组织-血浆配对全基因组DNA甲基化分析鉴定胃癌诊断cfDNA新标志物
对29对胃癌及癌旁组织和61例胃癌患者、29例健康对照的血浆cfDNA进行WGBS，鉴定出32个在组织与血浆中一致变化的稳定DMR，并筛选出8个核心诊断标志物。
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PLOS GeneticsAI 评分4040 EMA News精选AI 评分8282 EMA 建议批准 Rasonque（daraxonrasib）用于转移性胰腺癌
EMA 人用药品委员会（CHMP）建议在欧盟批准 Rasonque（daraxonrasib）上市，用于既往至少接受过一次治疗的成人转移性胰腺腺癌。该药为口服 RAS 抑制剂，通过结合 cyclophilin A 形成复合物附着于 RAS 蛋白并阻断其活性。
推荐理由：CHMP 对 daraxonrasib 的阶段性审评把评估压缩到 150 天内，为 RAS 抑制剂在胰腺癌的监管路径提供了参照。
Cell GenomicsAI 评分5555 NeoBridge 发布：结合生物物理特征与克隆结构为胰腺癌新抗原排序
Lana Mediavilla 等提出 NeoBridge，一个结合生物物理信息的机器学习集成方法，用于优先排序免疫原性新抗原。在胰腺癌中，亚克隆新抗原负荷而非克隆新抗原负荷与更差的生存相关，提示克隆结构应纳入疫苗靶点选择。
CellAI 评分5858 细胞自组织调控铁死亡的传播方向与范围
Cell 在线发表的研究显示，局部细胞间相互作用会形成可编码铁死亡敏感与抵抗命运的细胞图案，并在细胞内建立极性脂质组织。这些生化与生物物理特性耦合后，使自组织的细胞群体能够定向并限制原本各向同性、无界扩散的铁死亡传播，从而提出一种在系统层面调控群体细胞命运的机制。
Genome MedicineAI 评分6262 FAME：整合血浆 cfDNA 甲基化与片段组学信号的可解释癌症诊断模型
研究团队开发了可解释多模态模型 FAME，以血浆 cfDNA 甲基化单倍型块（MHB）为单位整合甲基化与片段组学特征用于癌症检测和组织来源预测，并扩展出加入全基因组特征的 FAME-GW。
Cell Reports MedicineAI 评分5858 用常规临床活检的活体肿瘤片段预测免疫治疗反应
Braun 等利用常规穿刺和钳取活检取得的活体肿瘤组织，在体外测量免疫治疗反应，结果与一个小型患者队列的临床结局一致，其中包括被现有生物标志物检测误判的患者。该研究提示，离体活肿瘤片段或可作为预测癌症免疫治疗获益的补充手段。
CellAI 评分5858 靶向线粒体的四氧杂烷类化合物 WMK-1/2 通过脂质过氧化驱动铁死亡并抑制肿瘤
Pan 等人在 Cell 报道了含四氧杂烷结构的化合物 WMK-1/2，它们是第一代线粒体脂质过氧化诱导剂，可绕过 GPX4 和视黄醇介导的防御，触发一条独立的“mito-ferroptosis”亚通路。该工作在多种体内模型中显示出具有生物利用度的抑瘤活性。
Genome Medicine精选AI 评分7878 研究揭示NOTCH1早期突变在正常食管上皮中受正选择却抑制后续ESCC驱动突变演化
一项发表于Genome Medicine的研究用定量演化框架分析2171份样本，区分突变率与选择，发现NOTCH1突变在组织学正常食管上皮克隆扩增中受强正选择，这解释了其在该组织中的高 prevalence。
推荐理由：研究用2171份样本区分突变率与选择，显示NOTCH1在正常食管上皮中受强选择，却与TP53、RB1呈拮抗上位性，抑制后续恶性演化。
Medical Xpress精选AI 评分7878 国际 GLASS 研究追踪 IDH 突变胶质瘤复发时的基因组变化
Jackson Laboratory、耶鲁大学等 10 国合作团队在 Nature 发表 GLASS 联盟研究，对 183 例治疗前后配对取样的 IDH 突变胶质瘤进行分析，发现复发时少突胶质细胞瘤倾向获得新的生长驱动突变，星形细胞瘤则更常发生大规模染色体改变。
推荐理由：GLASS 联盟对 183 例配对样本的分析显示，IDH 突变胶质瘤的两种亚型在复发时走的是不同的基因组演化路径。
Prof. Akiko IwasakiAI 评分2222 FLINTLOCK 2期试验启动 VYD2311 抗体
Akiko Iwasaki 对 FLINTLOCK 2期随机对照试验的启动表示欣慰，该试验将在长新冠和新冠疫苗接种后综合征患者中评估靶向刺突蛋白的单克隆抗体 VYD2311，以了解刺突蛋白导向疗法是否有帮助及适用于哪些患者亚群。
National Cancer InstituteAI 评分4242 NCI 儿童癌症分子特征计划入组超万人
美国国家癌症研究所（NCI）宣布，儿童癌症数据计划的分子特征计划（MCI）入组患者已超过 1 万名，该计划由 NCI 与 COG 合作，为患癌青少年和年轻成人免费提供分子特征分析。
Cell SystemsAI 评分3838 从代码到临床的 CAR T 细胞：以当前转化研究目标框定建模方法
一篇发表于 Cell Systems 的视角文章梳理了 CAR T 细胞治疗的数学建模如何支撑预测性设计与临床决策。文章按 CAR T 治疗的关键转化难题对现有模型进行分类定位，并指出机器学习、多尺度建模、控制理论和替代细胞类型等新兴方向在模型引导的下一代细胞疗法设计中的机会。
Bluesky：KaminskiMed (@kaminskimed.bsky.social)AI 评分2020 BMS 的 LPAR1 抑制剂在 3 期肺纤维化 RCT 中达到主要终点，验证 Andy Tager 的 LPAR1 发现
BMS 宣布其 LPAR1 抑制剂在 3 期肺纤维化随机对照试验中达到主要终点。该靶点在肺纤维化中的作用由 9 年前去世的 Andy Tager 发现，此次结果被视为对其科学遗产的确认。
Nature Biotechnology精选AI 评分7878 配体导向脂质纳米颗粒在体内生成 CAR NK 细胞用于免疫治疗
研究团队开发了 NK 细胞靶向脂质纳米颗粒（NtLNPs），用工程化双靶向 NK 细胞配体驱动受体特异性摄取和 mRNA 递送，在小鼠中实现最高约 80% 的 NK 细胞转染且脱靶效应很小。
推荐理由：该研究用双靶向配体修饰的 LNP 在小鼠体内转染 NK 细胞并生成 CAR NK，为 T 细胞驱动的疾病提供了一种非病毒体内改造路径。
Nature Genetics精选AI 评分7878 人类胰腺导管腺癌克隆异质性及其对肿瘤进展的影响
研究对 62 例原发胰腺导管腺癌肿瘤进行单细胞 RNA 测序（443,451 个细胞），并对其中 11 例做匹配的空间转录组（53,236 个 spot），刻画克隆、转录与空间多样性。分析发现肿瘤内存在多个遗传上不同的恶性克隆，配体-受体程序受基因组剂量调控，8q24（MYC）扩增与谱系内经典向基底样转变反复相关；小鼠与原代人模型中的 MYC 敲低可重新激活经典程序并恢复免疫应答通路。
推荐理由：62 例原发肿瘤的单细胞与空间转录组图谱显示，8q24 的 MYC 扩增与肿瘤谱系内经典向基底样转变相关，为理解 PDAC 克隆异质性提供了资源。
科学网AI 评分2222 知名学者万逢义回国出任浙江大学求是讲席教授
美国约翰霍普金斯大学教授万逢义已全职回国加盟浙江大学，任求是讲席教授及浙大医学院附属第二医院经血管植入器械全国重点实验室教授，于2026年回国。其长期研究肠道感染、炎症与免疫应答，聚焦宿主-病原菌-肠道微生态互作，主持美国国立卫生研究院等资助项目20余项，发表论文近60篇。
Nature Genetics精选AI 评分7272 微核中的 ecDNA 限制肿瘤细胞适合度并与患者较好生存相关
研究发现 ecDNA 是微核的重要来源，复制压力下 ecDNA 发生有丝分裂聚集、不对称分配和错分进入微核，携带 ecDNA^+ 微核的细胞增殖能力下降、更易死亡。单微核测序显示多个不同 ecDNA 种类会汇聚到同一微核中；在 MYCN 扩增的神经母细胞瘤患者中，诊断时 ecDNA^+ 微核频率较高与总生存期改善相关。作者据此提出有丝分裂期 ecDNA 滞留可能成为治疗切入点。
推荐理由：研究把 ecDNA 的微核错分与适合度下降联系起来，并给出神经母细胞瘤患者生存关联，为理解 ecDNA 的代价提供新角度。
Cell Reports MedicineAI 评分5050 口服代谢重编程益生菌 EcN-HlpA-CGL 通过级联激活抗肿瘤免疫抑制结直肠癌
Wang 等开发出口服代谢工程菌平台 EcN-HlpA-CGL（EHC），用于结直肠癌免疫治疗。该菌通过触发结直肠癌细胞铁死亡增强免疫原性，同时以细菌佐剂效应重塑免疫抑制微环境，激活全身与肠道黏膜免疫，有效抑制原位肿瘤生长与转移。
Bluesky：Ivan Zanoni (@lozanzi.bsky.social)AI 评分7272 Nature 研究：肠道菌产生的奇数链脂肪酸 C15:0 经抑制 HMG-CoA 还原酶缓解小鼠动脉粥样硬化
Yin、Mou、Tang、Zhao 等人在 Nature 发表研究，显示拟杆菌门来源的奇数链饱和脂肪酸十五烷酸（C15:0）通过抑制 HMG-CoA 还原酶降低胆固醇水平，从而缓解动脉粥样硬化，机制与他汀类似。
Matthias Mann LabAI 评分5858 质谱蛋白质组分析 83 例儿童肾上腺皮质肿瘤，识别出 4 种与生存相关的蛋白质组状态
Matthias Mann 实验室对 83 例罕见儿童肾上腺皮质肿瘤的存档 FFPE 组织做质谱蛋白质组分析，识别出 4 种蛋白质组定义的状态，这些状态对生存的预测优于组织学。该工作由 Rainer Claus 和 Andreas Metousis 主导，发表在 eBioMedicine，DOI 为 10.1016/j.ebiom.2026.106504。
Cell Reports MedicineAI 评分4040 白介素与 OX40 激动剂的空间定位递送增强协同抗肿瘤免疫
Klich 等利用水凝胶在瘤内和瘤周递送免疫治疗组合，通过合理选择给药部位实现肿瘤清除与长期存活。该研究发表于 Cell Reports Medicine，显示白介素与 OX40 激动剂的空间定位可增强协同抗肿瘤免疫。
Bioinformatics AdvancesAI 评分2020 Fusobacterium nucleatum ATCC 25586 三个保守致病相关基因组区域的计算表征
对 Fusobacterium nucleatum ATCC 25586 基因组的整合计算分析识别出三个含溶血素产生、代谢适应、毒素-抗毒素系统、定植与免疫逃逸相关基因的基因组区域，15 个 Fusobacterium 基因组的比较分析提示这些区域广泛保守且垂直遗传。
Cell Reports MethodsAI 评分5555 CFAR：用荧光各向异性实现无扩增的高通量内源基因表达检测
Wei 等人在 Cell Reports Methods 描述 CFAR，一种无需扩增、可及性较好的高通量方法，用于检测内源基因表达，弥补报告基因 assay 只能测启动子活性的局限。用 CFAR 做化学筛选，在结直肠癌细胞中筛出靶向致癌基因 MYC 表达的 FDA 已批准药物。
Molecular Systems BiologyAI 评分6060 通量效率与代谢控制的权衡决定酶分配
研究推导出联系平衡常数 K 与催化丰度商 CAQ 的解析关系，用以界定通路达到最大通量效率的条件。作者整合反应热力学、酶动力学、转录组与蛋白组数据，在进化距离较远的多个物种中比较糖酵解与 TCA 循环的酶分配，发现偏离该关系的部分可由最大化通量效率与集中通量控制之间的权衡解释。
Decoding Bio精选AI 评分6060 研究比较 cilta-cel 与 ide-cel 发现 CAR 启动子影响疗效
Decoding Bio 的 BioByte 周刊介绍了一项比较两种 BCMA CAR-T 产品 cilta-cel 与 ide-cel 的研究，作者认为两者的关键差异在于控制 CAR 表达的启动子，而非抗原结合域。
推荐理由：通过重建四种 CAR 组合，把 cilta-cel 与 ide-cel 的疗效差异指向启动子而非抗原结合域，为细胞治疗设计提供可比较的线索。
GigaScienceAI 评分4747 Epitope Generation Gateway（EGG）：基于生物学情境的癌症疫苗表位优先级流程
Epitope Generation Gateway（EGG）是一个容器化流程，整合 Mutect2、STAR-Fusion、ArcasHLA 与 pVACtools，在预测表位序列后叠加共表达网络、蛋白互作网络、中心性指标、DepMap CRISPR 依赖数据和 IntOGen 驱动基因状态进行优先级排序。
Microsoft Research Blog精选AI 评分7575 微软研究院推出 Quine：面向生物学复杂性的 AI 研究系统
微软研究院推出 Quine，一个由多模态生物学世界模型和连接模型、科学工具、文献与研究者的交互式 harness 组成的 AI 研究系统。
推荐理由：微软研究院公开了面向生物学的多模态世界模型与实验编排系统，并给出胰腺癌细胞状态转换的湿实验验证案例。
Genomics, Proteomics & BioinformaticsAI 评分3838 单细胞与空间转录组揭示 DEFB1+ 胆管细胞与 IFI30+ 巨噬细胞互作驱动肝内胆管癌免疫抑制微环境
整合单细胞 RNA 测序与空间转录组构建人肝内胆管癌（ICC）细胞与转录图谱，发现 CD8+ 增殖 T 细胞存在终末型与祖细胞样两种耗竭程序。DEFB1+ 胆管细胞与 IFI30+ 巨噬细胞在多个独立 ICC 队列中呈强正相关，并在肿瘤微环境中空间邻近，其互作预测涉及 TGFB1–TGFBR1 信号轴，可能促进肿瘤进展与免疫治疗耐药。
Bluesky：Chris Tape (@christophertape.bsky.social)AI 评分4242 膳食脂肪与神经酰胺经 YAP 驱动结直肠癌 revival 干细胞命运
一项研究显示，膳食脂肪与神经酰胺可驱动结直肠癌（CRC）中由 YAP 介导的 revival 干细胞命运。该研究发表于 Science，具体数据与结论细节未在原文中展开。
公众号：达摩院DAMO精选AI 评分7878 阿里达摩院发布食管癌 AI 模型 DAMO EAGLE，用平扫 CT 识别早期与癌前病变
阿里达摩院发布食管癌 AI 模型 DAMO EAGLE，尝试在不插管的情况下，从胸部平扫 CT 中识别早期食管癌和癌前病变。研究团队把内镜报告和增强 CT 上的病灶位置配对到平扫 CT 上训练模型；在机会性筛查场景下，模型对食管癌的敏感性为 90%，对癌前病变为 52.5%，真实场景特异性为 99.2%，在低剂量 CT 上性能未见下降。
推荐理由：在机会性筛查场景下，该模型对食管癌的敏感性达到90%，并给出了癌前病变与特异性的具体数字，可供关注影像 AI 早筛的读者对照。
Molecular Systems Biology精选AI 评分6767 整合空间信息的正常与癌症相关结肠成纤维细胞图谱
研究结合大规模单细胞 RNA 测序、空间验证和功能实验，构建了人正常结肠成纤维细胞与间质亚群的参考图谱，并以小鼠结肠为参照。
推荐理由：该研究以小鼠结肠为参照，用单细胞与空间验证构建人正常结肠和结直肠癌成纤维细胞参考图谱，为 CAF 分型提供统一坐标。
Bluesky：John Ebos (@ebos.bsky.social)AI 评分3030 肿瘤免疫微环境重塑可预测免疫检查点抑制剂应答
肿瘤免疫微环境重塑可预测免疫检查点抑制剂治疗应答，相关研究发表于 ScienceDirect。原文未披露研究对象、样本量、具体方法及数据公开情况。
Bluesky：Roychoudhuri Lab (@roychoudhurilab.bsky.social)AI 评分4242 不同方法学共同指向 PRDX1：肿瘤来源抗氧化剂通过剥夺 T 细胞活性氧抑制免疫
两项采用完全不同方法学的研究共同指向 PRDX1。Julian Lum 团队的 CRISPR 筛选在人类卵巢癌腹水中鉴定出 PRDX1，其缺失可提高 T 细胞内 ROS 并增强 T 细胞功能。相关成果分别发表于 Science 与 bioRxiv。
Bluesky：Roychoudhuri Lab (@roychoudhurilab.bsky.social)AI 评分4444 Julian Lum 团队 CRISPR 筛选发现 PRDX1 缺失增强 T 细胞抗卵巢癌腹水抑制功能
Julian Lum 团队用 CRISPR 筛选鉴定出使 T 细胞对人卵巢癌腹水抑制活性敏感的因子 PRDX1，其缺失可升高细胞内 ROS 并增强 T 细胞功能。
Molecular Systems BiologyAI 评分6060 TME-CARTographer 解析活体胰腺癌中治疗性 T 细胞的时空免疫抑制
研究团队开发了计算流程 TME-CARTographer（TME-CART），整合高维数据、图论、行为分析和深度学习，用于解析活体胰腺导管腺癌（PDA）肿瘤中 4D 的 T 细胞与肿瘤微环境相互作用。
Cell SystemsAI 评分6060 多类器官系统模拟生理吸收与代谢用于抗肿瘤药物评价
Xiao 等建立了一个整合肠道吸收、肝脏代谢和肿瘤反应的多类器官系统，用于评价抗肿瘤药物。该系统能捕捉仅用肿瘤培养时被忽略的药物活化与失活过程，为预测药物疗效和毒性提供了更接近生理条件的途径。
Caleb LareauAI 评分5858 MSKCC 团队在 Nature Biomedical Engineering 报告 AI 设计抗肿瘤治疗蛋白的首个进展
Memorial Sloan Kettering 癌症中心（MSKCC）Caleb Lareau 实验室在 Nature Biomedical Engineering 在线发表研究，报告其用 AI 设计新型治疗蛋白、并将其开发为抗肿瘤疗法的第一步。作者称这项工作始于三年前，目标是探索能否借助 AI 获得新的治疗性蛋白，更多细节见 MSKCC 新闻稿链接。
Biohub精选AI 评分7878 Biohub 用 AI 揭示肿瘤细胞状态异质性，预测联合用药延长 DMG 小鼠生存
Biohub 与哥伦比亚大学等机构合作在 Nature Genetics 发表两篇论文，提出“cancer quantum biology”假说：同类型肿瘤在患者间拥有几乎相同的恶性细胞状态集合，这些状态可相互转换从而逃避单靶点药物。
推荐理由：两篇 Nature Genetics 论文提出肿瘤细胞状态在患者间高度保守，并用 AI 预测针对多状态的联合用药，在 DMG 小鼠模型中延长生存。
Bluesky：Vijay G. Sankaran (@bloodgenes.bsky.social)AI 评分2222 两项预印本揭示遗传性B-ALL易感性的趋同机制
两项互补的预印本揭示遗传性B-ALL易感性的趋同机制，由Lara Wahlster、Alnee Hus和Andrew Lee主导完成，已发布于bioRxiv。
Peter LeeAI 评分3737 微软研究：通用AI模型在病理任务上胜过专用模型
微软研究院（MSFTResearch）表示其团队反复发现更通用的 AI 模型在专业任务上表现优于专用模型，并以与 Paige（现属 TempusAI）合作、发表于 Nature Medicine 的数字病理模型 PRISM2 为例。