生信日报 · 2026 年 11 月 8 日 · 星期日
BIOINFOSOUL
乔杰等团队在 Science 报道肠道菌将雄激素逐级灭活、解释膳食纤维改善多囊的机制
北京大学乔杰、庞艳莉、姜长涛及南昌大学聂少平团队在 Science 在线发表研究，把膳食纤维改善多囊卵巢综合征（PMOS/PCOS）高雄激素状态的作用落到具体菌株与酶。团队先开展 12 周临床试验，由菊粉、抗性淀粉、β-葡聚糖组成的纤维组合改善了患者高雄激素状态并恢复排卵；宏基因组测序显示木聚糖拟杆菌（Bacteroides xylanisolvens）显著富集，其丰度与血浆雄烯二酮（A4）、睾酮（T）浓度负相关。给类PMOS小鼠定植该菌后，高雄激素、发情周期、卵巢形态和胰岛素敏感性均改善。
方法与工具
Journal of Chemical Information and Modeling一手MERIT：机制驱动模型预测药物试验结果并为失败药物提名适应症
研究团队提出 MERIT（MEchanism-Resolved Inference of Trial outcomes），仅用分子与疾病特征预测药物试验结果，不使用相似化合物的成功信息，以避免化合物记忆带来的性能虚高。MERIT 将目标药物与疾病同大规模药物–蛋白、蛋白–代谢物和免疫互作图谱结合，把药物的预期作用与潜在脱靶效应关联到组织特异的有效性和安全性。在 753 个小分子药物、3,133 项试验上，结构留出评估的总体 AUROC 为 0.770（有效性 0.765，安全性 0.784），优于两个在相同试验和折上重训的已发表方法。
研究发现
Eric Topol另有 3 家信源报道AHA26 与 NEJM 公布两项心血管二级预防试验：IL-6 抗体和 Lp(a) 反义寡核苷酸均无获益
Eric Topol 分享并点评了在 #AHA26 与 NEJM 同步公布的两项心血管疾病二级预防大型试验，分别使用 IL-6 抗体和 Lp(a) 反义寡核苷酸。他表示，两项试验在总体人群及所有亚组中均未显示出有益效果。
公众号：生信人Cancer Discovery：三维空间多组学刻画乳腺癌与前列腺癌癌前到浸润转变
Storrs 等在 Cancer Discovery 发表研究，用光片显微三维成像结合连续切片与 Xenium、CosMx、Visium、Visium HD、CODEX 和 H&E，在真实三维结构中追踪乳腺癌与前列腺癌从癌前病变到浸润癌的连续转变。研究纳入 51 例病例、完成 319 项空间检测，其中乳腺癌 112 项、前列腺癌 207 项。
公众号：北大生科朱丹萌研究组揭示 U5 snRNA 介导选择性翻译促进叶绿体发育与光合作用
北京大学核糖核酸北京研究中心朱丹萌研究组在 Vita 在线发表研究，揭示光信号促进 U5 snRNA 与多聚核糖体结合，选择性激活一批叶绿体发育与光合作用相关 mRNA 的翻译，帮助拟南芥幼苗完成从异养到自养的转变。研究分析拟南芥幼苗黑暗转光后 RNA 在细胞核、细胞质、单核糖体和多聚核糖体中的分布，发现 U5、U6 多个变体富集于多聚核糖体且依赖 phyA、phyB 和 CRY1；u5-3 u5-4 双突变体子叶黄绿，242 个基因翻译效率下降而 mRNA 丰度基本不变。
AI × 生物医药
公众号：达摩院DAMO西门子医疗与阿里达摩院签约推广AI“一扫多筛”
西门子医疗与阿里达摩院签约，拟依托西门子医疗的影像设备和临床资源引入达摩院医疗AI模型，推广用一次平扫CT早期发现胰腺癌、胃癌、肠癌、食管癌、肝癌及主动脉夹层、肺动脉栓塞等。
医药产业
华奥泰 PD-L1/VEGF 双特异融合蛋白 HB0025 联合化疗一线治疗 NSCLC 的 II 期结果发表于 JAMA Oncology
华奥泰 PD-L1/VEGF 双特异性融合蛋白 HB0025（索布瑞芙普α）联合标准化疗一线治疗驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌的 II 期研究，于 2026 年 11 月 5 日发表于 JAMA Oncology。截至 2026 年 4 月 20 日共入组 169 例受试者，非鳞癌队列 85 例、鳞癌队列 84 例，分别接受培美曲塞+卡铂或紫杉醇+卡铂联合 HB0025（10 mg/kg 或 20 mg/kg，Q3W）。
罗氏引进大睿生物ALK7 siRNA，三年攒下五条减重资产
罗氏从大睿生物引进靶向ALK7的在研RNAi候选药物，用于肥胖和代谢性疾病治疗，首付款加近期里程碑合计最高1亿美元，开发、监管及商业化里程碑最高10.6亿美元，交易总额最高11.6亿美元，另有基于净销售额的分级分成。文章梳理罗氏自2023年12月以27亿美元现金收购Carmot以来的减重布局，已积累涉及五条机制各不相同的资产。其中CT-388的II期数据显示，469人治疗48周后24mg剂量组经安慰剂校正减重22.5%；合并2型糖尿病的患者48周平均减重15.5%，HbA1c下降2.65个百分点。ALK7 siRNA基于APOLLO肝外平台开发，后续疗效仍有待临床检验。
STAT另有 1 家信源报道Novo Nordisk 抗炎抗体 ziltivekimab 的 ZEUS 试验未减少心血管事件
Novo Nordisk 的 ZEUS 试验显示，单克隆抗体 ziltivekimab 虽降低了炎症细胞因子 IL-6 等两项炎症生物标志物水平，但治疗组的心肌梗死、卒中和死亡并未比安慰剂组减少。该结果在周六美国心脏协会科学年会上进一步披露，并同期发表于 New England Journal of Medicine。此前 7 月公布的顶线结果已促使 Novo 在 9 月数据监查委员会认为 HERMES 和 ATHENA 两项试验不太可能成功后，终止了这两项试验。STAT 报道称，尽管该药失败，心脏病学家表示仍将继续探索抗炎治疗方向。
公众号：药明康德强生EGFR/MET双抗获FDA加速批准治疗头颈癌，乙肝基因编辑疗法1期数据公布
药明康德汇总了四条产业新闻。强生EGFR/MET双特异性抗体皮下注射剂Rybrevant Faspro获FDA加速批准新增适应症，用于既往接受含铂化疗及抗PD-1/PD-L1治疗后进展的复发或转移性头颈部鳞状细胞癌成人患者，不含HPV相关口咽鳞癌；基于1b/2期OrigAMI-4研究，客观缓解率42%，完全缓解率15%，缓解者中56%持续至少6个月，后续需确证性研究。
观点与综述
公众号：iNature另有 1 家信源报道《Science》专刊聚焦肥胖治疗：GLP-1 之后转向脂肪组织重塑
iNature 介绍了《Science》以专刊加封面的形式连发 7 篇论文，讨论肥胖治疗在 GLP-1 受体激动剂之后的方向。文章称司美格鲁肽、替尔泊肽等药物可把体重降低 15% 甚至 20% 以上，并改善心肾结局，机制涉及延缓胃排空、作用于下丘脑饱腹中枢和抑制食欲。但减重同时会流失肌肉、水分等瘦体重，研究提示停药两年后高达八成患者停药，体重反弹可找回先前减掉的三分之二。文章由此提出下一阶段重点：不再只抑制食欲，而是引导脂肪组织重塑，让内脏脂肪降得更多、诱导白色脂肪棕化，并兼顾护肌肉、少脱靶。
公众号：生信菜鸟团用 anndataR 在 R 中原生读取和转换 h5ad
生信菜鸟团介绍了 scverse 出品的 anndataR 包，用于在 R 中原生读取 h5ad 并与 Seurat、SingleCellExperiment 对象互转。作者指出，此前常用的 sceasy 基于 Seurat V4、对 scanpy 和 Seurat 版本依赖重，还需完善的 Python 与 R 环境；anndataR 则基于 rhdf5 直接读写 h5ad，不需要 Python 或 conda，这是它相对 zellkonverter、sceasy 的主要优势。