Nanopolish 支持 SAM/BAM 碱基修饰标签
Jared Simpson 表示 Nanopolish 现已支持 BonfieldJames 提出的 SAM/BAM 碱基修饰标签，可直接在基因组浏览器中查看 5-mC 等修饰，但所含信息与默认 TSV 略有不同。
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Jared SimpsonAI 评分4242
Matthew StephensAI 评分4242 用NMF改进主题模型拟合
Matthew Stephens 实验室提出用 NMF 改进主题模型拟合，指出两者密切相关但 NMF 更易拟合，相关实现已集成在 fastTopics 中，适合将 NMF 或主题模型应用于单细胞数据的研究者。
Matthew StephensAI 评分5858 Matthew Stephens 实验室发文主张弃用 scRNA-seq 的 dropout 术语
Matthew Stephens 实验室与 Abhishek Sarkar 在 bioRxiv 发布预印本，主张在 scRNA-seq 分析中弃用 dropout 这一术语，认为它带来的混淆多于它解决的问题。作者在帖中未展开具体论证与数据，仅给出预印本链接并附 #dropthedropout 话题标签。
Jared SimpsonAI 评分6060 Nanopolish v0.12 发布，支持测序运行中实时甲基化检测
Nanopolish v0.12 支持在测序仪运行过程中实时进行甲基化检测。作者 Jared Simpson 表示这次更新值得重新启用旧博客来介绍，并给出了博客文章地址。
Jared SimpsonAI 评分4242 Jordi Silvestre-Ryan 与 Ian Holmes 纳米孔双读段解码预印本
Jared Simpson 分享并推荐了 Jordi Silvestre-Ryan 与 Ian Holmes 在 bioRxiv 上的一篇新预印本，主题是纳米孔双读段的解码。
Jared SimpsonAI 评分2222 Jared Simpson 发布按 read 名查询 BAM 的小工具 bri
Jared Simpson 写了一个小工具 bri，可按 read 名查询 BAM 文件，他认为可能对部分长读长工作有用，并欢迎反馈和 bug 报告。
Matthew StephensAI 评分2222 workflowr 助实验室实现可重复研究
Matthew Stephens 推荐了 John Blischak 开发的 workflowr 工具，称其帮助实验室成员开展更可重复、更有条理的研究。该工具已发布 1.5.0 版，新增 wflow_quickstart() 函数、自定义行为选项、教学用 workshop 教程，并支持隐藏 HTML 报告。
Jared SimpsonAI 评分5858 nanopolish 发布支持 R10 数据的预发布版本，可检测 CpG 甲基化
Jared Simpson 推送了 nanopolish 的预发布版本，该版本支持 R10 数据，并包含 CpG 甲基化检测功能，代码位于 GitHub 的 r10 分支。作者同时感谢上周提供 R10 数据的用户。
Ed BoydenAI 评分4242 SomArchon 电压指示质粒上线 Addgene
Ed Boyden 表示，编码体细胞靶向荧光电压指示器 SomArchon 的质粒已开始在 Addgene 上提供分发，后续还会有更多。
Ed BoydenAI 评分2222 植物组织膨胀显微术预印本问世
Ed Boyden 对 Gregor Mendel 研究所 Nodine 实验室在 bioRxiv 发布的植物组织膨胀显微术（expansion microscopy）预印本表示关注。