GenBank Release 274.0 发布:60.07 万亿碱基、66.8 亿条记录
NCBI 发布 GenBank Release 274.0,含 60.07 万亿碱基、6.68 亿条记录,传统记录 269,895,537 条。与 273.0 相隔 63 天,传统部分新增 1,148,082,415,974 碱基和 2,511,642 条序列记录,WGS 部分新增 4,158,499,198,911 碱基和 308,262,063 条记录。
NCBI 发布 GenBank Release 274.0,含 60.07 万亿碱基、6.68 亿条记录,传统记录 269,895,537 条。与 273.0 相隔 63 天,传统部分新增 1,148,082,415,974 碱基和 2,511,642 条序列记录,WGS 部分新增 4,158,499,198,911 碱基和 308,262,063 条记录。
NCBI 发布面向全部公开人类和小鼠 SRA 数据的 RNA-Seq Gene Feature Counts,通过 AWS Registry of Open Data 免费开放。
推荐理由:公共 SRA 的人和小鼠 RNA-Seq 数据有了统一流程算出的基因特征计数,做大规模表达分析前可先据此筛选。
Biohub、美国能源部(DOE)、美国国立卫生研究院(NIH)等资助方宣布扩大一项国际合作,共同投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术,用于生成并开放可用于预测生物学 AI 模型的数据。Wellcome Sanger Institute、Human Cell Atlas、Human Protein Atlas、Allen Institute、Broad Institute 和 Gladstone Institutes 等机构参与其中,作为 Virtual Biology Initiative 的一部分推进。
推荐理由:这项跨国计划把测量技术、开放数据和标准化接口放在一起,可用来观察虚拟细胞类基础模型的数据底座如何搭建。
Biohub 与美国能源部、NIH 及新资助伙伴宣布扩展虚拟生物学计划(Virtual Biology Initiative),合计投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术。
推荐理由:这项跨机构投入给出了资金分配与数据标准化分工,可看清虚拟细胞所需开放数据从哪来、由谁整合。
Broad Institute 核心成员 Erin Chen、Sam Peng 获 NIH Director's New Innovator Award, institute scientist JT Neal 获 NIH Director's Transformative Research Award,三人是该项目 58 位获奖研究者之一。
美国国家医学图书馆(NLM)发布实验性试点资源 Linked Discoveries,可从一条 PubMed 引文出发,映射最多 200 篇最相近的相关文章。该工具分析 PubMed 引文的标题、摘要和关键词,把超过 2900 万条引文与 NCBI 各数据库的相关资源连接起来,支持按疾病、基因、化学物质过滤,并可用“any”(OR)与“all”(AND)逻辑组合。