Isomorphic Labs 能否凭 AlphaFold 颠覆制药业?
Thrive Capital 团队历时 18 个月游说 Alphabet 旗下 AI 实验室衍生公司 Isomorphic Labs,争取在其未主动融资时入股。Isomorphic Labs 以蛋白质建模工具 AlphaFold 为核心,该工具曾获诺贝尔化学奖,公司目标是将该技术转化为新药研发引擎。其能否兑现这一承诺仍待观察。
Thrive Capital 团队历时 18 个月游说 Alphabet 旗下 AI 实验室衍生公司 Isomorphic Labs,争取在其未主动融资时入股。Isomorphic Labs 以蛋白质建模工具 AlphaFold 为核心,该工具曾获诺贝尔化学奖,公司目标是将该技术转化为新药研发引擎。其能否兑现这一承诺仍待观察。
Jacob Schreiber 宣布,已将 Valeh Amiri 和 R. Rastogi 对 DeepLIFT/SHAP 的扩展合并进 tangermeme,使其可运行于各类模型,并同步更新了 tangermeme skill 以指导 agent 使用。
傅剑锋借威尔逊《创造的本源》提出,人文社科应从“人是万物的尺度”转向“万物是人的尺度”,以演化生物学、神经科学、人类学、数学与 AI 通识重建地基。AI 正把跨学科知识的“翻译成本”压到近零,2024 年“维苏威挑战”用机器学习首次从 CT 扫描中识读出赫库兰尼姆古卷成段文字。但工具只降低门槛,不能替代好奇心、耐心与判断力。
Google 研究团队在博客中介绍三项工作,目标是打通 AI 计算探索与真实湿实验之间的循环。VERID 框架基于开源 PyLabRobot,为实验室工作单元建立可实时更新的 3D 语义数字孪生,支持 3D 状态追踪、秒级虚拟试运行、硬件安全检查与视频和动作日志同步,并在案例中让 agent 从读板机故障中恢复、把染料混合物重建准确率提升五倍以上。
推荐理由:Google 研究团队把实验室自动化、aptamer 闭环筛选和蛋白结合子设计串成一条路线,可看 AI agent 进入湿实验的整体思路。
Google DeepMind 将编码智能体 Antigravity 与 Gemini 模型及 AlphaFold、AlphaGenome 等科学专用模型、Biomolecular Structure Viewer 等新界面整合,用于加速端到端科研流程。
推荐理由:Google DeepMind 把 Gemini 编码智能体与 AlphaFold 等科学模型整合成科研工作流,并给出抗菌肽发现的实例,可了解 AI 智能体在科研流程中的落地方式。
Google DeepMind 发布 Google Antigravity 智能体科研工作台,把跨数据库检索、结构评估和候选优先级排序压缩到单次会话中。文中演示了研究者与智能体协作,在 Streptococcus pseudopneumoniae 中找到一个预测对呼吸道感染相关病原体有活性的新型抗菌肽候选,该候选目前正在进行湿实验验证。
推荐理由:Google Antigravity 把跨库检索、结构查看与功能预测放进同一会话,展示了抗菌肽候选的发现流程。
Google DeepMind 的 AI 内容水印技术 SynthID 入选《时代》2026 年度最佳发明。该技术可在内容生成时嵌入不可感知水印,投入使用三年已为超 1800 亿张图像和视频、24 万年时长音频添加水印,并已将水印原理扩展至生物学领域,推出 SynthID Bio。用户可通过 synthid.com 试用 SynthID Universal Detector。
Google 公开发布 Deep Review,一个面向复杂技术文档的智能体审阅系统,可检查逻辑一致性、数学陈述、事实依据并与已有工作比较。系统采用文档分段、自适应算力分配、并行分段核查与全局综合四阶段流程,并已加入 Gemini 4 Argon 支持。
推荐理由:该工具用四阶段智能体流程做长文档审阅,并公开了与四个会议试点中超过 1.6 万篇稿件的反馈经验。
Google 为 Earth AI 的地理空间推理智能体发布技术报告,在 CBGB、UnivEARTH 及自研的 GeoExpertQueries、GeoKTools 四个基准上评测,量化专用工具与前置规划相对通用 LLM 的价值。
Google Research 在 Research@ 活动上公布 10 项进展,包括扩展 Google Earth AI 早期访问、向公众开放 Deep Review、将 TimesFM 与 TabFM 接入 Gemini for business。
Google DeepMind 开始广泛部署 Gemini 4 Argon,并扩大 Fairwind Program 的受信任网络安全防御者范围。该模型在 12 个端到端模拟网络攻击场景中全部通关(上一代为 5 个),Wiz 曾用其发现医院软件中此前模型遗漏的严重漏洞。公司同步发布安全与安保报告,称对抗性测试中违规请求减少近两倍,外部生物越狱红队仅能解锁不到 1% 的生物子任务。
Google DeepMind 的 Vivek Natarajan 表示,Gemini 4 Argon 对该团队在科学与医学方面的工作影响显著,并引用 Pushmeet 的说法称其在模型性能上出现阶跃式变化,近几周对团队及外部合作者的科学项目产生了影响。团队同时宣布面向科学家的早期访问计划,可通过 Google 表单申请在 antigravity 中获得 Gemini 4 Argon 的最高档访问权限,申请链接为 https://forms.gle/WvmBbPvRbpKG1BPn9。
推荐理由:Google DeepMind 公布 Gemini 4 Argon 在科研与医学项目中的使用反馈,并开放科学家早期访问申请,可了解该模型在生命科学场景的定位。
Google DeepMind 发布 Gemini 4 Argon,面向开发者、企业和科研人员开放,API 定价为每百万输入 token 2 美元、每百万输出 token 10 美元,缓存输入 token 享 95% 折扣。
推荐理由:Gemini 4 Argon 展示了通用前沿模型在酶设计、罕见病基因组分析和量子化学代码优化上的具体落地案例,可供关注 AI for Science 的读者参考。
Google 回顾其健康研究布局,称过去五年团队发表了 90 篇经同行评审的疾病相关论文,累计被引用超过 9 万次。
推荐理由:Google 汇总了 AlphaFold、AlphaGenome Atlas 等模型在疾病检测与药物发现上的落地案例,可快速了解其健康研究布局。
Google 团队一项对话式诊断 AI 系统的真实世界临床研究在 The Lancet 发表,作者 Vivek Natarajan 回顾了从 2022 年接触 LaMDA 和 PaLM、到 2023 年 AMIE 模型自博弈训练、再到与 Beth Israel Deaconess 医疗中心合作开展前瞻性临床试验的历程。
推荐理由:作者以当事方视角复盘这项真实世界临床研究从模型自测到前瞻试验的推进过程,并给出安全性数据。
Google 与 Beth Israel Deaconess Medical Center(BIDMC)在《柳叶刀》发表 AMIE 诊断 AI 聊天机器人真实门诊研究,98 例患者在就诊前先与 AMIE 对话,监督医生实时监控,没有一次对话因预设安全标准被中断。
推荐理由:在真实门诊中,98 例患者先与诊断 AI 对话,医生实时监督,结果无一次因安全标准被中断,可对照 AI 问诊的落地边界。
Google DeepMind 与 Caltech 的 Arnold 实验室、匹兹堡大学 Lui 实验室合作提出 AlphaProtein Novo(AP Novo)从头设计流程,在 5 类反应、5000 多个实验设计中显示其命中率可与天然酶序列挖掘相比。
推荐理由:AlphaProtein Novo 把扩散生成骨架、LigandMPNN 序列设计与 AlphaFold3 校验串成流程,在 5000 多个实验设计中与天然酶比较。
Isomorphic 宣布与美国能源部(DOE)和 NIH 建立重大合作,目标是生成构建准确细胞 AI 模型所需的数据。
推荐理由:美国能源部与 NIH 联合多家机构启动虚拟生物学计划,读者可了解细胞预测模型的数据来源与参与方。
Biohub 与美国能源部、NIH 及新资助伙伴宣布扩展虚拟生物学计划(Virtual Biology Initiative),合计投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术。
推荐理由:这项跨机构投入给出了资金分配与数据标准化分工,可看清虚拟细胞所需开放数据从哪来、由谁整合。
Google Research 以 Google Earth AI 的 Population Dynamics Foundation Model(PDFM)为概念验证,展示无需任务微调的位置嵌入可直接接入现有流行病学模型。
Anthony Gitter 表示难以理解水印如何强化全球生物安全,认为 DNA 合成商验证客户用封闭"可信工具"生成序列有其道理,但质疑水印相比数字签名有何优势,并附上相关综述。
Brian Hie 表示,团队解析的 Evo-Φ36 冷冻电镜结构在 PDB 成立 55 周年的"月度分子"文章中获重点介绍,并致谢 David Li、Samuel King、Driscoll 和 Max Wilkinson 的工作。
一条 Bluesky 帖文称,用 Amber 简单跑一遍就能去除 Google DeepMind SynthID Bio 嵌入 AI 生成蛋白序列与预测三维结构中的水印。该帖质疑这一概念验证为何能成为 Nature 论文并被称为重大新闻,认为其在安全性上提供不了什么。原文链接指向 SynthID Bio 在三个靶点的湿实验测试。
Google DeepMind 发布 SynthID Bio,将水印技术用于合成生物学,在蛋白序列和 AlphaFold 3 预测的 3D 结构中嵌入可检测签名,同时保持生物功能。
推荐理由:DeepMind 把水印从数字内容延伸到蛋白序列与结构,并给出湿实验验证,对关注生物安全与 AI 设计溯源的研究者提供了可参考的技术路径。
AlphaFold Database 正与 NVIDIA、DeepMind、EBI 等合作扩展至疫情准备方向,对 2,812 个病毒蛋白组中的约 170 万个同源与异源二聚体做了穷举预测,其中 8,028 个为高置信度预测。相关结果发布在 research.nvidia.com/labs/dbr/ass...,并可在 alphafold.ebi.ac.uk 查看。
推荐理由:AlphaFold Database 把病毒蛋白互作预测扩展到 2,812 个病毒蛋白组,可了解结构预测在疫情准备中的覆盖范围。
DeepMind 团队发布 AlphaGenome Atlas,用 AlphaGenome 预测了人类基因组中全部 90 亿个可能的 SNV 的调控影响,并开发了可浏览该预测图谱的门户网站。作者称与多位科学家合作完成了分析与应用,同时提供了博客和预印本链接。
推荐理由:用 AlphaGenome 对全基因组 90 亿个 SNV 做调控影响预测并开放浏览门户,为变异解读提供了一张可检索的预测图谱。
AlphaFold 3 v3.0.4 让模型可在纯 CPU 机器和 Apple Silicon 上运行,其中 Apple Silicon 可利用 GPU 加速推理。
AlphaFold 3 发布 v3.0.3,代码许可证从 CC BY-NC-SA 4.0 改为 Apache 2.0,并兼容 Python 3.14。该版本还带来性能改进:Confidences JSON 序列化最高提速 30 倍,5000 残基输入的序列化时间从 43 s 降至 1.3 s,mmCIF 解析提速 4%。
推荐理由:许可证从非商用协议改为 Apache 2.0,并给出大输入序列化提速的具体数字,可据此判断能否商用与升级。
AlphaFold v3.0.2 发布,开箱支持 NVIDIA Blackwell GPU,并借助 Tokamax 实现 flash attention 与 SwiGLU。