靶向致癌 SOX2 凝聚体可抑制鳞状细胞癌进展
Luan 等发现 SOX2 凝聚体通过调控染色质组织和致癌基因表达促进鳞状细胞癌(SCC)进展。FDA 已批准的药物 ixazomib 能以依赖 HSP70 的方式选择性破坏 SOX2 凝聚体,提供了一种针对 SCC、可由生物标志物指导的治疗策略。
Luan 等发现 SOX2 凝聚体通过调控染色质组织和致癌基因表达促进鳞状细胞癌(SCC)进展。FDA 已批准的药物 ixazomib 能以依赖 HSP70 的方式选择性破坏 SOX2 凝聚体,提供了一种针对 SCC、可由生物标志物指导的治疗策略。
研究在果蝇中构建了三个 NLGN3 自闭症相关变异(p.R175W、p.R451C、p.R597W)的转基因模型,发现它们对突触与睡眠的影响各不相同。p.R175W 和母源遗传的 p.R451C 主要改变突触形态而对囊泡动态影响很小,p.R597W 则主要改变睡眠与囊泡动态而突触形态影响轻微。
合成小鼠L1(smL1)逆转座效率高于亲本L1spa,并非源于合成ORF序列,而是ORF1p两个非同义替换与3'UTR缺失保守的鸟苷富集区(GRR)共同作用的结果。GRR以位置依赖方式影响天然小鼠L1逆转座,且不涉及mRNA提前多聚腺苷化或插入结构改变,而是通过调节ORF1p丰度实现。smL1对GRR的抑制作用不敏感,可能与其合成ORF序列带来的高效蛋白表达有关。
Li 等人在 Cell Reports Medicine 报告,活化的 CAR-T 细胞会上调 NKG2D 配体(NKG2DL),从而易被 NK 细胞识别。过表达 NKG2D 可屏蔽内源配体,并利用肿瘤 NKG2DL 提供共刺激,在多个模型中增强 CAR-T 细胞的持久性、肿瘤浸润和抗肿瘤效果。
CRISPR-HAWK 是一个把个体和群体尺度的变异与单倍型纳入 gRNA 设计的框架,代码已在 GitHub 开源。作者在 79 648 个基因组上分析治疗靶点,发现变异会显著改变向导表现:针对 BCL11A 的镰状细胞病治疗向导存在完全消除预测切割活性的单倍型,七个治疗位点中 82.5% 的向导带有影响在靶活性的变异,变异还会产生新的 PAM 位点、带来参考基因组设计看不到的个体特异性向导。
推荐理由:该工具把个体与群体层面的变异和单倍型纳入 gRNA 设计,并给出 79 648 个基因组上的评估结果,可供做 CRISPR 靶点选择时参考。
中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞团队与陈宇航团队在 Nature Plants 在线发表研究,提出结构指导设计与顺式调控优化相结合的等位基因工程策略,创制了除草剂抗性提升的水稻和小麦新种质。
推荐理由:该工作把蛋白结构指导的编码区变异与顺式调控元件整合结合,在水稻和小麦中同时改造 HPPD,为复杂农艺性状改良提供可迁移路径。
研究团队开发了靶向 NK 细胞的脂质纳米颗粒 NtLNPs,用工程化双靶向 NK 细胞配体驱动受体特异性摄取和 mRNA 递送,在小鼠中实现最高约 80% 的 NK 细胞转染且脱靶效应很小。经系统给药递送 CAR mRNA 可在体内生成 CAR NK 细胞:靶向 CD19 的 CAR NK 细胞在健康小鼠中完全清除循环 B 细胞,靶向 CD3 的 CAR NK 细胞在自身免疫性肝炎模型中清除几乎全部自身反应性 T 细胞,作者据此提出其在 T 细胞驱动疾病上可能优于 CAR T 疗法。
推荐理由:研究用双靶向配体修饰的 LNP 在小鼠体内直接生成 CAR NK 细胞,为体内细胞工程提供了可迁移的递送思路。
研究团队通过精氨酸富集策略改造 Corynebacterium glutamicum Cas12n(CgCas12n),获得编辑效率提升约 60 倍的变体,并缩短 sgRNA 支架而不损失活性,组合成增强型 eCgCas12n 系统用于哺乳动物细胞基因组编辑。
Cajka 等人在 Cell Systems 报告,iPSC 来源神经元中依赖 SV40 NLS 的 CRISPR 构建体无法定位到神经元细胞核,导致 dCas9-KRAB(KOX1) 在细胞质中被降解。改用其他 NLS 可恢复蛋白定位与表达,说明错误定位是 CRISPR 在终末分化细胞中效率偏低的一个关键因素。
中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风团队用单碱基编辑技术定点突变小麦 TaABA2-5A 基因的 uORF,解除其对下游主基因的翻译抑制,在不改变转录水平的情况下提高翻译效率和内源 ABA 含量,使小麦获得耐盐、耐旱能力与穗发芽抗性。
Biohub 团队对原代人成年皮肤角质形成细胞完成全基因组 CRISPR 筛选,并用基于文献训练的大语言模型 VirtualCRISPR 筛出文献中未被关注的靶点,相关结果发表于 Nature Communications。
推荐理由:用离心递送绕过角质形成细胞转染难题,完成全基因组 CRISPR 筛选,再以语言模型筛出文献未覆盖的靶点。