Omicron 两大分支 21K 与 21L 流行趋势
Trevor Bedford 指出,Omicron 可分为 PANGO 谱系 BA.1 和 BA.2(对应 Nextstrain 分支 21K 和 21L),全球测序样本中 21K 约 63 万、21L 约 1.8 万,但 21L 占比正在上升。
Trevor Bedford 指出,Omicron 可分为 PANGO 谱系 BA.1 和 BA.2(对应 Nextstrain 分支 21K 和 21L),全球测序样本中 21K 约 63 万、21L 约 1.8 万,但 21L 占比正在上升。
UCSF 的 Kyle 等人通过测试近 2400 个合成免疫受体蛋白,揭示了可用于改进 CAR-T 细胞癌症治疗的新基本规律。该工作以预印本形式发布在 bioRxiv,题为用组合信号基序文库与机器学习探索嵌合抗原受体表型输出的规律。
Nicolas Altemose 推荐了一个详细讲解 DiMeLo-seq 的推文串,该推文串基于 Annie Maslan 在 nanoporeconf 会议上关于用 DiMeLo-seq 在全基因组范围绘制蛋白-DNA 相互作用的报告。
Jop Kind 团队提出一种新方法,把 DamID 扩展到在体内定位 DNA 与翻译后修饰蛋白之间的相互作用,并与 RNA-seq 联合使用,甚至可用于单细胞。该工作以预印本形式发布在 bioRxiv,链接为 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.26.465688v1。
端粒到端粒(T2T)联盟的着丝粒周边卫星序列团队发布了对人类基因组中 6.2% 序列的详细分析,这部分序列此前约 20 年几乎完全缺失于参考序列。相关预印本已发布在 bioRxiv,链接为 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.12.452052v1。
推荐理由:T2T 联盟对长期缺失的着丝粒周边卫星序列做了系统分析,可了解人类参考基因组补全的具体进展。
Jared Simpson 分享并推荐了 Jordi Silvestre-Ryan 与 Ian Holmes 在 bioRxiv 上的一篇新预印本,主题是纳米孔双读段的解码。
Ed Boyden 介绍,膨胀显微镜(Expansion microscopy)可帮助观察卵子形成过程中染色体分离所依赖的、行为类似液体的特殊结构,该工作来自 Max Planck 生物物理化学研究所 Schuh 实验室,发表于 Science。
Ed Boyden 对 Gregor Mendel 研究所 Nodine 实验室在 bioRxiv 发布的植物组织膨胀显微术(expansion microscopy)预印本表示关注。