跳到正文
10月8日周四
10月6日周二
  1. Nature Biotechnology75

    shotgun 遗传工程实现哺乳动物代谢通路的高通量多重筛选

    研究团队开发 shotgun genetic engineering(SGE),用递送大量带条形码小构建替代单个大构建,让每个细胞携带一条合成通路作为独立实验,再通过测序筛选具有目标表型的细胞。

    推荐理由:用大量带条形码的小构建替代单个大构建,把哺乳动物代谢通路的组合筛选扩展到数百万种,为复杂性状工程提供可迁移策略。

10月5日周一
  1. Wellcome Sanger Institute News62

    Wellcome Sanger 研究所估算未测认知分数,扩大 UK Biobank 认知遗传关联规模

    Wellcome Sanger 研究所、阿姆斯特丹大学医学中心及合作者在 Nature Genetics 发表研究,用健康、行为和社会经济等信息统计估算 UK Biobank 中未完成语言数值推理测试参与者的分数,把分析人数从约 27 万扩大到逾 45.5 万,以减少只分析参试者带来的确定偏倚。

  2. Nature Genetics60

    UK Biobank 插补流体智力评分降低选择偏倚并提升遗传关联分析效力

    研究整合 UK Biobank 中不同流体智力(FI)测量并插补未测个体的 FI,使样本量从约 270,000 增至超过 455,000。作者通过验证显示插补表型在遗传上与实测 FI 相似,但可能仍残留部分非认知信号;合并实测与插补 FI 后,独立显著常见 SNP 关联从 390 增至 550,并降低了 FI 测试参与者平均受教育程度更高带来的选择偏倚。

10月1日周四
9月14日周一
  1. Molecular Systems Biology52

    新计算去卷积方法从批量蛋白质组数据解析芽殖酵母细胞周期蛋白动态

    研究团队开发了一种计算去卷积方法,用于解析细胞周期依赖的蛋白浓度动态,并应用于新的芽殖酵母批量蛋白质组数据。该方法的核心是一个酵母群体模型,用实验获得的细胞周期进程和体积生长数据参数化,以量化采样群体中的失同步程度;作者对 3272 个蛋白做去卷积,用交叉验证确定正则化参数,识别出 539 个具有细胞周期依赖动态的蛋白。

9月10日周四
8月26日周三
  1. Biohub78

    Biohub 用 AI 揭示肿瘤细胞状态异质性,预测联合用药延长 DMG 小鼠生存

    Biohub 与哥伦比亚大学等机构合作在 Nature Genetics 发表两篇论文,提出“cancer quantum biology”假说:同类型肿瘤在患者间拥有几乎相同的恶性细胞状态集合,这些状态可相互转换从而逃避单靶点药物。

    推荐理由:两篇 Nature Genetics 论文提出肿瘤细胞状态在患者间高度保守,并用 AI 预测针对多状态的联合用药,在 DMG 小鼠模型中延长生存。

6月12日周五
  1. Biohub85

    Biohub 与 UC Berkeley 用激光相位板提升冷冻电镜成像对比度

    Biohub 与 UC Berkeley 团队在三篇论文中报告,激光相位板在单激光和双激光(xLPP)两种配置下都能显著提升冷冻电镜图像对比度。单激光版本使分辨率最多提升 44%,双激光版本将铁蛋白 apoferritin 成像到 1.8 埃,并提升了冷冻 E. coli 的对比度。

    推荐理由:三篇论文报告激光相位板在真实冷冻电镜中提升小蛋白成像对比度,为在完整细胞内看清蛋白提供新手段。