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10月16日周五
10月12日周一
  1. Wellcome Sanger Institute News88

    Wellcome Sanger Institute 加入国际合作,为预测疾病的 AI 模型构建基础数据

    Biohub、美国能源部(DOE)、美国国立卫生研究院(NIH)等资助方宣布扩大一项国际合作,共同投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术,用于生成并开放可用于预测生物学 AI 模型的数据。Wellcome Sanger Institute、Human Cell Atlas、Human Protein Atlas、Allen Institute、Broad Institute 和 Gladstone Institutes 等机构参与其中,作为 Virtual Biology Initiative 的一部分推进。

    推荐理由:这项跨国计划把测量技术、开放数据和标准化接口放在一起,可用来观察虚拟细胞类基础模型的数据底座如何搭建。

  2. Europe PMC45

    AI 驱动的 RNA 药物设计综述:从分子优化到系统级评估

    这篇综述从分子优化与系统级评估的衔接角度梳理 AI 驱动的 RNA 药物设计,比较 siRNA、反义寡核苷酸、适配体、mRNA 和翻译导向 circRNA 各自的设计约束,并评估序列模型、生成模型和结构感知模型的能力与局限。

    推荐理由:综述把 RNA 药物设计从分子优化延伸到系统层面评估,梳理了不同 RNA 模态的设计约束与虚拟细胞的定位。

10月7日周三
  1. Biohub88

    Biohub 联合 DOE、NIH 与产业伙伴投入 18 亿美元扩展虚拟生物学计划

    Biohub 与美国能源部、NIH 及新资助伙伴宣布扩展虚拟生物学计划(Virtual Biology Initiative),合计投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术。

    推荐理由:这项跨机构投入给出了资金分配与数据标准化分工,可看清虚拟细胞所需开放数据从哪来、由谁整合。

10月6日周二
  1. Arc Institute78

    Arc Institute 发布虚拟细胞模型 PIE,用人工整理生物知识预测未见条件下的扰动响应

    Arc Institute 发布虚拟细胞模型 PIE(Perturbation is Everything),把 Cellosaurus、NCBI、Gene Ontology、DepMap、PubChem 等人工整理知识转成 token 输入,直接预测扰动后群体水平的差异表达基因、方向与幅度。

    推荐理由:PIE 把人工整理的生物知识库转成输入,在未见扰动和细胞系上仍能预测差异表达,可看知识源如何影响泛化。

10月1日周四
  1. Arc Institute78

    Arc Institute 为 2026 虚拟细胞挑战赛生成跨六种细胞系的 Perturb-seq 数据

    Arc Institute 为 2026 虚拟细胞挑战赛生成了覆盖六种细胞系的 Perturb-seq 数据,任务从去年的同细胞系少样本预测升级为跨细胞系的零样本预测。

    推荐理由:Arc 披露 2026 虚拟细胞挑战赛数据集的生成与质控细节,可了解跨细胞系 Perturb-seq 数据如何做到一致可比。

9月22日周二
9月20日周日
9月17日周四
  1. Europe PMC38

    超越以药物为中心的视角:推进用于环境扰动建模的 AI 虚拟细胞平台

    一篇综述指出,当前 AI 虚拟细胞(VC)框架侧重遗传与药物扰动,环境扰动因数据可得性、化学空间覆盖和表征设计的结构性限制而建模不足。文章梳理了扰动预测模型从数学模型到深度学习与基础模型的演进,评估了基因组、转录组、蛋白组、代谢组和表型组等多模态 VC 进展,并提出标准化环境扰动数据集、多模态架构、不确定性感知评估指标和面向监管的基准框架,以推动计算模拟扰动与替代动物测试的 3Rs 范式。

7月9日周四
  1. Biohub60

    Biohub 联合创始人 Priscilla Chan 回顾蛋白建模、细胞成像与患者驱动研究进展

    Biohub 联合创始人 Priscilla Chan 发文回顾今年上半年进展,包括 5 月发布基于下一代 ESM 的蛋白质生物学世界模型,可预测蛋白折叠、相互作用与功能并设计新蛋白,已有科学家用它设计抗体候选并在早期实验室测试中针对癌症和免疫相关靶点显示初步结果。

    推荐理由:Biohub 联合创始人以第一人称复盘半年进展,把蛋白世界模型、激光相位板与虚拟细胞计划串成一条开放科学路线。