏样本在空间全转录组分析中的结果。
Pushmeet Kohli精选AI 评分6060 Google DeepMind 将 Antigravity 编码智能体扩展至科研流程，并推出科研积分计划
Google DeepMind 将编码智能体 Antigravity 与 Gemini 模型及 AlphaFold、AlphaGenome 等科学专用模型、Biomolecular Structure Viewer 等新界面整合，用于加速端到端科研流程。
推荐理由：Google DeepMind 把 Gemini 编码智能体与 AlphaFold 等科学模型整合成科研工作流，并给出抗菌肽发现的实例，可了解 AI 智能体在科研流程中的落地方式。
Google Research BlogAI 评分3838 Google Research 2026 年十大研究进展：Google Earth AI、Deep Review 与 TimesFM 等
Google Research 在 Research@ 活动上公布 10 项进展，包括扩展 Google Earth AI 早期访问、向公众开放 Deep Review、将 TimesFM 与 TabFM 接入 Gemini for business。
Illumina精选AI 评分7272 Illumina 发布 BioInsight 平台，整合 DRAGEN 与 Emedgene 并引入 SpliceAI2 模型
Illumina 发布 BioInsight 平台，将 DRAGEN、Emedgene、Connected Multiomics、BaseSpace 等工具整合到统一的软件环境中。
推荐理由：Illumina 把 DRAGEN、Emedgene 等工具整合进统一平台，并加入面向基因组与多组学的 AI 模型，可了解测序分析软件的组织方式变化。
公众号：英矽智能精选AI 评分5858 英矽智能 Pharma.AI 2026 秋季发布：MMAI Gym、专业模型与 MCP 连接器
英矽智能在 2026 年 Pharma.AI 秋季网络研讨会上展示了 MMAI Gym 科学后训练与评估框架、五款专业模型、DDD Benchmark 与 O3DC 基准索引，以及 MCP 连接器。
推荐理由：英矽智能一次性展示了从后训练框架、专业模型到 MCP 接入的完整链路，可据此了解 AI 智能体编排药物发现的具体形态。
Google DeepMind BlogAI 评分4040 Google DeepMind 开始广泛部署 Gemini 4 Argon，并发布安全与安保报告
Google DeepMind 开始广泛部署 Gemini 4 Argon，并扩大 Fairwind Program 的受信任网络安全防御者范围。该模型在 12 个端到端模拟网络攻击场景中全部通关（上一代为 5 个），Wiz 曾用其发现医院软件中此前模型遗漏的严重漏洞。公司同步发布安全与安保报告，称对抗性测试中违规请求减少近两倍，外部生物越狱红队仅能解锁不到 1% 的生物子任务。
Google DeepMind Blog精选AI 评分5858 Google DeepMind 发布 Gemini 4 Argon 前沿模型
Google DeepMind 发布 Gemini 4 Argon，面向开发者、企业和科研人员开放，API 定价为每百万输入 token 2 美元、每百万输出 token 10 美元，缓存输入 token 享 95% 折扣。
推荐理由：Gemini 4 Argon 展示了通用前沿模型在酶设计、罕见病基因组分析和量子化学代码优化上的具体落地案例，可供关注 AI for Science 的读者参考。
Ensembl BlogAI 评分5656 Ensembl 新版 FTP 将停用按物种名组织的目录结构
Ensembl 宣布新版 FTP 空间中按物种名组织的目录结构将在两周内停用，此前发布的全部基因组文件仍可在 GCA 或 GCF 子目录下访问。官方同时提供 JSON manifest 文件，列出基因组注释数据及其位置，目录结构与文件类型的说明见 FTP 下载文档。
Ensembl BlogAI 评分4242 Ensembl 2015 年及更早的四个归档版本即将退役
Ensembl 将退役 2015 年及更早的四个归档站点，包括 Ensembl 80（小鼠 GRCm38 注释）、Ensembl 77（斑马鱼 Zv9 注释）、Ensembl 75（人 GRCh37 注释）和 Ensembl 54（人 NCBI36、斑马鱼 Zv8 注释）。这些站点及其工具（含 BioMart 访问）将不再可用，但对应数据文件仍可通过 FTP 获取。
Google Health Blog精选AI 评分6767 Google Earth AI 联合全球卫生伙伴，用地理空间模型预测疾病暴发
Google Research 与 Google Health 发布与全球卫生伙伴合作的新研究论文，展示 Google Earth AI 结合卫星影像、移动数据和 AlphaEarth Foundations、Population Dynamics Foundation Model（PDFM）等基础模型，用于疾病预测与公共卫生决策。
推荐理由：Google Earth AI 与 WHO、INRB 等机构合作，把地理空间模型用于埃博拉、霍乱、登革热等疾病预测，展示了公共卫生从被动响应转向主动预防的路径。
Bluesky：Nils Homer (@nilshomer.com)AI 评分5858 bwa-mem3 比原版快 6-8 倍，速度已与 minibwa 相当
bwa-mem3 现在比原版 bwa 快 6-8 倍，速度已与 minibwa 相当。作者 Nils Homer 以此询问读者为何还没有改用 bwa-mem3，帖中未给出测试数据、版本号或代码链接。
Seurat：GitHub Releases精选AI 评分7272 Seurat v5.6.0 发布，新增线程控制并加速核心分析步骤
Seurat 发布 v5.6.0，新增 setThreads 和 getThreads 控制支持的 C++ 内核与 uwot UMAP 后端线程。
推荐理由：新版本把归一化、降维、聚类和整合等常用步骤改为多线程 C++ 实现，并修复了 BPCells 磁盘型数据的打分问题，做单细胞分析的读者可据此判断是否升级。
Max JaderbergAI 评分2222 IsoDDE：Isomorphic Labs 的生成式设计智能体可视化
Isomorphic Labs 的 Max Jaderberg 展示了团队日常使用的生成式设计智能体 IsoDDE，它接收药物设计者的目标后自主产出帕累托最优分子集合。可视化呈现了智能体在化学空间（UMAP 展示）中平衡探索与利用时的注意力热图，颜色越绿表示分子越优。推文仅抽取一个帕累托最优分子作示例，后续视频将展示规模化应用。
Bluesky：Nils Homer (@nilshomer.com)AI 评分5555 bwa-mem3 v0.12.0 发布，Arm 与 x86 上比对提速
bwa-mem3 v0.12.0 发布，相比 v0.10.0 在 Arm 和 x86 上均提速，--fast 模式约为 minibwa 的 2 倍，默认模式在 x86 上差距约 15%，同时保持 --compat 下输出字节一致。该版本还带来约 30–40% 的甲基化分析提速，并进行了一次大规模内存安全改进。代码与发布说明见 github.com/fg-labs/bwa-mem3。
ColabFold：GitHub ReleasesAI 评分6262 ColabFold 1.6.3 发布：支持 pip 安装并新增接口评分
ColabFold 1.6.3 发布，现在可以完全通过 pip 安装，本地安装不再需要 conda，kalign、hhsearch 和 openmm 也可从 pip 获取。
Scanpy：GitHub ReleasesAI 评分3838 Scanpy 1.13.0a2 发布
Scanpy 发布 1.13.0a2 预发布版本。原文未披露该版本的具体功能变更、修复内容或数据与代码公开情况。
Scanpy：GitHub ReleasesAI 评分2020 Scanpy 1.12.4 发布
Scanpy 发布 1.12.4 版本，为这一单细胞分析工具的补丁更新。原文未披露具体修复内容与新增功能。
AlphaFold 3：GitHub ReleasesAI 评分6262 AlphaFold 3 发布 v3.0.4，支持纯 CPU 与 Apple Silicon 运行
AlphaFold 3 v3.0.4 让模型可在纯 CPU 机器和 Apple Silicon 上运行，其中 Apple Silicon 可利用 GPU 加速推理。
Scanpy：GitHub ReleasesAI 评分4242 Scanpy 1.13.0a1 发布
Scanpy 发布 1.13.0a1 版本。该版本为 GitHub Releases 上的预发布版本，具体更新内容原文未列出。
ColabFold：GitHub ReleasesAI 评分5656 ColabFold 1.6.2 发布，新增 Pallas/Triton Evoformer 内核
ColabFold 1.6.2 发布，新增 --use-pallas 参数，用融合的 Pallas/Triton 内核运行 Evoformer，预测速度约提升 2.5 倍且内存占用略降，需要计算能力 8.0（Ampere）及以上的 NVIDIA GPU。
AlphaFold 3：GitHub Releases精选AI 评分7878 AlphaFold 3 发布 v3.0.3，代码许可证改为 Apache 2.0
AlphaFold 3 发布 v3.0.3，代码许可证从 CC BY-NC-SA 4.0 改为 Apache 2.0，并兼容 Python 3.14。该版本还带来性能改进：Confidences JSON 序列化最高提速 30 倍，5000 残基输入的序列化时间从 43 s 降至 1.3 s，mmCIF 解析提速 4%。
推荐理由：许可证从非商用协议改为 Apache 2.0，并给出大输入序列化提速的具体数字，可据此判断能否商用与升级。
Seurat：GitHub ReleasesAI 评分2222 Seurat v5.5.0 发布：新增 BPCells 回归支持与多项可视化参数
Seurat 发布 v5.5.0，为 BPCells 的 IterableMatrix 在 ScaleData 中新增 vars.to.regress 与 latent.data 支持。
AlphaFold 3：GitHub ReleasesAI 评分3030 AlphaFold v3.0.2 发布：支持 NVIDIA Blackwell GPU 并提升 MSA 搜索性能
AlphaFold v3.0.2 发布，开箱支持 NVIDIA Blackwell GPU，并借助 Tokamax 实现 flash attention 与 SwiGLU。
Gunnar RätschAI 评分5858 Metagraph 网站完成优化，可在 17PB 索引序列中约 3 分钟完成搜索
Gunnar Rätsch 表示团队近期发表了 Metagraph，并优化了网站以让更多用户稳定高效地使用，新增 AI summary/tax. id 功能。在单台服务器上搜索 17PB 索引序列约需 3 分钟，作者附上了 Nature 论文链接和在线检索示例。