研究在大鼠中鉴定出一条独立于糖皮质激素控制记忆特异性的前额叶通路。作者用光遗传学操作发现，训练后抑制 rostral prelimbic cortex（rPL）到 anteroventral bed nuclei of the stria terminalis（avBST）的通路，会在抑制性回避辨别任务中促进情境泛化，但不影响记忆强度；该操作虽进一步升高皮质酮，在肾上腺切除大鼠中仍产生泛化，说明其不依赖糖皮质激素。反向地，训练后兴奋该通路增强情境辨别。
研究团队基于 632 例 ALS 患者和 160 例健康对照的血浆样本，使用 NULISA CNS 与 Inflammation Panel 检测蛋白，并结合 XGBoost、嵌套交叉验证和 SHAP 筛选疾病相关蛋白，最终确定由 NEFL、FOLR1、pTau-181、TREM1、VEGFA、NEFH、CALCA、NRGN、LAMP3 和 PTX3 组成的 10 蛋白组合。该组合在包含 144 例 ALS 患者和 37 例对照的独立验证队列中取得平衡准确率 98.3%、AUC 0.992 的分类表现。
推荐理由：在 632 例 ALS 患者与 160 例对照中筛出 10 蛋白组合，并在独立队列验证，为血液筛查提供了可复现的候选方案。
一种前噬菌体编码的抗噬菌体防御系统 TERi 通过靶向入侵噬菌体的末端酶复合体，阻止其 DNA 转入前衣壳，从而抑制 DNA 包装。该系统由防御蛋白 TerI 与两个自我免疫蛋白 anti-TerI1、anti-TerI2 组成，见于 Listeria monocytogenes；TerI 不阻断裂解周期，细菌裂解后释放的是未包装、无感染性的前衣壳。anti-TerI1 和 anti-TerI2 在前噬菌体诱导时抵消 TerI 的作用，保障病毒粒子产生。TERi 在李斯特菌噬菌体中普遍存在，可在种群层面保护宿主，同时不影响前噬菌体自身的裂解生命周期。
果蝇胚胎巨噬细胞吞噬凋亡小体时，被吞入的凋亡小体会使细胞核凹陷变形，吞噬作用同时升高 Lamin B 水平；沉默 Lamin B 或 LINC 复合体组分则负向调控体内凋亡小体的吞噬。研究结合遗传操作与活体成像，在体内证实吞噬体诱导的核分子与力学适应是果蝇胚胎巨噬细胞持续摄取凋亡小体的关键，揭示了核可塑性在体内调控巨噬细胞吞噬能力中的作用。
研究鉴定出两种细菌防御系统 TFAD1 和 TFAD2，前者含丝氨酸蛋白酶，后者含 Ser/Thr 激酶，分别通过蛋白降解和磷酸化作用于噬菌体长尾纤维蛋白。两者都允许噬菌体完成完整复制周期，但产生的子代无感染能力，作者将这种不同于经典流产感染的机制称为被动流产感染（passive Abi）。该结果揭示了蛋白酶和激酶介导的噬菌体结构蛋白失活方式，为理解细菌与噬菌体的分子军备竞赛提供线索。
研究分析了2024年马约特岛霍乱暴发中活减毒口服霍乱疫苗CVD 103-HgR（Vaxchora）的真实世界效果，重点考察发病率与接种率均较高的Koungou村。该村4733名高危人群中3354人（71%）接种了该疫苗，2024年4月19日至7月7日共确诊77例病例。作者构建多种随机模型并按接种状态拟合每日病例数，估计基线基本传染数R0为1.5（95% CrI：1.2, 1.9），疫苗预防霍乱的有效性为87%（95% CrI：74, 99），在不同情景下保持在75%至91%之间。
东北大学研究团队对年轻（3月龄）与高龄（19月龄）雄鼠所孕小鼠胚胎的端脑进行RNA-seq，发现父龄对胚胎脑基因表达的影响因胚胎性别而异，高龄父龄雌性胚胎呈现独特的基因表达谱并倾向表达水平升高。研究按性别分别分析并控制发育时间窗以减少变异，数据发表于Scientific Data，为探究父龄与ASD风险的性别依赖机制提供资源。
低剂量LSD对持续注意力的影响存在性别差异，女性显示出部分认知益处，男性则未见。该结果提示低剂量致幻剂的作用需按性别分别研究。
研究发现科学家的经验与其想法的持久影响力之间存在关联：资深科研人员提出的“颠覆性”想法少于新手科学家，但他们的想法更持久。
香港科技大学等机构的研究发现，FAM193B启动子区一段CCG重复序列的长度与阿尔茨海默病易感性相关，成果发表于Nature Neuroscience。
日本大阪大学桥本浩介团队发现，110岁及以上老人体内CD4细胞毒性T淋巴细胞（CD4 CTLs）占比达18%，百岁老人约10%，低于100岁者约4%。研究招募28名受试者（8位70-90岁、10位100-109岁、10位110岁以上），部分百岁老人样本中单个克隆系占CD4 CTLs的53.8%，约30个受体序列与癌症患者数据库匹配，以肺癌最常见。
经典分子动力学模拟显示，MBD2 从目标位点下游一个碱基对位置在微秒内迁移至甲基化 CpG 靶位点，并结合为两种稳定构象：一种接近 X 射线晶体结构，另一种亲和力降低但保持对 mCpG 的选择性。S189 被确定为关键宏观开关，其与甲基胞嘧啶骨架相互作用的丧失使平衡偏向次态；S189A 突变体模拟、NMR 与荧光偏振实验均支持该突变不改变 mCpG 选择性但降低结合亲和力。
美国哈佛大学 Wyss 研究所团队开发出基于基因表达的新型衰老时钟，并用它筛出基因靶点 SRSF1，动物实验中老年小鼠寿命延长 14%，成果发表在《自然·衰老》。
美国 Triana Biomedicines 公司的 Vito J. Palombella 和 Andrew R. Conery 在 Nature 发表研究，报道了选择性、可穿越血脑屏障的 ALK 分子胶降解剂 TRI-611。
推荐理由：报道的分子胶降解剂绕开ALK激酶活性位点，在耐药与颅内模型中仍有效，为靶向蛋白降解提供了新降解基序的结构依据。
研究对人类配子、二细胞胚胎、八细胞胚胎、囊胚和胚胎干细胞中的 H2AK119ub（H2Aub）进行图谱分析，发现 H2Aub 最早在二细胞阶段于 GC 富集区域出现，随后逐步累积，并在后期集中于 PcG 靶基因。
推荐理由：该研究追踪人胚胎从配子到囊胚的 H2Aub 动态，说明 H2Aub 如何引导 H3K27me3 重建 Polycomb 抑制格局。
神经科学正在绘制妊娠期间大脑变化图谱，但这些变化对未来健康意味着什么尚未确定。
研究发现，dITP 并非通过简单的构象变化激活 Kongming（Kom）系统的 KomBC 复合物，而是通过改变其组装平衡来实现。没有 dITP 时，KomBC 在紧密堆积的寡聚体和松散堆积的纤维之间处于平衡，两者均无活性；dITP 结合到 KomB 后，稳定纤维中紧密堆积的 KomC 核心并让催化残基对齐，从而激活 NAD⁺ 水解。
Zhang 等发现异补骨脂查尔酮靶向去泛素化酶 OTUB1，促进癌细胞中 PD-L1 的泛素化与降解。该调控增强 T 细胞介导的抗肿瘤免疫，重塑肿瘤免疫微环境并抑制肿瘤生长。
一项新工作在 379 个人脑样本中绘制了可变多聚腺苷酸化这一转录后调控层，显示 3′-UTR 选择上的遗传变异与疾病相关位点及下游分子效应相关。可变多聚腺苷酸化通过改变 mRNA 末端影响 mRNA 稳定性、翻译或亚细胞定位，而不一定改变 RNA 丰度。
推荐理由：在 379 个人脑样本中绘制可变多聚腺苷酸化图谱，把 3′-UTR 选择相关的遗传变异与疾病位点及下游分子效应联系起来。
NEJM 刊出 Vo 等人的报告，在一名接受基因治疗的患者椎旁肿瘤中检出 AAV 整合，整合序列保留了 CAG 启动子–增强子并激活了一个发育相关转录因子。Fyodor Urnov 指出这是今年第二例 AAV 驱动插入突变的报告，约 3000 名接受 AAV 治疗者中出现 2 例，比例很低但并非为零，他认为关键在于获益与风险的权衡。
一项发表于 Nature 的研究整合单细胞 RNA 测序、TCR 测序与 Xenium 空间转录组，在高级别癌前气道病变中鉴定出 BATF+ 效应性 Treg 细胞，并构建了淋巴结—循环—气道的跨组织调控轴。
推荐理由：研究把肺癌免疫干预窗口前移到癌前阶段，并用跨组织克隆共享与空间结构给出可追踪的细胞轴。
研究团队用计算方法分析近 1000 例前列腺肿瘤的全基因组测序数据，构建了可能驱动前列腺癌的遗传改变目录，发现 97% 的肿瘤至少携带一个已知或潜在驱动改变。研究识别出四种与不同临床结局相关的基因组亚型，其中两种与显著更高的转移风险相关，并在近四分之一肿瘤中找到现有癌症药物的潜在靶点。
Tufts大学医学院与Boston University团队在PNAS发表研究，用13名健康年轻女性捐赠组织培养的三维乳腺类器官，发现BPA、BPS、BPF在低浓度混合暴露时会扰乱类器官发育，诱导细胞外基质重塑、上皮可塑性和部分上皮-间质转化相关转录程序，并伴随广泛的DNA甲基化重塑。
David Baker 团队组合 RFdiffusion2 的 RFD2-MI、ProteinMPNN、EnhancedMPNN 和 AlphaFold 3 从头设计半胱氨酸蛋白酶与锌蛋白酶，两项结果分别发表于 Nature。
推荐理由：两篇 Nature 论文用 RFdiffusion2、ProteinMPNN 与 AlphaFold 3 组合从头设计蛋白酶，并给出实验验证的成功率与提速幅度。
一对同卵双胞胎姐妹均患由 MN1::ZNF341 基因融合驱动的未分化肉瘤，全基因组测序显示两人所有肿瘤样本都带有双胞胎 A 的遗传标记，提示肿瘤起源于双胞胎 A 的面部并跨胎盘传给双胞胎 B。
德国康斯坦茨大学团队在森林土壤中埋置长链脂肪族聚酯（LCAP）生物塑料薄膜，发现其在约250至330天内被完全降解，而HDPE几乎不降解。研究通过宏基因组与电镜分析发现一种活性位点开口异常宽大的“Pac-Man”酶，可降解特定聚酯和可生物降解塑料，也能分解青霉素，提示其可能与抗生素耐药性相关。成果发表于 The ISME Journal。
美国华盛顿大学蛋白设计研究所（IPD）的 Anqi Chen、Kejia Wu 和 Hojae Choi 从头设计了蛋白酶，这些被称为“分子剪刀”的酶能高精度切割用户指定的目标序列，相关成果本周发表于 Nature。
推荐理由：IPD 团队在 Nature 报告从头设计蛋白酶，可按用户指定序列切割，为蛋白设计提供新的功能实现路径。
研究利用 467,152 份 UK Biobank 基因组构建了全表型结构变异图谱，显示大于 50 bp 的结构变异是人类疾病风险中重要且此前被低估的来源。该资源揭示了与疾病相关的罕见结构变异和调控性结构变异，为理解人类生物学和药物研发提供线索。
推荐理由：基于近 50 万份 UK Biobank 基因组构建的结构变异图谱，把大于 50 bp 的变异与疾病风险系统关联起来，可作为结构变异研究的参考资源。
Jackson Laboratory、耶鲁大学等 10 国合作团队在 Nature 发表 GLASS 联盟研究，对 183 例治疗前后配对取样的 IDH 突变胶质瘤进行分析，发现复发时少突胶质细胞瘤倾向获得新的生长驱动突变，星形细胞瘤则更常发生大规模染色体改变。
推荐理由：GLASS 联盟对 183 例配对样本的分析显示，IDH 突变胶质瘤的两种亚型在复发时走的是不同的基因组演化路径。
一项基于英格兰全国数据的队列研究纳入 1107 例原发性线粒体病患者（中位年龄 48 岁，74% 为线粒体 DNA 诊断、26% 为核基因诊断），遗传诊断后 10 年生存率为 80.3%、20 年为 58.9%，高于此前预期。
一项整合分析追踪了人类从着床前到着床围期发育过程中等位基因DNA甲基化与转录组的动态，发现卵母细胞特异性高甲基化区域在整个早期发育中保持母源偏向的甲基化不对称，而精子特异性区域的父源高甲基化在受精后被抹去、并于着床围期重建。全基因组亲本DNA甲基化水平在胚胎第8至12天、原肠形成之前于所有谱系趋同，但不同基因组元件达到平衡的时间不同；包括SVA和LTR12在内的一部分转座元件持续保持母源高甲基化。研究还鉴定了参与人类早期胚胎发育的亲本来源偏向基因，这些基因富集剂量敏感基因，且外胚层特异的亲本表达偏向与神经发育障碍相关基因有关。
推荐理由：该研究追踪人胚胎着床前后等位基因DNA甲基化与转录组的重编程时序，为理解亲本来源记忆如何保留提供线索。
中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞团队与陈宇航团队在 Nature Plants 在线发表研究，提出结构指导设计与顺式调控优化相结合的等位基因工程策略，创制了除草剂抗性提升的水稻和小麦新种质。
推荐理由：该工作把蛋白结构指导的编码区变异与顺式调控元件整合结合，在水稻和小麦中同时改造 HPPD，为复杂农艺性状改良提供可迁移路径。
地球大脑健康委员会在《Nature Mental Health》发布首份报告，提出未来十年内任何重大环境干预的设计与评估都须纳入心理健康影响评估。报告指出极端天气、空气与噪声污染、城市压力源、生物多样性丧失及社会不平等与焦虑、抑郁、创伤相关障碍和认知衰退风险升高相关，并建议自2027年起将心理健康指标纳入气候计划、环境影响评估和城市政策。
研究团队开发了靶向 NK 细胞的脂质纳米颗粒 NtLNPs，用工程化双靶向 NK 细胞配体驱动受体特异性摄取和 mRNA 递送，在小鼠中实现最高约 80% 的 NK 细胞转染且脱靶效应很小。经系统给药递送 CAR mRNA 可在体内生成 CAR NK 细胞：靶向 CD19 的 CAR NK 细胞在健康小鼠中完全清除循环 B 细胞，靶向 CD3 的 CAR NK 细胞在自身免疫性肝炎模型中清除几乎全部自身反应性 T 细胞，作者据此提出其在 T 细胞驱动疾病上可能优于 CAR T 疗法。
推荐理由：研究用双靶向配体修饰的 LNP 在小鼠体内直接生成 CAR NK 细胞，为体内细胞工程提供了可迁移的递送思路。
六种蛋白组衰老时钟首次被部署到一项临床试验中，研究结果更多揭示了这些时钟本身的特性，而非药物效果。材料未给出试验规模、药物名称及具体结论。
研究团队对 62 例原发胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤进行单细胞 RNA 测序（443,451 个细胞），并对其中 11 例肿瘤匹配空间转录组（53,236 个 spot），同时纳入 6 例化疗前后配对样本，刻画克隆、转录与空间多样性。分析发现同一肿瘤内共存多个遗传上不同的肿瘤克隆，克隆特异的配体-受体程序受基因组剂量调控：配体或受体扩增增强相应互作，缺失则抑制，空间转录组与多重免疫荧光支持这些遗传编码差异。
推荐理由：62 例原发肿瘤的单细胞与空间转录组图谱，把克隆异质性、8q24/MYC 扩增与经典-基底表型转换联系起来。
维也纳大学研究人员重建了章鱼、鱿鱼和乌贼基因组的 3D 组织，发现数亿年前的大规模 DNA 重排把原本分离的染色体区域拉到一起，可能促成新的基因调控网络。研究发表于 Nature Communications，显示染色质结构域在演化中长期稳定，而染色质环在物种、组织和发育阶段间差异明显，且多位于神经系统相关基因附近。作者指出，结果并未证明这些 DNA 变化直接导致头足类智力的演化。
北京大学昌增益团队在Scientific Reports发表研究，提出细菌休眠由氨基酸氧化副产物NH₄⁺与HCO₃⁻协同触发，而非营养耗尽本身。两种代谢物同时存在时才会显著降低ATP水平，解除ATP对FtsZ、FtsA、MinD、AdhE、RplA等蛋白的增溶保护，使其以折叠态相分离组装成复苏延迟体；补充ATP可完全溶解凝聚体并恢复生长。
推荐理由：该研究把细菌休眠的触发从营养饥饿转向NH₄⁺与HCO₃⁻协同耗竭ATP，为理解持留与抗生素耐受提供新框架。
研究发现 ecDNA 是微核的重要来源，复制压力下 ecDNA 发生有丝分裂聚集、不对称分配和错分进入微核，携带 ecDNA^+ 微核的细胞增殖能力下降、更易死亡。单微核测序显示多个不同 ecDNA 种类会汇聚到同一微核中；在 MYCN 扩增的神经母细胞瘤患者中，诊断时 ecDNA^+ 微核频率较高与总生存期改善相关。作者据此提出有丝分裂期 ecDNA 滞留可能成为治疗切入点。
推荐理由：研究把 ecDNA 的微核错分与适合度下降联系起来，并给出神经母细胞瘤患者生存关联，为理解 ecDNA 的代价提供新角度。
Yin、Mou、Tang、Zhao 等人在 Nature 发表研究，显示拟杆菌门来源的奇数链饱和脂肪酸十五烷酸（C15:0）通过抑制 HMG-CoA 还原酶降低胆固醇水平，从而缓解动脉粥样硬化，机制与他汀类似。