Biohub 用全基因组 CRISPR 筛选结合 AI 发现银屑病新药靶点
Biohub 团队对原代人成年皮肤角质形成细胞完成全基因组 CRISPR 筛选,并用基于文献训练的大语言模型 VirtualCRISPR 筛出文献中未被关注的靶点,相关结果发表于 Nature Communications。
推荐理由:用离心递送绕过角质形成细胞转染难题,完成全基因组 CRISPR 筛选,再以语言模型筛出文献未覆盖的靶点。
Biohub 团队对原代人成年皮肤角质形成细胞完成全基因组 CRISPR 筛选,并用基于文献训练的大语言模型 VirtualCRISPR 筛出文献中未被关注的靶点,相关结果发表于 Nature Communications。
推荐理由:用离心递送绕过角质形成细胞转染难题,完成全基因组 CRISPR 筛选,再以语言模型筛出文献未覆盖的靶点。
广州国家实验室汪少伯、商锦赛团队联合山东中医药大学等开发联合用药新策略,发现已上市药物霉酚酸酯(MMF)与鸟苷类核苷类似物(如利巴韦林,RBV)联用可显著增强广谱抗病毒效果,成果发表于Acta Pharmaceutica Sinica B与Emerging Microbes & Infections。
研究利用 cryo-electron tomography(cryoET)结合 AlphaFold 与蛋白质组学,解析了 Physcomitrium patens 胞间连丝的天然组织方式,成果发表于 Nature Plants。研究发现胞间连丝受细胞壁重塑调控而开闭,螺旋状蛋白组装体为内部膜结构提供支架。
Gunnar Rätsch 团队在 bioRxiv 发布关于剪接新抗原(splicing neoepitope)预测可重复性的预印本,发现候选新抗原的生成与过滤方式上的细微选择,会造成新抗原数量和身份上的重大差异。论文链接为 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.09.10.674685v1。
Nicolas Altemose 宣布其实验室发布首个预印本,该工作由 Matt Franklin 主导,在基因组中最神秘的区域有一些意外发现,论文已上传至 bioRxiv。
Gunnar Rätsch 分享了一篇刚完成的预印本手稿,基于更大的 HIRID 数据集预测呼吸衰竭相关方面,并扩展了此前关于循环衰竭的工作。
Trevor Bedford 引用全球健康数据平台(@globaldothealth)汇总的全球猴痘确诊与疑似病例数据,指出随着基于病例的监测上线,病例数初期快速上升,随后增长放缓但仍在持续。
Trevor Bedford 表示,美国境内 BA.4、BA.5 和 BA.2.12.1 的共循环已足以评估这些病毒的相对适合度。
Trevor Bedford 表示,正开始看到 Omicron 出现可能具有影响力的新亚系进化,重点关注 spike 蛋白 452 位残基的突变,并点名纽约的 B.2.12.1 以及南非的 BA.4 和 BA.5。
Nicolas Altemose 等在 Science 发表 T2T 人类基因组研究的最终版论文,聚焦新加入序列中占比最大的部分,即各染色体着丝粒及其周边区域。论文链接为 https://www.science.org/doi/10.1126/science.abl4178。
Trevor Bedford 指出,Omicron 可分为 PANGO 谱系 BA.1 和 BA.2(对应 Nextstrain 分支 21K 和 21L),全球测序样本中 21K 约 63 万、21L 约 1.8 万,但 21L 占比正在上升。
UCSF 的 Kyle 等人通过测试近 2400 个合成免疫受体蛋白,揭示了可用于改进 CAR-T 细胞癌症治疗的新基本规律。该工作以预印本形式发布在 bioRxiv,题为用组合信号基序文库与机器学习探索嵌合抗原受体表型输出的规律。
端粒到端粒(T2T)联盟的着丝粒周边卫星序列团队发布了对人类基因组中 6.2% 序列的详细分析,这部分序列此前约 20 年几乎完全缺失于参考序列。相关预印本已发布在 bioRxiv,链接为 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.12.452052v1。
推荐理由:T2T 联盟对长期缺失的着丝粒周边卫星序列做了系统分析,可了解人类参考基因组补全的具体进展。
Ed Boyden 介绍,膨胀显微镜(Expansion microscopy)可帮助观察卵子形成过程中染色体分离所依赖的、行为类似液体的特殊结构,该工作来自 Max Planck 生物物理化学研究所 Schuh 实验室,发表于 Science。