人类伏隔核三维重构预印本：解析细胞类型异质性与前后轴拓扑变化
一项新预印本生成了人类伏隔核（NAc）的三维重构，用于解析细胞类型异质性与拓扑结构沿前后轴的变化。该工作由 Biostats 博士生 Jianing Yao 等人主导，已发布于 bioRxiv。
全部生信动态
Bluesky：Stephanie Hicks (@stephaniehicks.bsky.social)AI 评分4747 Cell GenomicsAI 评分6262 疾病相关位点与常见环境暴露下的响应 eQTL 共享特征
Lin 与 Li 等人将分化中的人干细胞培养体系暴露于尼古丁、咖啡因或乙醇，鉴定出只有在暴露后才显现对基因表达效应的遗传变异。这些环境特异调控变异与疾病相关位点具有相似特征，提示环境敏感的基因调控可帮助解释人类遗传学研究中的信号。
Bluesky：Guillaume Méric (@gmeric.bsky.social)AI 评分4242 中世纪羊皮纸中藏有古代绵羊病毒：新发现的羊痘病毒序列揭示其起源与演化
研究人员从中世纪羊皮纸中回收出古代羊痘病毒（sheeppox）序列，据此推断该病毒的起源时间与演化路径。相关成果已由 Science 报道并附论文链接。
Genomics, Proteomics & BioinformaticsAI 评分3838 单细胞与空间转录组揭示 DEFB1+ 胆管细胞与 IFI30+ 巨噬细胞互作驱动肝内胆管癌免疫抑制微环境
整合单细胞 RNA 测序与空间转录组构建人肝内胆管癌（ICC）细胞与转录图谱，发现 CD8+ 增殖 T 细胞存在终末型与祖细胞样两种耗竭程序。DEFB1+ 胆管细胞与 IFI30+ 巨噬细胞在多个独立 ICC 队列中呈强正相关，并在肿瘤微环境中空间邻近，其互作预测涉及 TGFB1–TGFBR1 信号轴，可能促进肿瘤进展与免疫治疗耐药。
Bluesky：Dr Radu Zabet (@raduzabet.bsky.social)AI 评分2222 英国人群全血 DNA 甲基化个体间变异研究：Genome Biology 论文配套播客上线
一项发表于 Genome Biology 的研究系统调查了英国人群中全血 DNA 甲基化的个体间变异，并据此编目可变与稳定的表观遗传位点。该工作基于 Understanding Society 队列数据，作者 Radu Zabet 与 Leo Schalkwyk 在一档新播客季首期中讨论了这项成果。
Bluesky：Alejandro Manzano Marín (@amanzanom.bsky.social)AI 评分2020 植食性半翅目昆虫宿主与营养共生菌的协同演化多样化
植食性半翅目昆虫与其营养共生菌之间存在协同演化多样化关系，相关研究发表于 doi.org/10.1016/j.co...。原文未提供研究对象规模、方法工具及数据公开状态等具体信息。
Bluesky：Manvendra Singh (@manusingh.bsky.social)AI 评分4242 单核调控图谱将转座子与成年海马神经发生联系起来
一项预印本发布“A single-nucleus regulatory atlas links transposons to adult hippocampal neurogenesis”，由 RETROGEN 实验室的 Umut、Fede 和 Souad 主导完成。该研究构建单核调控图谱，将转座子与成年海马神经发生建立联系，全文可在 bioRxiv 获取。
Cell Genomics精选AI 评分7878 九种哺乳动物脑单细胞多组学比较揭示细胞类型特异的调控保守性
Anderson 等对九种哺乳动物的脑组织开展单细胞多组学比较，发现增强子的保守性不止体现在 DNA 序列上，还体现在细胞类型特异性和靶基因上。功能实验进一步显示，古老调控元件与人类特异调控元件共同影响脑生物学和神经系统疾病的易感性。
推荐理由：跨九种哺乳动物比较脑内基因调控，把增强子保守性从序列层面延伸到细胞类型与靶基因层面。
PatternsAI 评分2020 神经元异质性对执行认知任务的循环网络影响多样
Santhosh 与 Narayanan 用大量在同一认知任务上训练的循环神经网络发现，神经元间差异对学习、任务表现、活动模式和抗干扰能力的影响高度多样，且取决于网络超参数、变异的数量与类型以及性能度量方式。结果提示应将神经网络作为完整交互系统在大量样本中研究，而非孤立关注个体差异。
Bluesky：Chris Tape (@christophertape.bsky.social)AI 评分4242 膳食脂肪与神经酰胺经 YAP 驱动结直肠癌 revival 干细胞命运
一项研究显示，膳食脂肪与神经酰胺可驱动结直肠癌（CRC）中由 YAP 介导的 revival 干细胞命运。该研究发表于 Science，具体数据与结论细节未在原文中展开。
Bluesky：Igor Adameyko (@adameykolab.bsky.social)AI 评分2020 研究揭示人类面部个体差异的潜在形成机制
一项新研究聚焦人类面部个体性的潜在形成机制，指出胚胎发育阶段为终生面部特征奠定基础。相关成果已在 Nature 发表。
Feng ZhangAI 评分3232 张锋称赞微生物基因组语言模型研究
Feng Zhang 称赞一项利用基因组语言模型发现微生物基因组中新系统的研究，并向 David Li、Garyk Brixi、Brian Hie 及团队致贺。
Bluesky：Teif lab (@teiflab.bsky.social)AI 评分5858 Zeng 等预印本提出转录因子读取染色质中的第二套调控密码
Zeng 等 2026 年在 bioRxiv 发布预印本，提出转录因子除读取 DNA 一级序列外，还解读写在核小体结构中的第二套调控密码。作者在摘要中称，其发现表明转录因子同时解读两层互补的基因组信息，即 DNA 序列与核小体结构编码。原文未给出具体数据规模与代码开放情况。
Molecular Systems Biology精选AI 评分6767 整合空间信息的正常与癌症相关结肠成纤维细胞图谱
研究结合大规模单细胞 RNA 测序、空间验证和功能实验，构建了人正常结肠成纤维细胞与间质亚群的参考图谱，并以小鼠结肠为参照。
推荐理由：该研究以小鼠结肠为参照，用单细胞与空间验证构建人正常结肠和结直肠癌成纤维细胞参考图谱，为 CAF 分型提供统一坐标。
Cell SystemsAI 评分5858 iPSC 来源神经元中 CRISPR 相关酶被错误定位到细胞质，导致 KRAB(KOX1) 特异性降解
Cajka 等人在 Cell Systems 报告，iPSC 来源神经元中依赖 SV40 NLS 的 CRISPR 构建体无法定位到神经元细胞核，导致 dCas9-KRAB(KOX1) 在细胞质中被降解。改用其他 NLS 可恢复蛋白定位与表达，说明错误定位是 CRISPR 在终末分化细胞中效率偏低的一个关键因素。
中国科学院遗传与发育生物学研究所AI 评分5555 曹晓风团队编辑小麦 TaABA2 uORF，提升耐逆性与抗穗发芽能力
中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风团队用单碱基编辑技术定点突变小麦 TaABA2-5A 基因的 uORF，解除其对下游主基因的翻译抑制，在不改变转录水平的情况下提高翻译效率和内源 ABA 含量，使小麦获得耐盐、耐旱能力与穗发芽抗性。
Bluesky：Thomas Gorochowski (@chofski.bsky.social)AI 评分4242 用重组酶构建跨物种遗传回路：纳米孔测序揭示其真实工作机制
研究展示纳米孔测序可用于解析重组酶构建的跨物种遗传回路的内部工作机制。相关成果已发表，DOI 为 doi.org/10.1038/s414...。
Europe PMCAI 评分3838 美沙酮相关离子电流效应的计算模拟预测 QT 间期延长
基于 Tusscher-Noble-Noble-Panfilov（2004）模型和 Cardiac Safety Simulator 2.2 构建动作电位与心电图模型，用美沙酮多离子电流的体外数据模拟其致 QT 间期延长效应。
Cell SystemsAI 评分5858 研究重建4.6亿年间一个必需分子互作的界面演化
一项系统发育与实验重建研究追踪了一个必需分子互作在4.6亿年间的演化，发现历史替换不断随机地增强或削弱界面上的不同位点，逐步改变了亲和力的模式与生化基础，也改变了可能突变带来的效应。研究由Yeonwoo Park与V. Narry Kim完成，发表于Cell Systems。
中国科学院遗传与发育生物学研究所AI 评分5858 税光厚团队在 Med 发表猴痘及猴痘-HIV共感染血浆多组学研究
广州国家实验室/中国科学院遗传与发育生物学研究所税光厚团队与首都医科大学附属北京佑安医院冯英梅团队合作，在 Med 发表论文，整合血浆脂质组、代谢组、炎症因子和外泌体蛋白组，刻画猴痘及猴痘-HIV共感染的脂质-免疫失调与外泌体重塑。
Eran SegalAI 评分5555 npj Aging 论文：30 秒语音可捕捉生物学衰老特征
Eran Segal 团队在 npj Aging 发表论文，用 30 秒语音录音构建 Voice Age 模型，基于 Human Phenotype Project 的 7000 名参与者训练，预测实际年龄。
Bluesky：John Ebos (@ebos.bsky.social)AI 评分3030 肿瘤免疫微环境重塑可预测免疫检查点抑制剂应答
肿瘤免疫微环境重塑可预测免疫检查点抑制剂治疗应答，相关研究发表于 ScienceDirect。原文未披露研究对象、样本量、具体方法及数据公开情况。
Bluesky：Molly Przeworski (@mollyprz.bsky.social)AI 评分4242 Matin Saeidi 与 Will Milligan 建模人类突变因子等位基因动态，探讨三联体子代调查可发现何种突变因子
Matin Saeidi 与 Will Milligan 对人类突变因子等位基因动态进行建模，并探讨通过三联体子代调查应预期发现哪些类型的突变因子。相关工作引用《Dynamics of mutators of arbitrary dominance in humans》。
Bluesky：Roychoudhuri Lab (@roychoudhurilab.bsky.social)AI 评分4242 不同方法学共同指向 PRDX1：肿瘤来源抗氧化剂通过剥夺 T 细胞活性氧抑制免疫
两项采用完全不同方法学的研究共同指向 PRDX1。Julian Lum 团队的 CRISPR 筛选在人类卵巢癌腹水中鉴定出 PRDX1，其缺失可提高 T 细胞内 ROS 并增强 T 细胞功能。相关成果分别发表于 Science 与 bioRxiv。
Bluesky：Roychoudhuri Lab (@roychoudhurilab.bsky.social)AI 评分4444 Julian Lum 团队 CRISPR 筛选发现 PRDX1 缺失增强 T 细胞抗卵巢癌腹水抑制功能
Julian Lum 团队用 CRISPR 筛选鉴定出使 T 细胞对人卵巢癌腹水抑制活性敏感的因子 PRDX1，其缺失可升高细胞内 ROS 并增强 T 细胞功能。
Cell SystemsAI 评分5858 血浆蛋白被整合进与心血管代谢疾病相关的跨组织基因调控网络
Bankier 等利用 STARNET 研究数据开展跨多组织的平行多组学整合分析，显示血浆蛋白是跨组织基因调控网络（GRN）的组成部分。不同 GRN 的蛋白质组特征与心血管代谢结局及风险因素相关。
Bluesky：Andre Rendeiro (@andre-rendeiro.com)AI 评分7272 Rendeiro 实验室发布人体组织衰老单细胞图谱预印本
Rendeiro 实验室在 bioRxiv 发布预印本，以单细胞分辨率绘制人体组织衰老图谱，覆盖 3.5 billion 个细胞、16 个器官、980 名供体，跨越成年生命周期。该工作由 @e-abila 主导，论文链接为 www.biorxiv.org/content/10.6...。
Joe PickrellAI 评分4242 APOE 与其他基因变异对阿尔茨海默病风险的交互作用研究
Joe Pickrell 分享了一项发表在 Nature Genetics 的研究，该研究展示了 APOE 状态与其他遗传变异在阿尔茨海默病风险上的交互作用。
Bluesky：Olivier Neyrolles (@oneyrolles.bsky.social)AI 评分3838 两项研究揭示铜、半胱氨酸与结核分枝杆菌的氧化还原适应
一项发表于 mBio 的研究显示，铜可进入结核分枝杆菌（M. tuberculosis）胞内，并强烈诱导半胱氨酸合酶 CysK2，将铜感应与氧化还原适应及持留状态联系起来。该工作与另一项研究共同构成铜、半胱氨酸与结核分枝杆菌氧化还原适应的完整故事。
Bluesky：Aditya Kunjapur (@kunjapur.bsky.social)AI 评分4242 Science Advances：改造 E. coli 直接利用 PET 解聚产物 BHET/MHET 实现全细胞生物催化
发表于 Science Advances 的研究让 BHET/MHET 直接进入 E. coli，从而将 PET 糖酵解与全细胞生物催化直接耦合。此前用活细胞转化 PET 解聚产物受限于对苯二甲酸（TPA）的摄取，该工作改用胞内羧酸还原路径。
Heidi LedfordAI 评分6060 实验性细胞疗法能否在骨质疏松患者体内重建骨骼
Heidi Ledford 在 X 上转述 Nature 的一篇报道，讨论一项小型早期临床试验：经改造、可靶向骨骼的骨髓细胞是否在骨质疏松患者体内重建了骨骼。报道作者 Elie Dolgin 在文中同时呈现了希望与需要保留的地方，并附有原文链接 https://www.nature.com/articles/d41586-026-02828-3。
Bluesky：Alex Donovan (@apadonovan.bsky.social)AI 评分2020 Tailless/TLX 终止果蝇脑内多个神经干细胞谱系的时间级联
在果蝇中结合遗传操作与染色质结合实验发现，单个转录因子 Tailless/TLX 可终止视叶与中央脑多个神经干细胞谱系的时间级联，提示不同神经谱系的时间程序具有保守终止机制。该研究已正式发表。
Bluesky：Sarah Crome (@sarahcrome.bsky.social)AI 评分4242 人类脾脏先天淋巴细胞的空间与功能特化研究
一项新论文在单细胞和空间分辨率下绘制了人类脾脏 NK 细胞与先天淋巴细胞（ILC）图谱，揭示其空间与功能特化。研究由 Sarah Colpitts 主导，论文题为“Spatial and functional specialization of human splenic innate lymphoid cells”。
Caleb LareauAI 评分5858 MSKCC 团队在 Nature Biomedical Engineering 报告 AI 设计抗肿瘤治疗蛋白的首个进展
Memorial Sloan Kettering 癌症中心（MSKCC）Caleb Lareau 实验室在 Nature Biomedical Engineering 在线发表研究，报告其用 AI 设计新型治疗蛋白、并将其开发为抗肿瘤疗法的第一步。作者称这项工作始于三年前，目标是探索能否借助 AI 获得新的治疗性蛋白，更多细节见 MSKCC 新闻稿链接。
GigaScienceAI 评分2525 仓鸮（Tyto alba）染色体级别、单倍型解析的基因组组装
研究发布了仓鸮（Tyto alba）染色体级别、单倍型解析的基因组组装，采用 trio-binning 策略结合 Illumina 亲本 reads、PacBio HiFi 与 Oxford Nanopore 数据，获得 2 套定相 contig，并借助连锁图挂载为 40 个连锁群。
Stephen Quake精选AI 评分7878 Tabula Sapiens 2.0 在 Cell 上线，细胞数扩至逾 110 万
Tabula Sapiens 2.0 在 Cell 上线，数据集规模翻倍至 28 个组织、逾 110 万个细胞。作者团队还绘制了人类转录因子的表达，并分析了细胞衰老程序，图谱开放获取。
推荐理由：Tabula Sapiens 2.0 把细胞数扩到 110 万并新增转录因子表达与衰老程序分析，做单细胞图谱比较的读者可据此了解数据规模变化。
Arc InstituteAI 评分6262 研究揭示哺乳动物细胞内的支链氨基酸发酵通路
Arc Institute 的 Jain 实验室在小鼠缺氧代谢组中发现，支链氨基酸（BCAA）发酵可作为哺乳动物细胞中不依赖乳酸的替代电子受体途径。研究显示，在缺氧条件下，LDHA 会以催化混杂的方式将支链酮酸还原为支链羟酸（BCHA），小鼠尿液中的 BCHA 水平升高；在人类中，BCHA 在抗阻运动、重症 COVID-19 和饮酒三种状态下升高，主要作为还原应激的生物标志物。
Manolis Kellis精选AI 评分8585 跨物种单细胞图谱绘制人脑纹状体，定位精神疾病遗传风险细胞类型
研究团队发布人脑纹状体跨物种单细胞图谱，覆盖 109 个样本、69 名供体、67 万个细胞核，鉴定出 31 个神经元亚群，其中包括 9 类中型多棘神经元（MSN）。
推荐理由：这份跨物种纹状体图谱把 124 项 GWAS 的遗传风险定位到特定神经元亚群，并显示小鼠与人存在分区差异。
Bluesky：Teif lab (@teiflab.bsky.social)AI 评分5858 AlBawardi 等 2026 预印本：核小体定位不规则驱动晶态到液态转变并调节染色质可及性
AlBawardi 等 2026 年在 bioRxiv 发布预印本，提出核小体定位不规则会驱动染色质从晶态向液态的相变，并调节染色质可及性。作者列出两点：类异染色质序列形成致密纤维；超过 2-3 bp 的定位不规则会触发状态转变。
Biohub精选AI 评分7878 Biohub 用 AI 揭示肿瘤细胞状态异质性，预测联合用药延长 DMG 小鼠生存
Biohub 与哥伦比亚大学等机构合作在 Nature Genetics 发表两篇论文，提出“cancer quantum biology”假说：同类型肿瘤在患者间拥有几乎相同的恶性细胞状态集合，这些状态可相互转换从而逃避单靶点药物。
推荐理由：两篇 Nature Genetics 论文提出肿瘤细胞状态在患者间高度保守，并用 AI 预测针对多状态的联合用药，在 DMG 小鼠模型中延长生存。