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10月4日周日
  1. Alice Ting82

    Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 系列期刊连发 9 篇线粒体蛋白组研究

    Vamsi Mootha 与 Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 及 Cell 系列期刊连发 9 篇研究论文和 2 篇观点文章,表征了从 Giardia、Leishmania 到 Arabidopsis 等 6 个物种的线粒体蛋白组。

    推荐理由:Mitocarta Tree of Life 联盟在 Cell 系列期刊连发 9 篇论文,系统比较 6 个物种的线粒体蛋白组,并据此提出跨寄生虫药物靶点。

10月2日周五
  1. Bluesky:DeBerardinis Lab at UT Southwestern Medical Center (@rjdlab.bsky.social)25

    群体基因组学在 All of Us 队列中识别 MMACHC 杂合变异与循环维生素 B12 水平的关联

    一项新研究利用群体基因组学在 All of Us 队列中识别出钴胺素加工基因 MMACHC 的杂合变异,这些变异与更高的循环维生素 B12 水平相关。该工作由 Ling Cai 参与完成,以研究快报形式发表。

10月1日周四
  1. Broad Institute60

    跨真核生物线粒体蛋白目录揭示细胞能量工厂的新功能

    Broad Institute 报道,研究人员构建了六种真核生物(五种寄生虫和一种植物)的线粒体蛋白目录,结合已有的人类和酵母线粒体清单,重新审视这一细胞器的功能与演化。该工作揭示了 Giardia 极小的线粒体蛋白组和 Acanthamoeba 线粒体的意外能力,并支持线粒体在真核生物演化中起源相对较晚的观点。结果还指出多种病原体共有、但人类缺失的线粒体蛋白,提示被忽视热带病的新治疗靶点。

9月30日周三
  1. Ground Truths67

    细胞身份丢失驱动人类衰老:解读 Nature 与 Cell 两篇新论文

    Eric Topol 解读了哈佛 Vadim Gladyshev 团队发表在 Nature 的论文和 Altos Labs Juan Carlos Izpisua Belmonte 团队近期发表在 Cell 的论文,提出细胞身份丢失是衰老的新模型,与传统的损伤累积模型并列。

    推荐理由:文章把细胞身份丢失与间充质漂移串成衰老的新解释框架,并梳理了热量限制、部分重编程等干预思路。

9月29日周二
9月28日周一
  1. Bluesky:Dr Radu Zabet (@raduzabet.bsky.social)22

    英国人群全血 DNA 甲基化个体间变异研究:Genome Biology 论文配套播客上线

    一项发表于 Genome Biology 的研究系统调查了英国人群中全血 DNA 甲基化的个体间变异,并据此编目可变与稳定的表观遗传位点。该工作基于 Understanding Society 队列数据,作者 Radu Zabet 与 Leo Schalkwyk 在一档新播客季首期中讨论了这项成果。

9月26日周六
9月21日周一
9月17日周四
  1. Pardis Sabeti67

    Delphy 在 Nature 发表,为疫情应对提供近实时贝叶斯系统发育分析

    Delphy 在 Nature 发表,为疫情应对提供可扩展、近实时的贝叶斯系统发育分析,把更快的推断引擎与可交互界面结合起来。该工作由 Patrick Varilly 主导,与 Ben Fry 和 fathominfo 团队共同开发,论文见 https://www.nature.com/articles/s41586-026-11012-6,工具可在 https://delphy.bio/ 试用。

  2. Bluesky:Molly Przeworski (@mollyprz.bsky.social)42

    Matin Saeidi 与 Will Milligan 建模人类突变因子等位基因动态,探讨三联体子代调查可发现何种突变因子

    Matin Saeidi 与 Will Milligan 对人类突变因子等位基因动态进行建模,并探讨通过三联体子代调查应预期发现哪些类型的突变因子。相关工作引用《Dynamics of mutators of arbitrary dominance in humans》。

9月15日周二
  1. Nicole Soranzo58

    COSIGT 泛基因组基因分型工具发布,面向低覆盖度短读长 WGS

    Nicole Soranzo 团队开发出泛基因组基因分型工具 COSIGT,可对低覆盖度数据做基因分型,适用于群体队列到古 DNA 的场景。作者称该工具可扩展,在低、中覆盖度短读长 WGS 上表现良好,工作由 @davidebolo93、@AndresGuarahino 与 @erikgarrison、@psudmant 等合作完成。

8月18日周二
  1. Bluesky:Megan Dennis (@mydennis.bsky.social)60

    田鼠基因组预印本正式发表于 Cell Genomics,单文库 HiFi-CiFi 完成染色体级二倍体组装

    田鼠基因组预印本已正式发表于 Cell Genomics 的 T2T 特刊。研究由 Abuelanin 等完成,将 PacBio HiFi 与低覆盖度 CiFi 邻近连接读段合并到单个文库和单次测序运行中,生成连续、接近端粒到端粒且定相准确的二倍体组装。

6月4日周六
5月29日周日
4月19日周二
1月29日周六